53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2171 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2059  putative spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  98.89 
 
 		 360 aa  738    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.791804  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2451  hypothetical protein  99.17 
 
 		 360 aa  739    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2171  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 360 aa  744    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.56432  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2094  putative spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  40 
 
 		 377 aa  255  8e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1874  extracellular solute-binding protein family 1  36.44 
 
 		 375 aa  241  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.58176  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0180  extracellular solute-binding protein family 1  28.8 
 
 		 377 aa  93.2  7e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0182  extracellular solute-binding protein  28.04 
 
 		 382 aa  82.4  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.455804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3703  extracellular solute-binding protein  27.56 
 
 		 377 aa  80.1  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2181  ABC transporter substrate binding protein  23.2 
 
 		 409 aa  72.8  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.459496  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6580  extracellular solute-binding protein family 1  22.73 
 
 		 381 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.384654  normal  0.213985 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5613  ABC transporter substrate binding protein  23.74 
 
 		 395 aa  55.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3337  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.79 
 
 		 394 aa  55.1  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0518  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  29.55 
 
 		 385 aa  55.1  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5512  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.83 
 
 		 393 aa  52.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142427  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3278  putative ABC transporter solute-binding protein  21.39 
 
 		 408 aa  50.1  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4279  extracellular solute-binding protein family 1  27.82 
 
 		 389 aa  49.7  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.796314  normal  0.290658 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2752  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.17 
 
 		 418 aa  48.9  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0760  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25 
 
 		 393 aa  48.5  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.372778  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0810  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25 
 
 		 393 aa  48.5  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4046  putative ABC transporter solute-binding protein  23 
 
 		 406 aa  47.8  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1501  extracellular solute-binding protein  20.25 
 
 		 348 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0791  putative ABC transporter solute-binding protein  25 
 
 		 403 aa  47.8  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1446  putative ABC transporter solute-binding protein  21.86 
 
 		 401 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.50777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1562  extracellular solute-binding protein  27.07 
 
 		 385 aa  47.4  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.155307 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1832  putative ABC transporter solute-binding protein  21.27 
 
 		 401 aa  47  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.563171 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1468  ABC polyamine transporter, periplasmic ligand binding protein  21.95 
 
 		 349 aa  47  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.119305 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3334  extracellular solute-binding protein  26.73 
 
 		 385 aa  47  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1563  ABC transporter, substrate-binding protein  23.1 
 
 		 341 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1502  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.21 
 
 		 362 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0976  putative ABC transporter solute-binding protein  23.88 
 
 		 435 aa  45.8  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0656307 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0113  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.21 
 
 		 362 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0753  extracellular solute-binding protein  19.63 
 
 		 365 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7450  extracellular solute-binding protein  29.58 
 
 		 380 aa  45.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1234  extracellular solute-binding protein  19.63 
 
 		 365 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1611  extracellular solute-binding protein  23.1 
 
 		 341 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.257155  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1208  extracellular solute-binding protein  19.63 
 
 		 342 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.527758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0200  putative ABC transporter solute-binding protein  21.04 
 
 		 401 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.91232  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4443  extracellular solute-binding protein  25.56 
 
 		 392 aa  44.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5394  ferric iron-binding periplasmic protein HitA  21.8 
 
 		 335 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1236  hypothetical protein  22.78 
 
 		 429 aa  44.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2829  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  21.1 
 
 		 353 aa  44.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1753  putative ABC transporter, substrate-binding protein  22.36 
 
 		 341 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2648  extracellular solute-binding protein family 1  19.81 
 
 		 362 aa  43.5  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.370022 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62000  ferric iron-binding periplasmic protein HitA  21.11 
 
 		 335 aa  43.5  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617589  normal  0.0992069 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4343  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  19.57 
 
 		 370 aa  43.5  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3226  putative ABC transporter solute-binding protein  22.01 
 
 		 401 aa  43.5  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0901142  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1419  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.71 
 
 		 353 aa  43.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1309  putative transporter  22.58 
 
 		 337 aa  43.1  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.442575  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3071  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.71 
 
 		 353 aa  43.1  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1215  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.71 
 
 		 353 aa  43.1  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0399502  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0652  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.71 
 
 		 353 aa  43.1  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1412  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.71 
 
 		 353 aa  43.1  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0501  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.71 
 
 		 353 aa  43.1  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>