57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1832 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1446  putative ABC transporter solute-binding protein  88.75 
 
 		 401 aa  682    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.50777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0200  putative ABC transporter solute-binding protein  98.5 
 
 		 401 aa  787    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.91232  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1832  putative ABC transporter solute-binding protein  100 
 
 		 401 aa  798    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.563171 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4046  putative ABC transporter solute-binding protein  58.96 
 
 		 406 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3278  putative ABC transporter solute-binding protein  55.8 
 
 		 408 aa  444  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2251  putative ABC transporter solute-binding protein  58.62 
 
 		 399 aa  436  1e-121  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2153  extracellular solute-binding protein  54.55 
 
 		 404 aa  400  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000427732 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3226  putative ABC transporter solute-binding protein  51.52 
 
 		 401 aa  395  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0901142  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2438  hypothetical protein  46.04 
 
 		 409 aa  383  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.557423  normal  0.459913 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0976  putative ABC transporter solute-binding protein  39.86 
 
 		 435 aa  319  5e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0656307 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1693  putative ABC transporter solute-binding protein  42.17 
 
 		 390 aa  318  9e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.949015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2959  putative ABC transporter solute-binding protein  41.03 
 
 		 419 aa  317  3e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02678  putative ABC transporter solute-binding protein  38.5 
 
 		 403 aa  315  9.999999999999999e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003793  ABC transporter substrate-binding protein YnjB  38.83 
 
 		 386 aa  311  1e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000277117  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0532  putative ABC transporter solute-binding protein  45.06 
 
 		 439 aa  309  5e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.96386  normal  0.487675 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0361  putative ABC transporter solute-binding protein  40.63 
 
 		 380 aa  308  2.0000000000000002e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.083844  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1838  putative ABC transporter solute-binding protein  44.41 
 
 		 388 aa  306  3e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1888  extracellular solute-binding protein family 1  44.41 
 
 		 388 aa  306  3e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00824785  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1269  putative ABC transporter solute-binding protein  40.05 
 
 		 382 aa  307  3e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000820878  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01711  hypothetical protein  44.41 
 
 		 388 aa  306  3e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01723  hypothetical protein  44.41 
 
 		 388 aa  306  3e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1977  putative ABC transporter solute-binding protein  44.41 
 
 		 388 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1878  putative ABC transporter solute-binding protein  44.15 
 
 		 388 aa  305  8.000000000000001e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000418187 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2473  putative ABC transporter solute-binding protein  44.15 
 
 		 388 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2003  putative ABC transporter solute-binding protein  44.15 
 
 		 388 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.203142  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1436  putative ABC transporter solute-binding protein  43.88 
 
 		 388 aa  301  1e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.463512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2768  putative ABC transporter solute-binding protein  38.5 
 
 		 381 aa  297  2e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.211813  normal  0.195627 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01789  putative ABC-type transport system, periplasmic component  39.89 
 
 		 384 aa  295  1e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0759  putative ABC transporter solute-binding protein  40.94 
 
 		 429 aa  285  8e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1199  putative ABC transporter solute-binding protein  44.92 
 
 		 430 aa  279  7e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.134978 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4231  putative ABC transporter solute-binding protein  41.09 
 
 		 410 aa  268  1e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2122  putative ABC transporter solute-binding protein  37.62 
 
 		 409 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0791  putative ABC transporter solute-binding protein  39.32 
 
 		 403 aa  265  2e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2068  putative ABC transporter solute-binding protein  39.84 
 
 		 424 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.730242  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1236  hypothetical protein  39.81 
 
 		 429 aa  220  3.9999999999999997e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0393  putative ABC transporter solute-binding protein  32.64 
 
 		 373 aa  207  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.235452  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2094  putative spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  26.46 
 
 		 377 aa  72  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7450  extracellular solute-binding protein  25.78 
 
 		 380 aa  64.7  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1874  extracellular solute-binding protein family 1  24.32 
 
 		 375 aa  63.5  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.58176  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5613  ABC transporter substrate binding protein  28.95 
 
 		 395 aa  63.5  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6580  extracellular solute-binding protein family 1  26.07 
 
 		 381 aa  59.7  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.384654  normal  0.213985 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6869  extracellular solute-binding protein family 1  24.81 
 
 		 419 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2181  ABC transporter substrate binding protein  23.08 
 
 		 409 aa  50.8  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.459496  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1590  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  25.98 
 
 		 388 aa  50.4  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2451  hypothetical protein  22.12 
 
 		 360 aa  50.4  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2171  extracellular solute-binding protein  22.12 
 
 		 360 aa  50.1  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.56432  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2059  putative spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  21.82 
 
 		 360 aa  49.3  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.791804  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1609  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  25.29 
 
 		 388 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.154443 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4279  extracellular solute-binding protein family 1  24.52 
 
 		 389 aa  47  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.796314  normal  0.290658 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0518  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  25.27 
 
 		 385 aa  46.6  0.0008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1205  extracellular solute-binding protein  25.19 
 
 		 388 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1656  extracellular solute-binding protein  25.19 
 
 		 388 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.432631  normal  0.449187 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4845  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  24.52 
 
 		 388 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0226871  decreased coverage  0.000145502 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1684  extracellular solute-binding protein  25.19 
 
 		 388 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3337  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.68 
 
 		 394 aa  45.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4218  spermidine/putrescine transport system substrate-binding protein  28.02 
 
 		 413 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.244138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1562  extracellular solute-binding protein  25.19 
 
 		 385 aa  43.5  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.155307 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>