37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1684 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_1562  extracellular solute-binding protein  94.07 
 
 		 385 aa  737    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.155307 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4845  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  96.13 
 
 		 388 aa  758    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0226871  decreased coverage  0.000145502 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1656  extracellular solute-binding protein  99.23 
 
 		 388 aa  788    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.432631  normal  0.449187 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1205  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 388 aa  792    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1590  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  94.33 
 
 		 388 aa  743    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1684  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 388 aa  792    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1609  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  94.33 
 
 		 388 aa  743    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.154443 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4443  extracellular solute-binding protein  87.6 
 
 		 392 aa  681    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4279  extracellular solute-binding protein family 1  84.07 
 
 		 389 aa  671    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.796314  normal  0.290658 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5538  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  63.5 
 
 		 396 aa  518  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3337  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  56.68 
 
 		 394 aa  443  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0810  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  59.17 
 
 		 393 aa  436  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0760  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  59.17 
 
 		 393 aa  436  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.372778  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5512  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  57.94 
 
 		 393 aa  422  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142427  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4218  spermidine/putrescine transport system substrate-binding protein  54.9 
 
 		 413 aa  405  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.244138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6869  extracellular solute-binding protein family 1  54.04 
 
 		 419 aa  397  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0518  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  48.24 
 
 		 385 aa  381  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2752  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  47.68 
 
 		 418 aa  360  2e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3703  extracellular solute-binding protein  23.87 
 
 		 377 aa  65.1  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5613  ABC transporter substrate binding protein  25.88 
 
 		 395 aa  58.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2438  hypothetical protein  26.04 
 
 		 409 aa  58.2  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.557423  normal  0.459913 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0182  extracellular solute-binding protein  26.52 
 
 		 382 aa  57.8  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.455804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7450  extracellular solute-binding protein  24.61 
 
 		 380 aa  56.6  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0180  extracellular solute-binding protein family 1  25.51 
 
 		 377 aa  56.6  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1199  putative ABC transporter solute-binding protein  25 
 
 		 430 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.134978 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0361  putative ABC transporter solute-binding protein  24.24 
 
 		 380 aa  54.3  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.083844  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003793  ABC transporter substrate-binding protein YnjB  25.26 
 
 		 386 aa  54.3  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000277117  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02678  putative ABC transporter solute-binding protein  23.81 
 
 		 403 aa  52.8  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2122  putative ABC transporter solute-binding protein  23.81 
 
 		 409 aa  52  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0532  putative ABC transporter solute-binding protein  24.37 
 
 		 439 aa  50.4  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.96386  normal  0.487675 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6580  extracellular solute-binding protein family 1  23.55 
 
 		 381 aa  50.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.384654  normal  0.213985 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2768  putative ABC transporter solute-binding protein  25.38 
 
 		 381 aa  48.5  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.211813  normal  0.195627 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3226  putative ABC transporter solute-binding protein  25.09 
 
 		 401 aa  47  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0901142  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1832  putative ABC transporter solute-binding protein  25.19 
 
 		 401 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.563171 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0200  putative ABC transporter solute-binding protein  25.19 
 
 		 401 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.91232  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0759  putative ABC transporter solute-binding protein  24.72 
 
 		 429 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4231  putative ABC transporter solute-binding protein  24.38 
 
 		 410 aa  43.1  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>