79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2094 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2094  putative spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  100 
 
 
377 aa  773    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1874  extracellular solute-binding protein family 1  75.4 
 
 
375 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.58176  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2059  putative spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  40.29 
 
 
360 aa  258  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.791804  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2451  hypothetical protein  40 
 
 
360 aa  256  5e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2171  extracellular solute-binding protein  40 
 
 
360 aa  256  6e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.56432  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2181  ABC transporter substrate binding protein  27.59 
 
 
409 aa  100  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.459496  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6580  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 
381 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.384654  normal  0.213985 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3278  putative ABC transporter solute-binding protein  24.68 
 
 
408 aa  75.1  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1199  putative ABC transporter solute-binding protein  26.88 
 
 
430 aa  73.9  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.134978 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1446  putative ABC transporter solute-binding protein  25.32 
 
 
401 aa  73.9  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.50777  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0180  extracellular solute-binding protein family 1  25.27 
 
 
377 aa  73.9  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3703  extracellular solute-binding protein  25.64 
 
 
377 aa  73.6  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0182  extracellular solute-binding protein  27.51 
 
 
382 aa  73.2  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.455804  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1832  putative ABC transporter solute-binding protein  26.46 
 
 
401 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.563171 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0200  putative ABC transporter solute-binding protein  24.93 
 
 
401 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.91232  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2153  extracellular solute-binding protein  25.15 
 
 
404 aa  71.2  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000427732 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0532  putative ABC transporter solute-binding protein  23.8 
 
 
439 aa  69.7  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.96386  normal  0.487675 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3226  putative ABC transporter solute-binding protein  24.46 
 
 
401 aa  67.4  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0901142  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0361  putative ABC transporter solute-binding protein  23.34 
 
 
380 aa  67  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.083844  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5613  ABC transporter substrate binding protein  25.87 
 
 
395 aa  65.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2251  putative ABC transporter solute-binding protein  24.46 
 
 
399 aa  64.7  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11793  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1269  putative ABC transporter solute-binding protein  22.12 
 
 
382 aa  63.9  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000820878  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2122  putative ABC transporter solute-binding protein  23.25 
 
 
409 aa  63.2  0.000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1236  hypothetical protein  23.58 
 
 
429 aa  62.8  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02678  putative ABC transporter solute-binding protein  20.94 
 
 
403 aa  62.4  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003793  ABC transporter substrate-binding protein YnjB  21.04 
 
 
386 aa  60.8  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000277117  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2438  hypothetical protein  22.66 
 
 
409 aa  60.5  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.557423  normal  0.459913 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0791  putative ABC transporter solute-binding protein  24.11 
 
 
403 aa  59.3  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1693  putative ABC transporter solute-binding protein  25.58 
 
 
390 aa  59.3  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.949015  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4046  putative ABC transporter solute-binding protein  22.9 
 
 
406 aa  58.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01789  putative ABC-type transport system, periplasmic component  26.49 
 
 
384 aa  58.2  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0759  putative ABC transporter solute-binding protein  22.67 
 
 
429 aa  57.8  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0976  putative ABC transporter solute-binding protein  24.1 
 
 
435 aa  58.2  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0656307 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1502  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.85 
 
 
362 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0113  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.85 
 
 
362 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2768  putative ABC transporter solute-binding protein  23.08 
 
 
381 aa  56.2  0.0000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.211813  normal  0.195627 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2473  putative ABC transporter solute-binding protein  26.9 
 
 
388 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0951  ABC transporter, periplasmic-binding protein  22.85 
 
 
362 aa  53.1  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2276  putative periplasmic solute-binding protein  22.85 
 
 
362 aa  53.1  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.72431  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1036  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  22.85 
 
 
362 aa  53.1  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1128  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.85 
 
 
362 aa  53.1  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1672  extracellular solute-binding protein  21.99 
 
 
364 aa  53.1  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0285778  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01723  hypothetical protein  26.9 
 
 
388 aa  52  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01711  hypothetical protein  26.9 
 
 
388 aa  52  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1888  extracellular solute-binding protein family 1  26.9 
 
 
388 aa  52  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00824785  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1838  putative ABC transporter solute-binding protein  26.9 
 
 
388 aa  52  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1977  putative ABC transporter solute-binding protein  26.9 
 
 
388 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6328  extracellular solute-binding protein  21.99 
 
 
364 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.545502  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1751  extracellular solute-binding protein  21.99 
 
 
364 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1767  extracellular solute-binding protein  22.22 
 
 
364 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.910155  normal  0.511303 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7450  extracellular solute-binding protein  21.94 
 
 
380 aa  50.8  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5050  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  21.69 
 
 
364 aa  50.4  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388938  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1878  putative ABC transporter solute-binding protein  26.58 
 
 
388 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000418187 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1509  extracellular solute-binding protein  21.41 
 
 
364 aa  50.1  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.168578 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1675  extracellular solute-binding protein  21.69 
 
 
364 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.271241  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4360  extracellular solute-binding protein  25.73 
 
 
366 aa  48.9  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4231  putative ABC transporter solute-binding protein  23.05 
 
 
410 aa  48.5  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1788  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  20.99 
 
 
364 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0107  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  20.99 
 
 
356 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.26345  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1301  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  20.99 
 
 
364 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.803761  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1725  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.54 
 
 
362 aa  47.4  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106673  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1436  putative ABC transporter solute-binding protein  25.95 
 
 
388 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.463512  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2003  putative ABC transporter solute-binding protein  26.27 
 
 
388 aa  46.2  0.0009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.203142  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2068  putative ABC transporter solute-binding protein  22.44 
 
 
424 aa  45.8  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.730242  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1058  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  20.99 
 
 
484 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.363669  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1044  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  23.7 
 
 
362 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.331703  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2123  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  20.68 
 
 
364 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.44987  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2179  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  20.68 
 
 
364 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2310  putrescine-binding periplasmic protein precursor  20.68 
 
 
364 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1950  ABC polyamine transporter, periplasmic ligand binding protein  20.63 
 
 
366 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.17949  normal  0.9413 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2276  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  20.68 
 
 
364 aa  45.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.327871  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1279  extracellular solute-binding protein  26.02 
 
 
366 aa  44.3  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.49233 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2309  extracellular solute-binding protein family 1  20.34 
 
 
366 aa  44.3  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103433  normal  0.0970832 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2534  extracellular solute-binding protein  20.48 
 
 
338 aa  43.9  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2959  putative ABC transporter solute-binding protein  22.12 
 
 
419 aa  43.5  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04220  putative binding protein component of ABC transporter  24.3 
 
 
347 aa  43.1  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0386  periplasmic polyamine binding protein  25 
 
 
353 aa  43.1  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2521  extracellular solute-binding protein family 1  22.03 
 
 
338 aa  42.7  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6021  extracellular solute-binding protein  32.43 
 
 
347 aa  42.7  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>