35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0810 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0810  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  100 
 
 		 393 aa  798    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0760  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  100 
 
 		 393 aa  798    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.372778  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3337  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  65.73 
 
 		 394 aa  535  1e-151  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5512  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  60.51 
 
 		 393 aa  491  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142427  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5538  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  62.6 
 
 		 396 aa  478  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4443  extracellular solute-binding protein  60.16 
 
 		 392 aa  437  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1562  extracellular solute-binding protein  59.5 
 
 		 385 aa  436  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.155307 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4845  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  59.22 
 
 		 388 aa  434  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0226871  decreased coverage  0.000145502 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1205  extracellular solute-binding protein  59.22 
 
 		 388 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1684  extracellular solute-binding protein  59.22 
 
 		 388 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4279  extracellular solute-binding protein family 1  58.94 
 
 		 389 aa  431  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.796314  normal  0.290658 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1609  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  58.94 
 
 		 388 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.154443 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1656  extracellular solute-binding protein  59.22 
 
 		 388 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.432631  normal  0.449187 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1590  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  58.38 
 
 		 388 aa  428  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6869  extracellular solute-binding protein family 1  53.2 
 
 		 419 aa  389  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2752  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  52.21 
 
 		 418 aa  381  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4218  spermidine/putrescine transport system substrate-binding protein  48.26 
 
 		 413 aa  364  2e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.244138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0518  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  49.05 
 
 		 385 aa  359  4e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7450  extracellular solute-binding protein  26.72 
 
 		 380 aa  69.3  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0182  extracellular solute-binding protein  29.79 
 
 		 382 aa  58.9  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.455804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3703  extracellular solute-binding protein  37.38 
 
 		 377 aa  57.8  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5613  ABC transporter substrate binding protein  24.57 
 
 		 395 aa  52.4  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6580  extracellular solute-binding protein family 1  24.59 
 
 		 381 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.384654  normal  0.213985 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02678  putative ABC transporter solute-binding protein  26.86 
 
 		 403 aa  49.3  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003793  ABC transporter substrate-binding protein YnjB  26.9 
 
 		 386 aa  49.3  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000277117  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2171  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 360 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.56432  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0532  putative ABC transporter solute-binding protein  24.26 
 
 		 439 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.96386  normal  0.487675 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3226  putative ABC transporter solute-binding protein  24.9 
 
 		 401 aa  47.4  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0901142  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2959  putative ABC transporter solute-binding protein  23.27 
 
 		 419 aa  47.4  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0180  extracellular solute-binding protein family 1  30.43 
 
 		 377 aa  46.6  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2451  hypothetical protein  24.26 
 
 		 360 aa  47  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2059  putative spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  23.53 
 
 		 360 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.791804  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2768  putative ABC transporter solute-binding protein  22.41 
 
 		 381 aa  44.3  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.211813  normal  0.195627 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0791  putative ABC transporter solute-binding protein  21.28 
 
 		 403 aa  44.3  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2438  hypothetical protein  23.74 
 
 		 409 aa  43.1  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.557423  normal  0.459913 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>