58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0182 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0182  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 382 aa  788    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.455804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3703  extracellular solute-binding protein  61.74 
 
 		 377 aa  495  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0180  extracellular solute-binding protein family 1  61.02 
 
 		 377 aa  464  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2181  ABC transporter substrate binding protein  30.89 
 
 		 409 aa  94.4  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.459496  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5613  ABC transporter substrate binding protein  23.45 
 
 		 395 aa  93.6  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6580  extracellular solute-binding protein family 1  24.02 
 
 		 381 aa  87  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.384654  normal  0.213985 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2171  extracellular solute-binding protein  28.04 
 
 		 360 aa  82.4  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.56432  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2451  hypothetical protein  28.65 
 
 		 360 aa  82.4  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7450  extracellular solute-binding protein  24.26 
 
 		 380 aa  81.6  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2059  putative spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  28.11 
 
 		 360 aa  80.9  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.791804  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2094  putative spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  27.51 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1874  extracellular solute-binding protein family 1  26.7 
 
 		 375 aa  71.2  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.58176  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3337  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  35.96 
 
 		 394 aa  65.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4231  putative ABC transporter solute-binding protein  27.08 
 
 		 410 aa  62  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0810  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.79 
 
 		 393 aa  58.9  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0760  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.79 
 
 		 393 aa  58.9  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.372778  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1656  extracellular solute-binding protein  26.13 
 
 		 388 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.432631  normal  0.449187 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0532  putative ABC transporter solute-binding protein  21.68 
 
 		 439 aa  58.9  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.96386  normal  0.487675 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2752  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  32.41 
 
 		 418 aa  57.8  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1205  extracellular solute-binding protein  25.85 
 
 		 388 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1684  extracellular solute-binding protein  25.85 
 
 		 388 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4443  extracellular solute-binding protein  25.76 
 
 		 392 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6249  extracellular solute-binding protein  27.1 
 
 		 336 aa  53.5  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.389873 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5538  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  24.1 
 
 		 396 aa  53.1  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4279  extracellular solute-binding protein family 1  24.24 
 
 		 389 aa  53.1  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.796314  normal  0.290658 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4845  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  32.22 
 
 		 388 aa  52.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0226871  decreased coverage  0.000145502 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0311  ABC transporter periplasmic-binding protein  24.11 
 
 		 325 aa  52.4  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000568515  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2667  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein, putative  27.99 
 
 		 341 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0490104  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6869  extracellular solute-binding protein family 1  22.92 
 
 		 419 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1562  extracellular solute-binding protein  25.37 
 
 		 385 aa  50.8  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.155307 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1609  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  25.37 
 
 		 388 aa  50.8  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.154443 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1590  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  25.37 
 
 		 388 aa  50.8  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6544  extracellular solute-binding protein family 1  27.97 
 
 		 336 aa  50.4  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.492931 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1955  extracellular solute-binding protein  26.54 
 
 		 341 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319397  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2122  putative ABC transporter solute-binding protein  24.56 
 
 		 409 aa  50.1  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2401  extracellular solute-binding protein  27.02 
 
 		 341 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0652633  normal  0.875866 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5589  extracellular solute-binding protein family 1  27.97 
 
 		 336 aa  49.7  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1935  extracellular solute-binding protein  26.23 
 
 		 341 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092499 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4218  spermidine/putrescine transport system substrate-binding protein  22.62 
 
 		 413 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.244138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0518  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  32.73 
 
 		 385 aa  48.9  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0781  extracellular solute-binding protein  29.85 
 
 		 395 aa  49.3  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000729506  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2091  extracellular solute-binding protein  26.17 
 
 		 341 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5512  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.74 
 
 		 393 aa  48.5  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142427  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0759  putative ABC transporter solute-binding protein  23.2 
 
 		 429 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3814  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  26.23 
 
 		 341 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0560124  normal  0.188879 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1807  ABC transporter periplasmic-binding protein  25.1 
 
 		 325 aa  47  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000832712  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  25.27 
 
 		 363 aa  46.6  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2484  extracellular solute-binding protein  25.95 
 
 		 339 aa  45.1  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.295411  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1170  extracellular solute-binding protein family 1  28.46 
 
 		 397 aa  45.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.441465  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1118  extracellular solute-binding protein family 1  28.79 
 
 		 400 aa  44.7  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000000704817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1552  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 		 391 aa  44.7  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398035  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1614  extracellular solute-binding protein  28.85 
 
 		 391 aa  44.7  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0863  extracellular solute-binding protein  24.06 
 
 		 355 aa  44.3  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0950  extracellular solute-binding protein  25.09 
 
 		 366 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2058  extracellular solute-binding protein family 1  24.72 
 
 		 435 aa  43.9  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.617385 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2438  hypothetical protein  25.61 
 
 		 409 aa  43.9  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.557423  normal  0.459913 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0968  extracellular solute-binding protein  26.44 
 
 		 411 aa  43.1  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155665  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2632  extracellular solute-binding protein  24.43 
 
 		 343 aa  42.7  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>