More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0794 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_0794  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  100 
 
 		 489 aa  964    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2188  hydrogenase 4 subunit F  42.83 
 
 		 495 aa  376  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.593328 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4285  NADH dehydrogenase (quinone)  44.49 
 
 		 499 aa  373  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.14859  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3708  hydrogenase 4 subunit F  41.9 
 
 		 521 aa  354  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.332962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1688  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  40 
 
 		 495 aa  353  4e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.565022  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1190  hydrogenase 4 subunit F  41.44 
 
 		 526 aa  350  3e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.647759 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2620  hydrogenase 4 subunit F  41.44 
 
 		 526 aa  350  3e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02378  NADH dehydrogenase subunit N  41.44 
 
 		 526 aa  350  5e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1183  NADH dehydrogenase (quinone)  41.44 
 
 		 526 aa  350  5e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02340  hypothetical protein  41.44 
 
 		 526 aa  350  5e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2633  hydrogenase 4 subunit F  42.13 
 
 		 526 aa  347  2e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4571  hydrogenase 4 subunit F  41.41 
 
 		 512 aa  342  8e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2858  hydrogenase 4 subunit F  41.2 
 
 		 517 aa  341  2e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2712  hydrogenase 4 subunit F  42.35 
 
 		 553 aa  338  9.999999999999999e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1281  hydrogenase 4 subunit F  43.81 
 
 		 538 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0834276  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2463  NADH dehydrogenase (quinone)  46.32 
 
 		 493 aa  335  2e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.873938  normal  0.528975 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1304  NADH dehydrogenase (quinone)  40.23 
 
 		 480 aa  313  3.9999999999999997e-84  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0700  NADH dehydrogenase (quinone)  38.62 
 
 		 484 aa  305  8.000000000000001e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.452975  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00980  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  36.27 
 
 		 533 aa  300  5e-80  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.558351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4668  hydrogenase 4 subunit F  36.48 
 
 		 484 aa  296  5e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.423781  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1139  hydrogenase 4 subunit F  39.11 
 
 		 488 aa  291  2e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0485021  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1911  hypothetical protein  34.8 
 
 		 493 aa  290  3e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.262508  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0919  hydrogenase 4 subunit F  36.07 
 
 		 487 aa  289  9e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0932  hydrogenase 4 subunit F  39.57 
 
 		 483 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.187708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6068  hydrogenase 4 subunit F  37.53 
 
 		 486 aa  287  4e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0822285  hitchhiker  0.00325517 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1038  hydrogenase-4 component F  35.84 
 
 		 491 aa  285  1.0000000000000001e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000418597  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3289  hydrogenase 4 subunit F  35.65 
 
 		 484 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.612532  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0176  hydrogenase 4 subunit F  38.83 
 
 		 486 aa  281  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.399009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0326  hydrogenase 4 subunit F  38.13 
 
 		 486 aa  280  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0185  NADH dehydrogenase (quinone)  35.81 
 
 		 491 aa  276  5e-73  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1264  hydrogenase 4 subunit F  38.99 
 
 		 463 aa  276  6e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218764  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1791  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  38.05 
 
 		 492 aa  275  2.0000000000000002e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0374875  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1614  hydrogenase 4 subunit F  38.73 
 
 		 486 aa  274  3e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1529  hydrogenase 4 subunit F  38.73 
 
 		 486 aa  274  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0108  hydrogenase 4 subunit F  38.73 
 
 		 486 aa  274  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1865  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  34.43 
 
 		 489 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1263  hydrogenase 4 subunit F  36.06 
 
 		 483 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0336263 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3852  hydrogenase 4 subunit F  39.77 
 
 		 483 aa  270  5e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0294681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0128  hydrogenase-4 component F  37.65 
 
 		 491 aa  268  2e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.223921  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0775  NADH dehydrogenase (quinone)  39.55 
 
 		 497 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.485892  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2477  hydrogenase 4 subunit F  36.49 
 
 		 481 aa  266  4e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.638656 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0605  NADH dehydrogenase (quinone)  37.55 
 
 		 506 aa  264  2e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0169  hydrogenase 4 subunit F  38.64 
 
 		 486 aa  264  3e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.20751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1072  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  36.04 
 
 		 477 aa  262  8.999999999999999e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.41725e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3189  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  36.43 
 
 		 477 aa  261  2e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.176155  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0889  NADH dehydrogenase (quinone)  38.41 
 
 		 477 aa  260  4e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2152  hydrogenase 4 subunit F  43.63 
 
 		 484 aa  258  1e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.915264  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1810  hydrogenase 4 subunit F  43.63 
 
 		 484 aa  258  1e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.727571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1399  hydrogenase 4 subunit F  38.62 
 
 		 482 aa  258  2e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0940  NADH dehydrogenase (quinone)  39.46 
 
 		 470 aa  256  7e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0548909  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3658  NADH dehydrogenase (quinone)  39.89 
 
