More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3431 on replicon NC_014213
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014213  Mesil_3431  hypothetical protein  100 
 
 		 483 aa  912    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.677661  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3216  Hydrogenase 4 membrane component (E)  100 
 
 		 483 aa  912    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.492531  normal  0.0423716 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1688  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  35.47 
 
 		 495 aa  261  2e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.565022  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0700  NADH dehydrogenase (quinone)  37.17 
 
 		 484 aa  250  5e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.452975  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3289  hydrogenase 4 subunit F  39.16 
 
 		 484 aa  247  3e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.612532  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1304  NADH dehydrogenase (quinone)  35.75 
 
 		 480 aa  244  1.9999999999999999e-63  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0794  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  37.89 
 
 		 489 aa  243  6e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3708  hydrogenase 4 subunit F  42.52 
 
 		 521 aa  240  5e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.332962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2633  hydrogenase 4 subunit F  42.52 
 
 		 526 aa  240  5e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1139  hydrogenase 4 subunit F  39.47 
 
 		 488 aa  238  1e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0485021  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1190  hydrogenase 4 subunit F  42.52 
 
 		 526 aa  238  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.647759 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2620  hydrogenase 4 subunit F  42.52 
 
 		 526 aa  238  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02378  NADH dehydrogenase subunit N  42.52 
 
 		 526 aa  237  4e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1183  NADH dehydrogenase (quinone)  42.52 
 
 		 526 aa  237  4e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02340  hypothetical protein  42.52 
 
 		 526 aa  237  4e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2477  hydrogenase 4 subunit F  38.34 
 
 		 481 aa  237  4e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.638656 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6068  hydrogenase 4 subunit F  38.31 
 
 		 486 aa  234  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0822285  hitchhiker  0.00325517 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4668  hydrogenase 4 subunit F  36.49 
 
 		 484 aa  234  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.423781  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2858  hydrogenase 4 subunit F  45.27 
 
 		 517 aa  233  5e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2712  hydrogenase 4 subunit F  43.11 
 
 		 553 aa  233  7.000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0919  hydrogenase 4 subunit F  36.39 
 
 		 487 aa  233  7.000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4285  NADH dehydrogenase (quinone)  38.79 
 
 		 499 aa  231  3e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.14859  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1263  hydrogenase 4 subunit F  38.63 
 
 		 483 aa  231  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0336263 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1281  hydrogenase 4 subunit F  41.94 
 
 		 538 aa  230  5e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0834276  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0932  hydrogenase 4 subunit F  38.85 
 
 		 483 aa  229  7e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.187708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1399  hydrogenase 4 subunit F  40.1 
 
 		 482 aa  228  2e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1264  hydrogenase 4 subunit F  40.97 
 
 		 463 aa  227  4e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218764  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4571  hydrogenase 4 subunit F  39.05 
 
 		 512 aa  227  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0169  hydrogenase 4 subunit F  38.39 
 
 		 486 aa  226  5.0000000000000005e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.20751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0326  hydrogenase 4 subunit F  41.19 
 
 		 486 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0176  hydrogenase 4 subunit F  40.5 
 
 		 486 aa  226  7e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.399009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3852  hydrogenase 4 subunit F  39.95 
 
 		 483 aa  226  7e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0294681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1529  hydrogenase 4 subunit F  40.6 
 
 		 486 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0108  hydrogenase 4 subunit F  40.6 
 
 		 486 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1614  hydrogenase 4 subunit F  40.6 
 
 		 486 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2463  NADH dehydrogenase (quinone)  38.97 
 
 		 493 aa  221  3e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.873938  normal  0.528975 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2188  hydrogenase 4 subunit F  38.55 
 
 		 495 aa  219  8.999999999999998e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.593328 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0339  NADH dehydrogenase (quinone)  38.9 
 
 		 477 aa  218  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.466096  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0940  NADH dehydrogenase (quinone)  40.19 
 
 		 470 aa  213  9e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0548909  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1810  hydrogenase 4 subunit F  40.54 
 
 		 484 aa  212  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.727571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2152  hydrogenase 4 subunit F  40.54 
 
 		 484 aa  212  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.915264  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0889  NADH dehydrogenase (quinone)  36.7 
 
 		 477 aa  210  6e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3799  NADH dehydrogenase (quinone)  41.76 
 
 		 476 aa  209  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.495272  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3716  NADH dehydrogenase (quinone)  41.76 
 
 		 476 aa  209  1e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0275464  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2598  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  36.49 
 
 		 478 aa  209  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3658  NADH dehydrogenase (quinone)  41.64 
 
 		 476 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0185  NADH dehydrogenase (quinone)  36.6 
 
 		 491 aa  204  4e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0775  NADH dehydrogenase (quinone)  38.63 
 
