More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_00980 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_00980  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  100 
 
 		 533 aa  1065    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.558351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4571  hydrogenase 4 subunit F  56.7 
 
 		 512 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02378  NADH dehydrogenase subunit N  52 
 
 		 526 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1183  NADH dehydrogenase (quinone)  52 
 
 		 526 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2620  hydrogenase 4 subunit F  52 
 
 		 526 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02340  hypothetical protein  52 
 
 		 526 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1190  hydrogenase 4 subunit F  52 
 
 		 526 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.647759 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3708  hydrogenase 4 subunit F  51.58 
 
 		 521 aa  465  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.332962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2633  hydrogenase 4 subunit F  51.04 
 
 		 526 aa  464  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1281  hydrogenase 4 subunit F  50 
 
 		 538 aa  458  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0834276  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2712  hydrogenase 4 subunit F  51.22 
 
 		 553 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2858  hydrogenase 4 subunit F  50.53 
 
 		 517 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2188  hydrogenase 4 subunit F  47.35 
 
 		 495 aa  426  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.593328 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1038  hydrogenase-4 component F  42.33 
 
 		 491 aa  355  2e-96  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000418597  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1911  hypothetical protein  40.58 
 
 		 493 aa  342  1e-92  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.262508  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1865  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  36.22 
 
 		 489 aa  331  3e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0128  hydrogenase-4 component F  39.37 
 
 		 491 aa  328  1.0000000000000001e-88  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.223921  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0185  NADH dehydrogenase (quinone)  37.63 
 
 		 491 aa  301  1e-80  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1304  NADH dehydrogenase (quinone)  37.26 
 
 		 480 aa  299  8e-80  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4285  NADH dehydrogenase (quinone)  38.46 
 
 		 499 aa  289  8e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.14859  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1688  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  35.98 
 
 		 495 aa  289  1e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.565022  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2463  NADH dehydrogenase (quinone)  39.11 
 
 		 493 aa  288  2e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.873938  normal  0.528975 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4668  hydrogenase 4 subunit F  36.29 
 
 		 484 aa  286  5e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.423781  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0919  hydrogenase 4 subunit F  36.27 
 
 		 487 aa  286  9e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0794  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  37.39 
 
 		 489 aa  277  4e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1264  hydrogenase 4 subunit F  36.26 
 
 		 463 aa  276  7e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218764  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1529  hydrogenase 4 subunit F  36.72 
 
 		 486 aa  276  9e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0108  hydrogenase 4 subunit F  36.72 
 
 		 486 aa  276  9e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1614  hydrogenase 4 subunit F  36.72 
 
 		 486 aa  276  9e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1139  hydrogenase 4 subunit F  36.15 
 
 		 488 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0485021  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6068  hydrogenase 4 subunit F  35.79 
 
 		 486 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0822285  hitchhiker  0.00325517 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0326  hydrogenase 4 subunit F  34.8 
 
 		 486 aa  274  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1263  hydrogenase 4 subunit F  33.54 
 
 		 483 aa  270  4e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0336263 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3289  hydrogenase 4 subunit F  35.07 
 
 		 484 aa  270  5e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.612532  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0176  hydrogenase 4 subunit F  36.52 
 
 		 486 aa  270  5e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.399009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3852  hydrogenase 4 subunit F  33.47 
 
 		 483 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0294681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0700  NADH dehydrogenase (quinone)  34.91 
 
 		 484 aa  261  2e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.452975  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0932  hydrogenase 4 subunit F  37.29 
 
 		 483 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.187708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1399  hydrogenase 4 subunit F  38.82 
 
 		 482 aa  253  6e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0169  hydrogenase 4 subunit F  34.05 
 
 		 486 aa  250  5e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.20751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2477  hydrogenase 4 subunit F  35.25 
 
 		 481 aa  248  2e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.638656 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0775  NADH dehydrogenase (quinone)  34.39 
 
 		 497 aa  240  5e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.485892  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0940  NADH dehydrogenase (quinone)  33.25 
 
 		 470 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0548909  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2988  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  36.51 
 
 		 537 aa  231  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0307877  hitchhiker  0.00569852 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0339  NADH dehydrogenase (quinone)  34.86 
 
 		 477 aa  231  3e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.466096  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1810  hydrogenase 4 subunit F  32.84 
 
 		 484 aa  230  4e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.727571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2152  hydrogenase 4 subunit F  32.84 
 
 		 484 aa  230  4e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.915264  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0320  NADH dehydrogenase (quinone)  37.03 
 
 		 531 aa  228  2e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0889  NADH dehydrogenase (quinone)  31.77 
 
 		 477 aa  227  5.0000000000000005e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1791  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  34.88 
 
 		 492 aa  217  5e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0374875  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0605  NADH dehydrogenase (quinone)  34.62 
 
