More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_3784 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_3784  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
477 aa  909    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.688785  normal  0.510826 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3658  NADH dehydrogenase (quinone)  83.71 
 
 
476 aa  699    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3716  NADH dehydrogenase (quinone)  83.48 
 
 
476 aa  706    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0275464  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3799  NADH dehydrogenase (quinone)  83.48 
 
 
476 aa  706    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.495272  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0889  NADH dehydrogenase (quinone)  58.14 
 
 
477 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2598  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  58.32 
 
 
478 aa  497  1e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0742  NAD-dependent dehydrogenase subunit  58.9 
 
 
478 aa  480  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1072  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  55.37 
 
 
477 aa  480  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.41725e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3189  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  55.16 
 
 
477 aa  475  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.176155  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0339  NADH dehydrogenase (quinone)  56.33 
 
 
477 aa  473  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.466096  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2555  NADH dehydrogenase (quinone)  57.24 
 
 
479 aa  436  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0372  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  54.85 
 
 
477 aa  409  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330111  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2459  NADH dehydrogenase (quinone)  47.98 
 
 
480 aa  379  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.38611  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2621  NADH dehydrogenase (quinone)  47.54 
 
 
478 aa  375  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.773397  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0775  NADH dehydrogenase (quinone)  47.68 
 
 
497 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.485892  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0940  NADH dehydrogenase (quinone)  35.79 
 
 
470 aa  291  1e-77  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0548909  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1688  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  35.8 
 
 
495 aa  266  4e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.565022  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1304  NADH dehydrogenase (quinone)  36.01 
 
 
480 aa  261  2e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4285  NADH dehydrogenase (quinone)  37.44 
 
 
499 aa  243  6e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.14859  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2188  hydrogenase 4 subunit F  34.93 
 
 
495 aa  240  2.9999999999999997e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.593328 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4571  hydrogenase 4 subunit F  34.71 
 
 
512 aa  240  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0605  NADH dehydrogenase (quinone)  37.92 
 
 
506 aa  238  1e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0794  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  40.48 
 
 
489 aa  233  8.000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0700  NADH dehydrogenase (quinone)  35.86 
 
 
484 aa  228  2e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.452975  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3289  hydrogenase 4 subunit F  36.68 
 
 
484 aa  226  8e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.612532  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3708  hydrogenase 4 subunit F  34.62 
 
 
521 aa  225  1e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.332962  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1190  hydrogenase 4 subunit F  33.26 
 
 
526 aa  224  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.647759 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02378  NADH dehydrogenase subunit N  33.26 
 
 
526 aa  224  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1183  NADH dehydrogenase (quinone)  33.26 
 
 
526 aa  224  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2620  hydrogenase 4 subunit F  33.26 
 
 
526 aa  224  2e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02340  hypothetical protein  33.26 
 
 
526 aa  224  2e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1139  hydrogenase 4 subunit F  37.23 
 
 
488 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0485021  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2633  hydrogenase 4 subunit F  34.4 
 
 
526 aa  221  3e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0185  NADH dehydrogenase (quinone)  36.3 
 
 
491 aa  221  3e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2858  hydrogenase 4 subunit F  34.95 
 
 
517 aa  220  5e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4668  hydrogenase 4 subunit F  34.15 
 
 
484 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.423781  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1038  hydrogenase-4 component F  32.16 
 
 
491 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000418597  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0326  hydrogenase 4 subunit F  36.77 
 
 
486 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1791  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  37.21 
 
 
492 aa  210  4e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0374875  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2712  hydrogenase 4 subunit F  36.3 
 
 
553 aa  209  8e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00980  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  32.14 
 
 
533 aa  209  9e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.558351  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0176  hydrogenase 4 subunit F  35.35 
 
 
486 aa  208  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.399009  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1281  hydrogenase 4 subunit F  36.03 
 
 
538 aa  206  5e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0834276  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1911  hypothetical protein  31.62 
 
 
493 aa  206  9e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.262508  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1263  hydrogenase 4 subunit F  32.44 
 
 
483 aa  206  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0336263 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2463  NADH dehydrogenase (quinone)  37.36 
 
 
493 aa  205  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.873938  normal  0.528975 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0919  hydrogenase 4 subunit F  33.58 
 
 
487 aa  203  5e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3852  hydrogenase 4 subunit F  33.48 
 
 
483 aa  202  7e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0294681  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0932  hydrogenase 4 subunit F  35.68 
 
 
483 aa  202  9e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.187708  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1865  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  28.75 
 
 
489 aa  202  9e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6068  hydrogenase 4 subunit F  36.75 
 
