More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2621 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2621  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 		 478 aa  935    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.773397  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2459  NADH dehydrogenase (quinone)  65 
 
 		 480 aa  607  9.999999999999999e-173  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.38611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3716  NADH dehydrogenase (quinone)  50 
 
 		 476 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0275464  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3799  NADH dehydrogenase (quinone)  50 
 
 		 476 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.495272  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3658  NADH dehydrogenase (quinone)  50.22 
 
 		 476 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1072  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  45.48 
 
 		 477 aa  351  2e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.41725e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3189  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  45.24 
 
 		 477 aa  345  8.999999999999999e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.176155  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0889  NADH dehydrogenase (quinone)  42.56 
 
 		 477 aa  344  2.9999999999999997e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3784  NADH dehydrogenase (quinone)  47.54 
 
 		 477 aa  341  1e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.688785  normal  0.510826 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0339  NADH dehydrogenase (quinone)  44.2 
 
 		 477 aa  335  1e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.466096  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0742  NAD-dependent dehydrogenase subunit  43.19 
 
 		 478 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2598  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  41.46 
 
 		 478 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2555  NADH dehydrogenase (quinone)  43.81 
 
 		 479 aa  302  7.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0372  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  42.7 
 
 		 477 aa  288  1e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0940  NADH dehydrogenase (quinone)  33.77 
 
 		 470 aa  256  6e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0548909  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1304  NADH dehydrogenase (quinone)  33.78 
 
 		 480 aa  239  8e-62  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0775  NADH dehydrogenase (quinone)  38.66 
 
 		 497 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.485892  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1139  hydrogenase 4 subunit F  38.23 
 
 		 488 aa  225  2e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0485021  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1688  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  33.57 
 
 		 495 aa  220  3.9999999999999997e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.565022  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0185  NADH dehydrogenase (quinone)  36.34 
 
 		 491 aa  216  5e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0700  NADH dehydrogenase (quinone)  32.47 
 
 		 484 aa  208  2e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.452975  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0605  NADH dehydrogenase (quinone)  34.92 
 
 		 506 aa  207  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4668  hydrogenase 4 subunit F  35.9 
 
 		 484 aa  207  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.423781  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6068  hydrogenase 4 subunit F  34.81 
 
 		 486 aa  206  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0822285  hitchhiker  0.00325517 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0919  hydrogenase 4 subunit F  35.38 
 
 		 487 aa  203  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0176  hydrogenase 4 subunit F  36.91 
 
 		 486 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.399009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3289  hydrogenase 4 subunit F  33.02 
 
 		 484 aa  201  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.612532  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0932  hydrogenase 4 subunit F  34.06 
 
 		 483 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.187708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1190  hydrogenase 4 subunit F  33.94 
 
 		 526 aa  199  7e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.647759 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2620  hydrogenase 4 subunit F  33.94 
 
 		 526 aa  199  7e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0326  hydrogenase 4 subunit F  39.16 
 
 		 486 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02378  NADH dehydrogenase subunit N  33.71 
 
 		 526 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1183  NADH dehydrogenase (quinone)  33.71 
 
 		 526 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3708  hydrogenase 4 subunit F  33.49 
 
 		 521 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.332962  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02340  hypothetical protein  33.71 
 
 		 526 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2633  hydrogenase 4 subunit F  33.71 
 
 		 526 aa  197  3e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0108  hydrogenase 4 subunit F  36.88 
 
 		 486 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1263  hydrogenase 4 subunit F  36.36 
 
 		 483 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0336263 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1529  hydrogenase 4 subunit F  36.88 
 
 		 486 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1614  hydrogenase 4 subunit F  36.88 
 
 		 486 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1264  hydrogenase 4 subunit F  36.1 
 
 		 463 aa  194  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218764  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1399  hydrogenase 4 subunit F  39.5 
 
 		 482 aa  192  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2858  hydrogenase 4 subunit F  35.77 
 
 		 517 aa  191  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3852  hydrogenase 4 subunit F  38.43 
 
 		 483 aa  192  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0294681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0794  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  34.8 
 
 		 489 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4466  NADH dehydrogenase (quinone)  36.41 
 
 		 428 aa  188  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1810  hydrogenase 4 subunit F  37.04 
 
 		 484 aa  187  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.727571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2152  hydrogenase 4 subunit F  37.04 
 
 		 484 aa  187  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.915264  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1791  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.52 
 
 		 492 aa  187  3e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0374875  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2463  NADH dehydrogenase (quinone)  34.58 
 
 		 493 aa  187  4e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.873938  normal  0.528975 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2188  hydrogenase 4 subunit F  32.63 
 
