More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0839 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0839  glycosyltransferase-like protein  100 
 
 
822 aa  1645    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1641  glycosyl transferase, group 1  33.67 
 
 
390 aa  184  4.0000000000000006e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2004  glycosyl transferase, group 1  37.37 
 
 
403 aa  181  7e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1349  glycosyltransferase  33.9 
 
 
343 aa  157  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.589568  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  34.95 
 
 
393 aa  154  5.9999999999999996e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3875  glycosyl transferase family 2  32.82 
 
 
331 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2541  putative glycosyl transferase  32.43 
 
 
341 aa  146  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4113  glycosyl transferase family 2  32.13 
 
 
343 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.902695  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0718  family 2 glycosyl transferase  32.34 
 
 
352 aa  139  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00805458 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1523  glycosyltransferase  30.26 
 
 
387 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  28.13 
 
 
387 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1957  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.35 
 
 
366 aa  138  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7649  glycosyl transferase family 2  32.95 
 
 
352 aa  135  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  28.87 
 
 
378 aa  134  9e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  30.97 
 
 
395 aa  131  5.0000000000000004e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1426  glycosyl transferase group 1  36.39 
 
 
387 aa  131  6e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  32.26 
 
 
337 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08480  glycosyl transferase  31.07 
 
 
324 aa  128  3e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.525807 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  32.77 
 
 
377 aa  128  5e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2820  glycosyl transferase group 1  34.05 
 
 
380 aa  127  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2725  glycosyl transferase group 1  33.6 
 
 
380 aa  125  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.409624  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0838  glycosyl transferase family 2  31.14 
 
 
368 aa  121  6e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5927  succinoglycan biosynthesis protein  32.52 
 
 
341 aa  119  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  29.58 
 
 
377 aa  118  5e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0722  succinoglycan biosynthesis protein ExoA  31.27 
 
 
353 aa  114  7.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  29.19 
 
 
385 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  31.4 
 
 
385 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  33.44 
 
 
371 aa  112  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4957  glycosyl transferase family protein  30.9 
 
 
330 aa  112  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.083679 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2639  glycosyl transferase, group 1  33.78 
 
 
380 aa  111  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108471  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  29.33 
 
 
379 aa  111  6e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  33.88 
 
 
387 aa  110  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0474  glycosyl transferase, group 1  38.35 
 
 
376 aa  110  9.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249061  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  34.62 
 
 
412 aa  108  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4712  glycosyl transferase group 1  31.06 
 
 
391 aa  108  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.590232 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  31.67 
 
 
371 aa  106  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1029  glycosyl transferase family protein  27.61 
 
 
360 aa  106  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05860  glycosyl transferase  30.03 
 
 
351 aa  106  2e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000181902 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.51 
 
 
366 aa  106  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  29.44 
 
 
381 aa  106  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.35 
 
 
419 aa  105  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  31.39 
 
 
383 aa  105  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0228  glycosyl transferase family protein  27.3 
 
 
333 aa  105  4e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000082788  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.12 
 
 
373 aa  104  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  29 
 
 
381 aa  103  9e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2479  glycosyl transferase, group 1  29.87 
 
 
379 aa  103  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0654086  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6499  glycosyl transferase, group 1  30.3 
 
 
384 aa  103  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  28.91 
 
 
370 aa  103  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0525  glycosyl transferase group 1  33.58 
 
 
376 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.566558  normal  0.175968 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  29.97 
 
 
360 aa  102  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2072  glycosyl transferase group 1  27 
 
 
374 aa  102  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0913  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.62 
 
 
341 aa  103  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000688111  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  33.44 
 
 
439 aa  103  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  29.12 
 
 
360 aa  102  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3183  glycosyl transferase family 2  30.75 
 
 
358 aa  102  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000292304  decreased coverage  0.0000016442 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 
366 aa  102  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0604  putative glycosyl transferase  29.14 
 
 
340 aa  102  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.781878  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1038  glycosyl transferase family protein  31.06 
 
 
355 aa  102  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.378242  normal  0.03094 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4805  glycosyl transferase family protein  32.4 
 
 
339 aa  102  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1821  glycosyl transferase group 1  35.51 
 
 
380 aa  101  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.500985 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  38.02 
 
 
389 aa  101  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  31.39 
 
 
412 aa  101  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  29.18 
 
 
374 aa  101  6e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  32.2 
 
 
383 aa  101  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  29.67 
 
 
380 aa  101  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30000  Glycosyl transferase, group 1 family protein  28.93 
 
 
370 aa  100  9e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  33.94 
 
 
371 aa  100  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  34.41 
 
 
377 aa  100  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  30.06 
 
 
373 aa  100  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2765  glycosyl transferase, group 1  30.14 
 
 
379 aa  99.8  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117052  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  23.99 
 
 
390 aa  99  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0904  glycosyltransferase  27.59 
 
 
430 aa  99  3e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.397336  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1111  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.59 
 
 
427 aa  99  4e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 
374 aa  98.6  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3357  glycosyl transferase group 1  25.69 
 
 
388 aa  98.6  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.656502  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  33.73 
 
 
399 aa  98.2  5e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0593  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.44 
 
 
369 aa  98.2  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  28.72 
 
 
381 aa  98.2  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  40.49 
 
 
381 aa  97.8  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 
419 aa  97.8  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  27.85 
 
 
399 aa  97.8  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3098  glycosyl transferase group 1  29.02 
 
 
391 aa  97.4  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1957  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3180  glycosyl transferase family 2  26.63 
 
 
322 aa  97.4  9e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2949  glycosyl transferase group 1  29.86 
 
 
379 aa  97.4  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0244554  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  28.48 
 
 
361 aa  96.7  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3564  glycosyl transferase family protein  30.37 
 
 
389 aa  96.7  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  32.56 
 
 
374 aa  97.1  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4992  glycosyl transferase group 1  32.1 
 
 
376 aa  97.1  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  29.13 
 
 
403 aa  97.1  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  32.8 
 
 
376 aa  96.3  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2857  glycosyl transferase group 1  30.16 
 
 
379 aa  96.3  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1106  glycosyl transferase, group 1  29.64 
 
 
364 aa  96.7  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.525955  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  28.71 
 
 
388 aa  95.9  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1028  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.63 
 
 
380 aa  95.5  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3442  glycosyl transferase group 1  29.9 
 
 
385 aa  95.9  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4622  glycosyl transferase family protein  30.99 
 
 
355 aa  95.9  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0686248 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.69 
 
 
365 aa  95.5  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  26.97 
 
 
413 aa  95.5  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  23.59 
 
 
394 aa  95.1  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2213  glycosyl transferase group 1  34.58 
 
 
384 aa  95.1  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.013573  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>