More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0339 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0742  NAD-dependent dehydrogenase subunit  71.28 
 
 		 478 aa  640    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0889  NADH dehydrogenase (quinone)  68.28 
 
 		 477 aa  649    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2598  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  70.02 
 
 		 478 aa  641    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0339  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 		 477 aa  934    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.466096  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1072  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  66.6 
 
 		 477 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.41725e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3189  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  66.6 
 
 		 477 aa  608  1e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.176155  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2555  NADH dehydrogenase (quinone)  69.98 
 
 		 479 aa  568  1e-161  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0372  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  63.85 
 
 		 477 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3716  NADH dehydrogenase (quinone)  56.31 
 
 		 476 aa  461  1e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0275464  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3799  NADH dehydrogenase (quinone)  56.31 
 
 		 476 aa  461  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.495272  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3658  NADH dehydrogenase (quinone)  56.76 
 
 		 476 aa  464  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3784  NADH dehydrogenase (quinone)  55.81 
 
 		 477 aa  435  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.688785  normal  0.510826 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2459  NADH dehydrogenase (quinone)  44.78 
 
 		 480 aa  363  4e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.38611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2621  NADH dehydrogenase (quinone)  45 
 
 		 478 aa  345  1e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.773397  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0775  NADH dehydrogenase (quinone)  43.4 
 
 		 497 aa  328  9e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.485892  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0940  NADH dehydrogenase (quinone)  39.49 
 
 		 470 aa  280  6e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0548909  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1688  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  34.13 
 
 		 495 aa  276  4e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.565022  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1304  NADH dehydrogenase (quinone)  35.7 
 
 		 480 aa  266  8e-70  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0185  NADH dehydrogenase (quinone)  39.2 
 
 		 491 aa  256  9e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2188  hydrogenase 4 subunit F  36.62 
 
 		 495 aa  246  6.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.593328 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00980  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  33.87 
 
 		 533 aa  239  6.999999999999999e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.558351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0700  NADH dehydrogenase (quinone)  32.94 
 
 		 484 aa  238  1e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.452975  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1190  hydrogenase 4 subunit F  36.03 
 
 		 526 aa  238  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.647759 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4571  hydrogenase 4 subunit F  33.87 
 
 		 512 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2620  hydrogenase 4 subunit F  36.03 
 
 		 526 aa  238  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1038  hydrogenase-4 component F  35.6 
 
 		 491 aa  237  3e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000418597  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3708  hydrogenase 4 subunit F  36.03 
 
 		 521 aa  237  4e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.332962  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02378  NADH dehydrogenase subunit N  35.8 
 
 		 526 aa  236  7e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1183  NADH dehydrogenase (quinone)  35.8 
 
 		 526 aa  236  7e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02340  hypothetical protein  35.8 
 
 		 526 aa  236  7e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1911  hypothetical protein  32.33 
 
 		 493 aa  232  1e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.262508  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2633  hydrogenase 4 subunit F  35.8 
 
 		 526 aa  231  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0128  hydrogenase-4 component F  32.33 
 
 		 491 aa  227  3e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.223921  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1139  hydrogenase 4 subunit F  36.06 
 
 		 488 aa  227  4e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0485021  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4285  NADH dehydrogenase (quinone)  34.55 
 
 		 499 aa  227  4e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.14859  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0794  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  39.58 
 
 		 489 aa  226  7e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2858  hydrogenase 4 subunit F  37.57 
 
 		 517 aa  226  8e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2463  NADH dehydrogenase (quinone)  36.78 
 
 		 493 aa  225  1e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.873938  normal  0.528975 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0605  NADH dehydrogenase (quinone)  34.74 
 
 		 506 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1791  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  34.47 
 
 		 492 aa  223  7e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0374875  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0932  hydrogenase 4 subunit F  33.79 
 
 		 483 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.187708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0919  hydrogenase 4 subunit F  33.33 
 
 		 487 aa  216  8e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2712  hydrogenase 4 subunit F  35.73 
 
 		 553 aa  216  9e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3289  hydrogenase 4 subunit F  33.72 
 
 		 484 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.612532  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2477  hydrogenase 4 subunit F  33.75 
 
 		 481 aa  213  3.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.638656 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1281  hydrogenase 4 subunit F  36.32 
 
 		 538 aa  213  7e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0834276  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3852  hydrogenase 4 subunit F  32.43 
 
 		 483 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0294681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1263  hydrogenase 4 subunit F  32.22 
 
 		 483 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0336263 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1865  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.76 
 
 		 489 aa  210  5e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4668  hydrogenase 4 subunit F  33.02 
 