 		 476 aa  253  7e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3716  NADH dehydrogenase (quinone)  39.62 
 
 		 476 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0275464  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3799  NADH dehydrogenase (quinone)  39.62 
 
 		 476 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.495272  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10087  hydrogenase hycQ  39.3 
 
 		 488 aa  248  2e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000498381  normal  0.186315 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0320  NADH dehydrogenase (quinone)  36.96 
 
 		 531 aa  243  5e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3216  Hydrogenase 4 membrane component (E)  40.05 
 
 		 483 aa  243  7e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.492531  normal  0.0423716 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3431  hypothetical protein  40.05 
 
 		 483 aa  243  7e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.677661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4466  NADH dehydrogenase (quinone)  38.9 
 
 		 428 aa  243  7.999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0339  NADH dehydrogenase (quinone)  39.05 
 
 		 477 aa  242  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.466096  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2988  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  40.8 
 
 		 537 aa  240  5e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0307877  hitchhiker  0.00569852 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0742  NAD-dependent dehydrogenase subunit  37.56 
 
 		 478 aa  238  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0729  NADH dehydrogenase (quinone)  35 
 
 		 512 aa  238  2e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0359188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0372  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  34.9 
 
 		 477 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2598  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  38.14 
 
 		 478 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3784  NADH dehydrogenase (quinone)  38.87 
 
 		 477 aa  220  5e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.688785  normal  0.510826 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2555  NADH dehydrogenase (quinone)  41.62 
 
 		 479 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4706  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  44.8 
 
 		 572 aa  211  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2621  NADH dehydrogenase (quinone)  35.03 
 
 		 478 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.773397  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1994  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  33.57 
 
 		 440 aa  197  3e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1124  hydrogenase membrane subunit  32.98 
 
 		 494 aa  197  4.0000000000000005e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.113605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2459  NADH dehydrogenase (quinone)  31.21 
 
 		 480 aa  196  9e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.38611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1450  hydrogenase subunit, NADH dehydrogenase subunit N-like protein  35.26 
 
 		 499 aa  196  1e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1819  hydrogenase membrane subunit  34.18 
 
 		 489 aa  196  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00530932  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1572  hydrogenase membrane subunit  34.68 
 
 		 460 aa  192  1e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1318  hydrogenase membrane subunit  34.39 
 
 		 493 aa  190  4e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1428  hydrogenase 4 subunit F  33.76 
 
 		 431 aa  182  1e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.289915  normal  0.541686 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4575  hydrogenase 4 subunit B  35.43 
 
 		 671 aa  177  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0703  NADH dehydrogenase (quinone)  34.58 
 
 		 662 aa  176  7e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.20305  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0132  hydrogenase 4 membrane subunit  31.53 
 
 		 650 aa  173  5.999999999999999e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.167866  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0070  NADH dehydrogenase (quinone)  34.54 
 
 		 667 aa  172  9e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0188  NADH dehydrogenase (quinone)  34.46 
 
 		 737 aa  172  1e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0107  NADH dehydrogenase (quinone)  33.84 
 
 		 500 aa  170  6e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000249004 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3712  NADH dehydrogenase (quinone)  38.4 
 
 		 666 aa  169  8e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.753561  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0135  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.99 
 
 		 513 aa  168  2e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.501467  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3795  NADH dehydrogenase (quinone)  38.11 
 
 		 666 aa  167  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.789396  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1142  hydrogenase 4 subunit B  34.46 
 
 		 748 aa  166  8e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.239539  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00940  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  32.94 
 
 		 672 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4066  NADH dehydrogenase (quinone)  34.31 
 
 		 669 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0619804  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0508  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  30.68 
 
 		 499 aa  164  4.0000000000000004e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000163951  hitchhiker  0.000000287422 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1822  hydrogenase membrane subunit  34.09 
 
 		 643 aa  163  8.000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0165692  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0734  NAD-dependent dehydrogenase subunit  33.07 
 
 		 668 aa  162  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0393018  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1127  hydrogenase membrane subunit  34.64 
 
 		 649 aa  161  2e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0224903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2191  hydrogenase 4 subunit B  33.81 
 
 		 673 aa  161  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3194  NADH dehydrogenase (quinone)  33.07 
 
 		 1264 aa  161  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.466435 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0776  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  33.9 
 
 		 448 aa  161  3e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.986701  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2629  hydrogenase 4 subunit B  32.95 
 
 		 672 aa  160  6e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0943  NADH dehydrogenase (quinone)  35.79 
 
 		 723 aa  160  6e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.730208  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1194  hydrogenase 4 subunit B  32.95 
 
 		 672 aa  159  8e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1914  L-alanyl-D-glutamate peptidase  31.49 
 
 		 655 aa  159  9e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02374  NADH dehydrogenase subunit N  32.66 
 
 		 672 aa  159  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>