More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0775 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0775  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 		 497 aa  981    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.485892  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3716  NADH dehydrogenase (quinone)  47.55 
 
 		 476 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0275464  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3799  NADH dehydrogenase (quinone)  47.55 
 
 		 476 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.495272  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3658  NADH dehydrogenase (quinone)  47.32 
 
 		 476 aa  333  3e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0339  NADH dehydrogenase (quinone)  43.76 
 
 		 477 aa  333  4e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.466096  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2598  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  44.02 
 
 		 478 aa  333  6e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3189  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  42.48 
 
 		 477 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.176155  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1072  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  42.28 
 
 		 477 aa  326  7e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.41725e-34 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0889  NADH dehydrogenase (quinone)  45.29 
 
 		 477 aa  324  2e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0742  NAD-dependent dehydrogenase subunit  46.68 
 
 		 478 aa  319  7.999999999999999e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3784  NADH dehydrogenase (quinone)  47.68 
 
 		 477 aa  306  6e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.688785  normal  0.510826 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0372  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  44.18 
 
 		 477 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2555  NADH dehydrogenase (quinone)  44.49 
 
 		 479 aa  297  3e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1688  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  41.12 
 
 		 495 aa  293  6e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.565022  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1304  NADH dehydrogenase (quinone)  36.71 
 
 		 480 aa  273  5.000000000000001e-72  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4571  hydrogenase 4 subunit F  37.42 
 
 		 512 aa  273  6e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2188  hydrogenase 4 subunit F  38.77 
 
 		 495 aa  268  2e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.593328 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0794  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  39.35 
 
 		 489 aa  266  5e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0940  NADH dehydrogenase (quinone)  33 
 
 		 470 aa  266  7e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0548909  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4285  NADH dehydrogenase (quinone)  40.31 
 
 		 499 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.14859  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0700  NADH dehydrogenase (quinone)  37.71 
 
 		 484 aa  261  2e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.452975  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00980  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  34.39 
 
 		 533 aa  256  8e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.558351  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1139  hydrogenase 4 subunit F  38.6 
 
 		 488 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0485021  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1038  hydrogenase-4 component F  34.09 
 
 		 491 aa  251  2e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000418597  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2620  hydrogenase 4 subunit F  41.51 
 
 		 526 aa  248  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1190  hydrogenase 4 subunit F  41.51 
 
 		 526 aa  248  2e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.647759 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02378  NADH dehydrogenase subunit N  41.51 
 
 		 526 aa  247  4e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1183  NADH dehydrogenase (quinone)  41.51 
 
 		 526 aa  247  4e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02340  hypothetical protein  41.51 
 
 		 526 aa  247  4e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3708  hydrogenase 4 subunit F  41.51 
 
 		 521 aa  247  4e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.332962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0176  hydrogenase 4 subunit F  38.04 
 
 		 486 aa  247  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.399009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2633  hydrogenase 4 subunit F  41.51 
 
 		 526 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1911  hypothetical protein  33.63 
 
 		 493 aa  246  6e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.262508  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6068  hydrogenase 4 subunit F  36.97 
 
 		 486 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0822285  hitchhiker  0.00325517 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4668  hydrogenase 4 subunit F  38.74 
 
 		 484 aa  242  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.423781  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0128  hydrogenase-4 component F  34.15 
 
 		 491 aa  242  1e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.223921  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1281  hydrogenase 4 subunit F  39 
 
 		 538 aa  241  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0834276  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2459  NADH dehydrogenase (quinone)  37.27 
 
 		 480 aa  241  2.9999999999999997e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.38611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2712  hydrogenase 4 subunit F  38.37 
 
 		 553 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3289  hydrogenase 4 subunit F  36.51 
 
 		 484 aa  238  2e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.612532  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0326  hydrogenase 4 subunit F  38.75 
 
 		 486 aa  237  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2858  hydrogenase 4 subunit F  40.99 
 
 		 517 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1264  hydrogenase 4 subunit F  38.17 
 
 		 463 aa  236  7e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218764  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2621  NADH dehydrogenase (quinone)  39.39 
 
 		 478 aa  236  8e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.773397  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1529  hydrogenase 4 subunit F  37.95 
 
 		 486 aa  232  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0108  hydrogenase 4 subunit F  37.95 
 
 		 486 aa  232  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1614  hydrogenase 4 subunit F  37.95 
 
 		 486 aa  232  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1865  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  34.85 
 
 		 489 aa  231  3e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0185  NADH dehydrogenase (quinone)  34.81 
 
 		 491 aa  231  3e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0919  hydrogenase 4 subunit F  37.1 
 
 		 487 aa  229  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0605  NADH dehydrogenase (quinone)  37.26 
 
