41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2752 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2752  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  100 
 
 		 418 aa  842    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6869  extracellular solute-binding protein family 1  51.53 
 
 		 419 aa  395  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5512  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  51.24 
 
 		 393 aa  381  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142427  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0810  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  52.21 
 
 		 393 aa  380  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0760  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  52.21 
 
 		 393 aa  380  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.372778  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4218  spermidine/putrescine transport system substrate-binding protein  47.83 
 
 		 413 aa  377  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.244138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3337  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  49.86 
 
 		 394 aa  370  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1562  extracellular solute-binding protein  48.74 
 
 		 385 aa  363  4e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.155307 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1609  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  48.74 
 
 		 388 aa  361  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.154443 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1590  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  48.74 
 
 		 388 aa  361  1e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1656  extracellular solute-binding protein  48.46 
 
 		 388 aa  359  6e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.432631  normal  0.449187 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1684  extracellular solute-binding protein  48.18 
 
 		 388 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1205  extracellular solute-binding protein  48.18 
 
 		 388 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5538  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  45 
 
 		 396 aa  356  5e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4845  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  48.18 
 
 		 388 aa  354  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0226871  decreased coverage  0.000145502 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4443  extracellular solute-binding protein  48.18 
 
 		 392 aa  350  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4279  extracellular solute-binding protein family 1  47.34 
 
 		 389 aa  346  5e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.796314  normal  0.290658 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0518  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  46.22 
 
 		 385 aa  336  5e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7450  extracellular solute-binding protein  26.33 
 
 		 380 aa  63.2  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5613  ABC transporter substrate binding protein  25.55 
 
 		 395 aa  59.3  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0182  extracellular solute-binding protein  32.41 
 
 		 382 aa  57.8  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.455804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3703  extracellular solute-binding protein  39.36 
 
 		 377 aa  58.2  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0791  putative ABC transporter solute-binding protein  23.74 
 
 		 403 aa  53.5  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0180  extracellular solute-binding protein family 1  33.64 
 
 		 377 aa  51.6  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6580  extracellular solute-binding protein family 1  24.56 
 
 		 381 aa  50.8  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.384654  normal  0.213985 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2171  extracellular solute-binding protein  25.17 
 
 		 360 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.56432  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2451  hypothetical protein  24.48 
 
 		 360 aa  47  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4046  putative ABC transporter solute-binding protein  26.77 
 
 		 406 aa  45.8  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0701  extracellular solute-binding protein family 1  27.69 
 
 		 432 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2122  putative ABC transporter solute-binding protein  23.33 
 
 		 409 aa  46.2  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2059  putative spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  23.78 
 
 		 360 aa  45.8  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.791804  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1188  extracellular solute-binding protein family 1  28.31 
 
 		 587 aa  45.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3278  putative ABC transporter solute-binding protein  26.59 
 
 		 408 aa  44.3  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2181  ABC transporter substrate binding protein  45.65 
 
 		 409 aa  43.9  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.459496  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3226  putative ABC transporter solute-binding protein  27.89 
 
 		 401 aa  44.3  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0901142  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5189  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, 2-aminoethylphosphonate binding protein  32.65 
 
 		 362 aa  43.5  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.746305 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4661  ABC transporter periplasmic-binding protein  32.65 
 
 		 362 aa  43.5  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.762259  normal  0.137959 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5300  ABC transporter periplasmic-binding protein  32.65 
 
 		 363 aa  43.5  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.218142  normal  0.0163118 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3067  ABC transporter periplasmic-binding protein  32.65 
 
 		 363 aa  43.5  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.127261  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4968  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, 2-aminoethylphosphonate binding protein  32.65 
 
 		 363 aa  43.5  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.537601  normal  0.0916324 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0348  thiamine ABC transporter periplasmic binding protein  32.65 
 
 		 362 aa  43.5  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0499853  normal  0.792791 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>