 		 484 aa  207  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.423781  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0169  hydrogenase 4 subunit F  33.56 
 
 		 486 aa  204  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.20751  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3431  hypothetical protein  38.52 
 
 		 483 aa  203  4e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.677661  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3216  Hydrogenase 4 membrane component (E)  38.52 
 
 		 483 aa  203  4e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.492531  normal  0.0423716 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0326  hydrogenase 4 subunit F  34.57 
 
 		 486 aa  203  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1810  hydrogenase 4 subunit F  36.44 
 
 		 484 aa  202  8e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.727571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2152  hydrogenase 4 subunit F  36.44 
 
 		 484 aa  202  8e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.915264  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1399  hydrogenase 4 subunit F  32.41 
 
 		 482 aa  202  9e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6068  hydrogenase 4 subunit F  34.72 
 
 		 486 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0822285  hitchhiker  0.00325517 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0176  hydrogenase 4 subunit F  35.8 
 
 		 486 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.399009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0108  hydrogenase 4 subunit F  33.72 
 
 		 486 aa  199  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1614  hydrogenase 4 subunit F  33.72 
 
 		 486 aa  199  6e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1529  hydrogenase 4 subunit F  33.72 
 
 		 486 aa  199  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0729  NADH dehydrogenase (quinone)  37.14 
 
 		 512 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0359188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1264  hydrogenase 4 subunit F  33.03 
 
 		 463 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218764  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4466  NADH dehydrogenase (quinone)  35.53 
 
 		 428 aa  193  7e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10087  hydrogenase hycQ  34.97 
 
 		 488 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000498381  normal  0.186315 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3279  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.4 
 
 		 480 aa  182  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.621261  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1450  hydrogenase subunit, NADH dehydrogenase subunit N-like protein  34.07 
 
 		 499 aa  180  4.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1572  hydrogenase membrane subunit  34.62 
 
 		 460 aa  179  1e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2988  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  34.86 
 
 		 537 aa  172  9e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0307877  hitchhiker  0.00569852 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0320  NADH dehydrogenase (quinone)  33.81 
 
 		 531 aa  171  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1318  hydrogenase membrane subunit  34.62 
 
 		 493 aa  169  1e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4706  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  42.5 
 
 		 572 aa  159  9e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1994  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  29.08 
 
 		 440 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1819  hydrogenase membrane subunit  30.68 
 
 		 489 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00530932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1124  hydrogenase membrane subunit  29.68 
 
 		 494 aa  151  2e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.113605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2629  hydrogenase 4 subunit B  30.29 
 
 		 672 aa  138  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0380  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.14 
 
 		 472 aa  138  2e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000595488  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1194  hydrogenase 4 subunit B  30.29 
 
 		 672 aa  137  4e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02374  NADH dehydrogenase subunit N  30.03 
 
 		 672 aa  137  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02336  hypothetical protein  30.03 
 
 		 672 aa  137  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3704  hydrogenase 4 subunit B  30.03 
 
 		 672 aa  136  8e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.726938  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1142  hydrogenase 4 subunit B  34.49 
 
 		 748 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.239539  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1187  NADH dehydrogenase (quinone)  29.77 
 
 		 672 aa  134  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1880  NADH dehydrogenase (quinone)  30.7 
 
 		 1245 aa  134  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.374238  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1635  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.01 
 
 		 502 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.193581  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4671  hydrogenase 4 subunit B  31.32 
 
 		 674 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.130495 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0132  hydrogenase 4 membrane subunit  29.55 
 
 		 650 aa  133  5e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.167866  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1428  hydrogenase 4 subunit F  30.08 
 
 		 431 aa  131  3e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.289915  normal  0.541686 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4575  hydrogenase 4 subunit B  28.1 
 
 		 671 aa  131  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0890  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.33 
 
 		 507 aa  131  3e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50733  normal  0.143167 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2967  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.18 
 
 		 501 aa  130  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37012 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0916  hydrogenase 4 subunit B  28.61 
 
 		 674 aa  130  6e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0969  NADH dehydrogenase (quinone)  29.14 
 
 		 1253 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0218073 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4506  NADH dehydrogenase (quinone)  28.57 
 
 		 1265 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.105233 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0776  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.11 
 
 		 448 aa  128  2.0000000000000002e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.986701  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4066  NADH dehydrogenase (quinone)  27.95 
 
 		 669 aa  127  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0619804  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2456  NADH dehydrogenase (quinone)  31.41 
 
 		 662 aa  127  6e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0192367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3795  NADH dehydrogenase (quinone)  31.37 
 
 		 666 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.789396  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3284  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.38 
 
 		 492 aa  125  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.141551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>