 		 506 aa  228  2e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2463  NADH dehydrogenase (quinone)  38.15 
 
 		 493 aa  227  3e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.873938  normal  0.528975 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2477  hydrogenase 4 subunit F  34.85 
 
 		 481 aa  219  1e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.638656 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1263  hydrogenase 4 subunit F  35.54 
 
 		 483 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0336263 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0169  hydrogenase 4 subunit F  36.08 
 
 		 486 aa  217  4e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.20751  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3431  hypothetical protein  40.75 
 
 		 483 aa  216  5.9999999999999996e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.677661  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3216  Hydrogenase 4 membrane component (E)  40.75 
 
 		 483 aa  216  5.9999999999999996e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.492531  normal  0.0423716 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0932  hydrogenase 4 subunit F  38.66 
 
 		 483 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.187708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1810  hydrogenase 4 subunit F  39.7 
 
 		 484 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.727571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3852  hydrogenase 4 subunit F  36.14 
 
 		 483 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0294681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2152  hydrogenase 4 subunit F  39.7 
 
 		 484 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.915264  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1399  hydrogenase 4 subunit F  36 
 
 		 482 aa  214  3.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1791  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  35.75 
 
 		 492 aa  212  1e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0374875  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2988  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  39.45 
 
 		 537 aa  189  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0307877  hitchhiker  0.00569852 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4466  NADH dehydrogenase (quinone)  36.67 
 
 		 428 aa  188  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10087  hydrogenase hycQ  35.94 
 
 		 488 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000498381  normal  0.186315 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0320  NADH dehydrogenase (quinone)  34.65 
 
 		 531 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0729  NADH dehydrogenase (quinone)  32.02 
 
 		 512 aa  174  3.9999999999999995e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0359188  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1994  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.33 
 
 		 440 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1428  hydrogenase 4 subunit F  32.2 
 
 		 431 aa  158  2e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.289915  normal  0.541686 
 
 
-
 
NC_002936  DET1572  hydrogenase membrane subunit  30.8 
 
 		 460 aa  149  9e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4706  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  44.09 
 
 		 572 aa  147  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1450  hydrogenase subunit, NADH dehydrogenase subunit N-like protein  30.8 
 
 		 499 aa  145  1e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1819  hydrogenase membrane subunit  33.81 
 
 		 489 aa  145  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00530932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1124  hydrogenase membrane subunit  29.06 
 
 		 494 aa  143  7e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.113605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3279  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  29.77 
 
 		 480 aa  143  9e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.621261  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1880  NADH dehydrogenase (quinone)  31.2 
 
 		 1245 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.374238  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0703  NADH dehydrogenase (quinone)  29.51 
 
 		 662 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.20305  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1318  hydrogenase membrane subunit  30.63 
 
 		 493 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1142  hydrogenase 4 subunit B  32.61 
 
 		 748 aa  139  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.239539  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0776  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  28.05 
 
 		 448 aa  139  1e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.986701  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3194  NADH dehydrogenase (quinone)  29.44 
 
 		 1264 aa  139  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.466435 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4575  hydrogenase 4 subunit B  30.27 
 
 		 671 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4506  NADH dehydrogenase (quinone)  30.48 
 
 		 1265 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.105233 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2191  hydrogenase 4 subunit B  30.75 
 
 		 673 aa  133  6.999999999999999e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00940  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  28.37 
 
 		 672 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0135  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  32.96 
 
 		 513 aa  131  3e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.501467  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0132  hydrogenase 4 membrane subunit  27.84 
 
 		 650 aa  131  3e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.167866  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1420  NADH dehydrogenase (quinone)  31.5 
 
 		 1265 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1791  ATP-binding protein  29.84 
 
 		 655 aa  129  9.000000000000001e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0608774  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1914  L-alanyl-D-glutamate peptidase  28.26 
 
 		 655 aa  126  8.000000000000001e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0188  NADH dehydrogenase (quinone)  31.58 
 
 		 737 aa  124  3e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2616  NADH dehydrogenase (quinone)  30.36 
 
 		 577 aa  124  4e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0916  hydrogenase 4 subunit B  31.35 
 
 		 674 aa  124  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3530  NADH dehydrogenase (quinone)  29.92 
 
 		 470 aa  123  6e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2456  NADH dehydrogenase (quinone)  30.56 
 
 		 662 aa  123  6e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0192367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0969  NADH dehydrogenase (quinone)  29.54 
 
 		 1253 aa  123  8e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0218073 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0107  NADH dehydrogenase (quinone)  27.31 
 
 		 500 aa  123  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000249004 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1127  hydrogenase membrane subunit  29.22 
 
 		 649 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0224903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3712  NADH dehydrogenase (quinone)  33.76 
 
 		 666 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.753561  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>