72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1874 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_1874  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 375 aa  764    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.58176  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2094  putative spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  78.53 
 
 		 377 aa  571  1.0000000000000001e-162  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2059  putative spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  40.06 
 
 		 360 aa  243  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.791804  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2451  hypothetical protein  39.75 
 
 		 360 aa  241  1e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2171  extracellular solute-binding protein  36.44 
 
 		 360 aa  241  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.56432  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2181  ABC transporter substrate binding protein  27.36 
 
 		 409 aa  104  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.459496  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3278  putative ABC transporter solute-binding protein  26.55 
 
 		 408 aa  80.1  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1199  putative ABC transporter solute-binding protein  28.94 
 
 		 430 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.134978 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2153  extracellular solute-binding protein  27.07 
 
 		 404 aa  75.5  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000427732 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0180  extracellular solute-binding protein family 1  25.81 
 
 		 377 aa  71.6  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0182  extracellular solute-binding protein  26.7 
 
 		 382 aa  71.2  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.455804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3703  extracellular solute-binding protein  24.61 
 
 		 377 aa  69.7  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0532  putative ABC transporter solute-binding protein  24.29 
 
 		 439 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.96386  normal  0.487675 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6580  extracellular solute-binding protein family 1  25.31 
 
 		 381 aa  67.8  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.384654  normal  0.213985 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0361  putative ABC transporter solute-binding protein  23.44 
 
 		 380 aa  66.2  0.0000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.083844  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2438  hypothetical protein  21.51 
 
 		 409 aa  65.9  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.557423  normal  0.459913 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02678  putative ABC transporter solute-binding protein  23.44 
 
 		 403 aa  65.5  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1269  putative ABC transporter solute-binding protein  22.42 
 
 		 382 aa  64.7  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000820878  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3226  putative ABC transporter solute-binding protein  23.46 
 
 		 401 aa  63.9  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0901142  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1446  putative ABC transporter solute-binding protein  23.68 
 
 		 401 aa  63.9  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.50777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2768  putative ABC transporter solute-binding protein  25.76 
 
 		 381 aa  63.5  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.211813  normal  0.195627 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0759  putative ABC transporter solute-binding protein  24.13 
 
 		 429 aa  63.5  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0200  putative ABC transporter solute-binding protein  24.32 
 
 		 401 aa  63.5  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.91232  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1832  putative ABC transporter solute-binding protein  24.32 
 
 		 401 aa  63.2  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.563171 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003793  ABC transporter substrate-binding protein YnjB  22.12 
 
 		 386 aa  61.2  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000277117  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1236  hypothetical protein  21.47 
 
 		 429 aa  60.8  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1693  putative ABC transporter solute-binding protein  27.25 
 
 		 390 aa  59.7  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.949015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4046  putative ABC transporter solute-binding protein  24.78 
 
 		 406 aa  59.7  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7450  extracellular solute-binding protein  25.37 
 
 		 380 aa  58.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0791  putative ABC transporter solute-binding protein  24.48 
 
 		 403 aa  58.2  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2251  putative ABC transporter solute-binding protein  23.05 
 
 		 399 aa  57.8  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2122  putative ABC transporter solute-binding protein  24.64 
 
 		 409 aa  55.1  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0976  putative ABC transporter solute-binding protein  22.03 
 
 		 435 aa  51.6  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0656307 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2959  putative ABC transporter solute-binding protein  22.9 
 
 		 419 aa  51.6  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4231  putative ABC transporter solute-binding protein  24.92 
 
 		 410 aa  50.8  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5613  ABC transporter substrate binding protein  24.58 
 
 		 395 aa  50.8  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1672  extracellular solute-binding protein  23.51 
 
 		 364 aa  50.8  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0285778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3928  extracellular solute-binding protein  23.02 
 
 		 367 aa  50.4  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04220  putative binding protein component of ABC transporter  25.17 
 
 		 347 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2473  putative ABC transporter solute-binding protein  24.31 
 
 		 388 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5362  extracellular solute-binding protein family 1  24.66 
 
 		 366 aa  49.7  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.142467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0607  extracellular solute-binding protein  22.58 
 
 		 351 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6328  extracellular solute-binding protein  23.2 
 
 		 364 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.545502  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1751  extracellular solute-binding protein  23.2 
 
 		 364 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5050  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  23.51 
 
 		 364 aa  49.3  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1767  extracellular solute-binding protein  23.51 
 
 		 364 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.910155  normal  0.511303 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1556  putative spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  22.79 
 
 		 367 aa  48.5  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1675  extracellular solute-binding protein  23.2 
 
 		 364 aa  47.4  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.271241  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1509  extracellular solute-binding protein  22.15 
 
 		 364 aa  47.4  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.168578 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2309  extracellular solute-binding protein family 1  21.73 
 
 		 366 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103433  normal  0.0970832 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01789  putative ABC-type transport system, periplasmic component  22.3 
 
 		 384 aa  47.4  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1788  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  23.67 
 
 		 364 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1301  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  23.67 
 
 		 364 aa  47  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.803761  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1612  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein, putative  22.45 
 
 		 367 aa  46.6  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.875795  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0107  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  23.89 
 
 		 356 aa  46.6  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.26345  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1950  ABC polyamine transporter, periplasmic ligand binding protein  21.61 
 
 		 366 aa  46.6  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.17949  normal  0.9413 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2095  extracellular solute-binding protein  24.75 
 
 		 385 aa  46.2  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0550638  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5676  extracellular solute-binding protein family 1  24.28 
 
 		 362 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.529859  normal  0.553498 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1058  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  23.1 
 
 		 484 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.363669  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01711  hypothetical protein  24.31 
 
 		 388 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1888  extracellular solute-binding protein family 1  24.31 
 
 		 388 aa  45.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00824785  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01723  hypothetical protein  24.31 
 
 		 388 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1341  extracellular solute-binding protein family 1  24.56 
 
 		 369 aa  45.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1977  putative ABC transporter solute-binding protein  24.31 
 
 		 388 aa  45.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1838  putative ABC transporter solute-binding protein  24.31 
 
 		 388 aa  45.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2276  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  23.37 
 
 		 364 aa  44.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.327871  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2310  putrescine-binding periplasmic protein precursor  23.37 
 
 		 364 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2179  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  23.37 
 
 		 364 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2123  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  23.37 
 
 		 364 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.44987  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2003  putative ABC transporter solute-binding protein  24.54 
 
 		 388 aa  43.5  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.203142  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1878  putative ABC transporter solute-binding protein  24 
 
 		 388 aa  43.9  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000418187 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4039  extracellular solute-binding protein  21.11 
 
 		 359 aa  43.1  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>