 		 497 aa  203  6e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.485892  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1038  hydrogenase-4 component F  33.25 
 
 		 491 aa  203  7e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000418597  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1911  hypothetical protein  32.47 
 
 		 493 aa  202  9.999999999999999e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.262508  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0605  NADH dehydrogenase (quinone)  39.78 
 
 		 506 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3189  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  37.56 
 
 		 477 aa  201  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.176155  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0729  NADH dehydrogenase (quinone)  40.61 
 
 		 512 aa  200  5e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0359188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2621  NADH dehydrogenase (quinone)  39.95 
 
 		 478 aa  200  6e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.773397  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00980  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  29.74 
 
 		 533 aa  199  7.999999999999999e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.558351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3784  NADH dehydrogenase (quinone)  38.07 
 
 		 477 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.688785  normal  0.510826 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1072  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  37.94 
 
 		 477 aa  197  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.41725e-34 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1865  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  33.5 
 
 		 489 aa  196  6e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0128  hydrogenase-4 component F  34.34 
 
 		 491 aa  195  1e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.223921  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4466  NADH dehydrogenase (quinone)  40.8 
 
 		 428 aa  195  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0742  NAD-dependent dehydrogenase subunit  41.62 
 
 		 478 aa  194  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1450  hydrogenase subunit, NADH dehydrogenase subunit N-like protein  34.77 
 
 		 499 aa  192  1e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1572  hydrogenase membrane subunit  34.66 
 
 		 460 aa  189  7e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1318  hydrogenase membrane subunit  34.21 
 
 		 493 aa  189  1e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2459  NADH dehydrogenase (quinone)  35.95 
 
 		 480 aa  186  7e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.38611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1791  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  39.64 
 
 		 492 aa  186  8e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0374875  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2555  NADH dehydrogenase (quinone)  39.47 
 
 		 479 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0372  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  36.6 
 
 		 477 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10087  hydrogenase hycQ  38.4 
 
 		 488 aa  181  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000498381  normal  0.186315 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1124  hydrogenase membrane subunit  33.43 
 
 		 494 aa  179  1e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.113605  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1994  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  34.17 
 
 		 440 aa  177  3e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2988  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  43.02 
 
 		 537 aa  177  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0307877  hitchhiker  0.00569852 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1428  hydrogenase 4 subunit F  33.98 
 
 		 431 aa  171  2e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.289915  normal  0.541686 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0320  NADH dehydrogenase (quinone)  35.03 
 
 		 531 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4706  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  44.32 
 
 		 572 aa  160  4e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0776  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.43 
 
 		 448 aa  152  1e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.986701  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0107  NADH dehydrogenase (quinone)  30.8 
 
 		 500 aa  151  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000249004 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1819  hydrogenase membrane subunit  31.91 
 
 		 489 aa  147  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00530932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0703  NADH dehydrogenase (quinone)  31.05 
 
 		 662 aa  145  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.20305  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4671  hydrogenase 4 subunit B  32.77 
 
 		 674 aa  143  8e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.130495 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0916  hydrogenase 4 subunit B  32.74 
 
 		 674 aa  142  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1142  hydrogenase 4 subunit B  33.15 
 
 		 748 aa  139  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.239539  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4506  NADH dehydrogenase (quinone)  30.04 
 
 		 1265 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.105233 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3194  NADH dehydrogenase (quinone)  32.35 
 
 		 1264 aa  133  6e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.466435 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2967  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  33.23 
 
 		 501 aa  132  9e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37012 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0508  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  30.22 
 
 		 499 aa  132  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000163951  hitchhiker  0.000000287422 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2191  hydrogenase 4 subunit B  29.64 
 
 		 673 aa  128  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2456  NADH dehydrogenase (quinone)  32.37 
 
 		 662 aa  128  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0192367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4288  NADH dehydrogenase (quinone)  31.91 
 
 		 637 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277072  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1453  hydrogenase subunit, HycC-like protein  27.71 
 
 		 644 aa  128  3e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0135  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  27.73 
 
 		 513 aa  128  3e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.501467  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1285  hydrogenase 4 subunit B  27.56 
 
 		 673 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.488809  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1691  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  28.57 
 
 		 688 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000143823  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1864  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  27.8 
 
 		 544 aa  125  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.142353  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2161  NADH dehydrogenase (quinone)  31.29 
 
 		 501 aa  125  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1369  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  30.06 
 
 		 549 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.137682  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1194  hydrogenase 4 subunit B  27.94 
 
 		 672 aa  125  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3292  hydrogenase 4 subunit B  30.18 
 
 		 674 aa  125  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0969  NADH dehydrogenase (quinone)  30.68 
 
 		 1253 aa  125  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0218073 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0917  NADH dehydrogenase (quinone)  29.57 
 
 		 486 aa  125  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.958268  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>