 		 506 aa  216  7e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0729  NADH dehydrogenase (quinone)  34.75 
 
 		 512 aa  216  7e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0359188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10087  hydrogenase hycQ  37.13 
 
 		 488 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000498381  normal  0.186315 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0742  NAD-dependent dehydrogenase subunit  32.95 
 
 		 478 aa  207  4e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1072  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.02 
 
 		 477 aa  207  4e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.41725e-34 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4466  NADH dehydrogenase (quinone)  38.26 
 
 		 428 aa  206  6e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3189  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.02 
 
 		 477 aa  206  7e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.176155  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0372  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.48 
 
 		 477 aa  206  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2598  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.21 
 
 		 478 aa  205  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2555  NADH dehydrogenase (quinone)  32.02 
 
 		 479 aa  194  4e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3658  NADH dehydrogenase (quinone)  32.38 
 
 		 476 aa  186  6e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3799  NADH dehydrogenase (quinone)  32.38 
 
 		 476 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.495272  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3716  NADH dehydrogenase (quinone)  32.38 
 
 		 476 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0275464  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1994  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.7 
 
 		 440 aa  183  6e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3431  hypothetical protein  33.43 
 
 		 483 aa  182  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.677661  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3216  Hydrogenase 4 membrane component (E)  33.43 
 
 		 483 aa  182  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.492531  normal  0.0423716 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3784  NADH dehydrogenase (quinone)  32.29 
 
 		 477 aa  176  9e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.688785  normal  0.510826 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4706  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  37.93 
 
 		 572 aa  173  7.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2621  NADH dehydrogenase (quinone)  29.91 
 
 		 478 aa  173  9e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.773397  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0703  NADH dehydrogenase (quinone)  33.81 
 
 		 662 aa  171  4e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.20305  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1428  hydrogenase 4 subunit F  31.47 
 
 		 431 aa  169  1e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.289915  normal  0.541686 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2456  NADH dehydrogenase (quinone)  33.05 
 
 		 662 aa  167  5e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0192367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2967  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.46 
 
 		 501 aa  164  5.0000000000000005e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37012 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1791  ATP-binding protein  34.1 
 
 		 655 aa  164  5.0000000000000005e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0608774  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4575  hydrogenase 4 subunit B  32.28 
 
 		 671 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1420  NADH dehydrogenase (quinone)  31.18 
 
 		 1265 aa  161  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0776  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  29.77 
 
 		 448 aa  160  6e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.986701  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3795  NADH dehydrogenase (quinone)  34.45 
 
 		 666 aa  160  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.789396  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3712  NADH dehydrogenase (quinone)  34.17 
 
 		 666 aa  160  7e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.753561  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0135  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  28.79 
 
 		 513 aa  159  1e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.501467  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1914  L-alanyl-D-glutamate peptidase  30.11 
 
 		 655 aa  159  1e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4506  NADH dehydrogenase (quinone)  30.98 
 
 		 1265 aa  158  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.105233 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1321  hydrogenase membrane subunit  30.93 
 
 		 644 aa  157  6e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1450  hydrogenase subunit, NADH dehydrogenase subunit N-like protein  30.06 
 
 		 499 aa  157  6e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2616  NADH dehydrogenase (quinone)  33.9 
 
 		 577 aa  155  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1572  hydrogenase membrane subunit  29.01 
 
 		 460 aa  153  7e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3654  NADH dehydrogenase (quinone)  34.38 
 
 		 665 aa  153  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1453  hydrogenase subunit, HycC-like protein  30.39 
 
 		 644 aa  152  2e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0509  NADH dehydrogenase (quinone)  28.19 
 
 		 748 aa  151  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000352419  hitchhiker  0.0000000405513 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1862  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  29.49 
 
 		 646 aa  152  2e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000307213  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0107  NADH dehydrogenase (quinone)  26.6 
 
 		 500 aa  151  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000249004 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3194  NADH dehydrogenase (quinone)  30.73 
 
 		 1264 aa  150  4e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.466435 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4066  NADH dehydrogenase (quinone)  32.39 
 
 		 669 aa  150  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0619804  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1124  hydrogenase membrane subunit  30.11 
 
 		 494 aa  150  6e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.113605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2618  NADH dehydrogenase (quinone)  32.29 
 
 		 646 aa  150  7e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.430528  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1575  hydrogenase membrane subunit  29.87 
 
 		 617 aa  149  9e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1318  hydrogenase membrane subunit  30.03 
 
 		 493 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0734  NAD-dependent dehydrogenase subunit  34.39 
 
 		 668 aa  147  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0393018  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0315  NADH dehydrogenase (quinone)  32.83 
 
 		 674 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.39787  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0179  hydrogenase 4 subunit B  33.14 
 
 		 669 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.987712  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>