 
486 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0822285  hitchhiker  0.00325517 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3216  Hydrogenase 4 membrane component (E)  39.07 
 
 
483 aa  201  3e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.492531  normal  0.0423716 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3431  hypothetical protein  39.07 
 
 
483 aa  201  3e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.677661  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2988  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  43.47 
 
 
537 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0307877  hitchhiker  0.00569852 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3279  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.54 
 
 
480 aa  196  7e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.621261  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0169  hydrogenase 4 subunit F  33.79 
 
 
486 aa  194  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.20751  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0108  hydrogenase 4 subunit F  38.23 
 
 
486 aa  194  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1529  hydrogenase 4 subunit F  38.23 
 
 
486 aa  194  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1614  hydrogenase 4 subunit F  38.23 
 
 
486 aa  194  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1264  hydrogenase 4 subunit F  35.35 
 
 
463 aa  192  8e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218764  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0729  NADH dehydrogenase (quinone)  36.58 
 
 
512 aa  190  5.999999999999999e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0359188  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1399  hydrogenase 4 subunit F  35.02 
 
 
482 aa  189  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2477  hydrogenase 4 subunit F  34.06 
 
 
481 aa  188  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.638656 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4466  NADH dehydrogenase (quinone)  38.5 
 
 
428 aa  188  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1810  hydrogenase 4 subunit F  35.25 
 
 
484 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.727571  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2152  hydrogenase 4 subunit F  35.25 
 
 
484 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.915264  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0128  hydrogenase-4 component F  30.13 
 
 
491 aa  185  2.0000000000000003e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.223921  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1572  hydrogenase membrane subunit  32.43 
 
 
460 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0320  NADH dehydrogenase (quinone)  34.65 
 
 
531 aa  172  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1318  hydrogenase membrane subunit  33.82 
 
 
493 aa  168  2e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10087  hydrogenase hycQ  35.4 
 
 
488 aa  167  4e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000498381  normal  0.186315 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1450  hydrogenase subunit, NADH dehydrogenase subunit N-like protein  32.58 
 
 
499 aa  160  3e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4706  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  41.86 
 
 
572 aa  157  4e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1819  hydrogenase membrane subunit  32.46 
 
 
489 aa  155  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00530932  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1124  hydrogenase membrane subunit  29.5 
 
 
494 aa  152  1e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.113605  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2161  NADH dehydrogenase (quinone)  34.15 
 
 
501 aa  147  4.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0776  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  29.9 
 
 
448 aa  141  1.9999999999999998e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.986701  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1994  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  28.93 
 
 
440 aa  139  1e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1822  hydrogenase membrane subunit  31.3 
 
 
643 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0165692  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4575  hydrogenase 4 subunit B  30.9 
 
 
671 aa  134  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3530  NADH dehydrogenase (quinone)  31.44 
 
 
470 aa  134  5e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1880  NADH dehydrogenase (quinone)  32.21 
 
 
1245 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.374238  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0132  hydrogenase 4 membrane subunit  28.99 
 
 
650 aa  132  2.0000000000000002e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.167866  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1142  hydrogenase 4 subunit B  31.2 
 
 
748 aa  130  6e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.239539  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00940  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  31.58 
 
 
672 aa  130  7.000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0380  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.94 
 
 
472 aa  129  9.000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000595488  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0734  NAD-dependent dehydrogenase subunit  32.88 
 
 
668 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0393018  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0892  NADH dehydrogenase (quinone)  29.78 
 
 
669 aa  127  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3712  NADH dehydrogenase (quinone)  36.61 
 
 
666 aa  128  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.753561  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4066  NADH dehydrogenase (quinone)  31.11 
 
 
669 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0619804  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4506  NADH dehydrogenase (quinone)  31.22 
 
 
1265 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.105233 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3795  NADH dehydrogenase (quinone)  36.16 
 
 
666 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.789396  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1069  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.43 
 
 
659 aa  124  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7000400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0589  NADH dehydrogenase (quinone)  28.74 
 
 
473 aa  124  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3194  NADH dehydrogenase (quinone)  29.08 
 
 
1264 aa  124  5e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.466435 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1635  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  31.68 
 
 
502 aa  123  7e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.193581  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3193  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.44 
 
 
659 aa  123  9e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.141056  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0739  NAD-dependent dehydrogenase subunit  32.23 
 
 
661 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.188084  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1428  hydrogenase 4 subunit F  28.1 
 
 
431 aa  122  9.999999999999999e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.289915  normal  0.541686 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1914  L-alanyl-D-glutamate peptidase  29.54 
 
 
655 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>