55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3703 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_3703  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 377 aa  769    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0180  extracellular solute-binding protein family 1  72.65 
 
 		 377 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0182  extracellular solute-binding protein  61.74 
 
 		 382 aa  495  1e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.455804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5613  ABC transporter substrate binding protein  25.95 
 
 		 395 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6580  extracellular solute-binding protein family 1  26.65 
 
 		 381 aa  99.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.384654  normal  0.213985 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2181  ABC transporter substrate binding protein  27.24 
 
 		 409 aa  82.4  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.459496  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7450  extracellular solute-binding protein  25.83 
 
 		 380 aa  81.3  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2171  extracellular solute-binding protein  27.56 
 
 		 360 aa  80.1  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.56432  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2451  hypothetical protein  28 
 
 		 360 aa  78.6  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2059  putative spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  27.43 
 
 		 360 aa  77  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.791804  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2094  putative spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  25.64 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1874  extracellular solute-binding protein family 1  24.61 
 
 		 375 aa  69.7  0.00000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.58176  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3337  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.94 
 
 		 394 aa  67.8  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1656  extracellular solute-binding protein  24.12 
 
 		 388 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.432631  normal  0.449187 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1684  extracellular solute-binding protein  23.87 
 
 		 388 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4231  putative ABC transporter solute-binding protein  24.34 
 
 		 410 aa  62  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1205  extracellular solute-binding protein  23.87 
 
 		 388 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0810  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  37.38 
 
 		 393 aa  58.2  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4845  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  26.02 
 
 		 388 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0226871  decreased coverage  0.000145502 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0760  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  37.38 
 
 		 393 aa  58.2  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.372778  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2752  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.11 
 
 		 418 aa  58.2  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0759  putative ABC transporter solute-binding protein  24.73 
 
 		 429 aa  57  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  27.02 
 
 		 412 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  27.02 
 
 		 439 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  27.02 
 
 		 439 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0532  putative ABC transporter solute-binding protein  24.93 
 
 		 439 aa  56.6  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.96386  normal  0.487675 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5538  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  28.45 
 
 		 396 aa  56.2  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6869  extracellular solute-binding protein family 1  28.48 
 
 		 419 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4443  extracellular solute-binding protein  28.31 
 
 		 392 aa  53.5  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1562  extracellular solute-binding protein  26.02 
 
 		 385 aa  53.5  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.155307 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1609  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  35.56 
 
 		 388 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.154443 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1590  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  35.56 
 
 		 388 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4218  spermidine/putrescine transport system substrate-binding protein  31.78 
 
 		 413 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.244138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4279  extracellular solute-binding protein family 1  34.44 
 
 		 389 aa  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.796314  normal  0.290658 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1170  extracellular solute-binding protein family 1  30.9 
 
 		 397 aa  51.6  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.441465  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0518  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  35.45 
 
 		 385 aa  51.6  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  26.4 
 
 		 496 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4682  extracellular solute-binding protein  22.87 
 
 		 412 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5065  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, 2-aminoethylphosphonate binding protein  26.21 
 
 		 365 aa  49.7  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0972381  normal  0.728899 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2122  putative ABC transporter solute-binding protein  24.35 
 
 		 409 aa  49.7  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5512  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  34.62 
 
 		 393 aa  48.9  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142427  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4871  extracellular solute-binding protein family 1  25.83 
 
 		 434 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.618682  normal  0.377624 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1118  extracellular solute-binding protein family 1  28.08 
 
 		 400 aa  47.4  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000000704817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1453  extracellular solute-binding protein  39.71 
 
 		 415 aa  46.6  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0104666  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0791  putative ABC transporter solute-binding protein  29.46 
 
 		 403 aa  46.2  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7193  ABC transporter substrate-binding protein  27.59 
 
 		 348 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.57881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4681  extracellular solute-binding protein  24.57 
 
 		 343 aa  44.3  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2667  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein, putative  29.7 
 
 		 341 aa  43.1  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0490104  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1199  putative ABC transporter solute-binding protein  22.94 
 
 		 430 aa  43.1  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.134978 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1614  extracellular solute-binding protein  26.63 
 
 		 391 aa  43.1  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2401  extracellular solute-binding protein  29.7 
 
 		 341 aa  43.1  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0652633  normal  0.875866 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1552  extracellular solute-binding protein  26.63 
 
 		 391 aa  43.1  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398035  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2068  putative ABC transporter solute-binding protein  22.34 
 
 		 424 aa  42.7  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.730242  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1935  extracellular solute-binding protein  24.23 
 
 		 341 aa  42.7  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092499 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2420  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 		 420 aa  42.7  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.228974 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>