 		 495 aa  187  5e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.593328 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2712  hydrogenase 4 subunit F  32.26 
 
 		 553 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2477  hydrogenase 4 subunit F  35.16 
 
 		 481 aa  184  3e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.638656 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1281  hydrogenase 4 subunit F  32.15 
 
 		 538 aa  184  3e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0834276  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0169  hydrogenase 4 subunit F  33.86 
 
 		 486 aa  183  6e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.20751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0128  hydrogenase-4 component F  31.3 
 
 		 491 aa  183  7e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.223921  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2988  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  41.44 
 
 		 537 aa  183  8.000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0307877  hitchhiker  0.00569852 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00980  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  29.41 
 
 		 533 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.558351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0729  NADH dehydrogenase (quinone)  33.2 
 
 		 512 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0359188  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3216  Hydrogenase 4 membrane component (E)  39.68 
 
 		 483 aa  179  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.492531  normal  0.0423716 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3431  hypothetical protein  39.68 
 
 		 483 aa  179  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.677661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1865  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.3 
 
 		 489 aa  179  1e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4571  hydrogenase 4 subunit F  29.65 
 
 		 512 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4285  NADH dehydrogenase (quinone)  35.25 
 
 		 499 aa  176  6e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.14859  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1038  hydrogenase-4 component F  30.14 
 
 		 491 aa  176  8e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000418597  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1911  hypothetical protein  30.6 
 
 		 493 aa  175  1.9999999999999998e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.262508  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10087  hydrogenase hycQ  34.99 
 
 		 488 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000498381  normal  0.186315 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4706  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  39.94 
 
 		 572 aa  150  6e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1572  hydrogenase membrane subunit  28.64 
 
 		 460 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0320  NADH dehydrogenase (quinone)  30.22 
 
 		 531 aa  143  7e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1450  hydrogenase subunit, NADH dehydrogenase subunit N-like protein  28.1 
 
 		 499 aa  142  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1318  hydrogenase membrane subunit  27.9 
 
 		 493 aa  137  6.0000000000000005e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3279  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  28.37 
 
 		 480 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.621261  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1136  NADH dehydrogenase (quinone)  26.05 
 
 		 476 aa  132  1.0000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0589  NADH dehydrogenase (quinone)  30.71 
 
 		 473 aa  130  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3530  NADH dehydrogenase (quinone)  32.35 
 
 		 470 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0776  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  28.22 
 
 		 448 aa  127  5e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.986701  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1124  hydrogenase membrane subunit  26.06 
 
 		 494 aa  125  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.113605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4506  NADH dehydrogenase (quinone)  29.18 
 
 		 1265 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.105233 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2161  NADH dehydrogenase (quinone)  31.12 
 
 		 501 aa  124  4e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0929  hydrogenase 4 subunit B  32.85 
 
 		 687 aa  123  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2967  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30 
 
 		 501 aa  121  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37012 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1880  NADH dehydrogenase (quinone)  30.65 
 
 		 1245 aa  120  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.374238  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0132  hydrogenase 4 membrane subunit  27.83 
 
 		 650 aa  119  7.999999999999999e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.167866  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2191  hydrogenase 4 subunit B  30.06 
 
 		 673 aa  118  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0703  NADH dehydrogenase (quinone)  30.51 
 
 		 662 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.20305  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3194  NADH dehydrogenase (quinone)  32.01 
 
 		 1264 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.466435 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1819  hydrogenase membrane subunit  25.21 
 
 		 489 aa  117  5e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00530932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3855  hydrogenase 4 subunit B  31.84 
 
 		 672 aa  117  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1453  hydrogenase subunit, HycC-like protein  30.38 
 
 		 644 aa  117  6e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1428  hydrogenase 4 subunit F  26.89 
 
 		 431 aa  116  6.9999999999999995e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.289915  normal  0.541686 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1420  NADH dehydrogenase (quinone)  29.13 
 
 		 1265 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3655  NADH dehydrogenase (quinone)  37 
 
 		 654 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0270969  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4575  hydrogenase 4 subunit B  30.66 
 
 		 671 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0588  NADH dehydrogenase (quinone)  28.25 
 
 		 609 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2246  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  29.63 
 
 		 660 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00025541 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2619  NADH-quinone oxidoreductase, L subunit  29.63 
 
 		 654 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0791  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  29.13 
 
 		 661 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1914  L-alanyl-D-glutamate peptidase  27.9 
 
 		 655 aa  114  3e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1575  hydrogenase membrane subunit  30.41 
 
 		 617 aa  113  6e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>