37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4218 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4218  spermidine/putrescine transport system substrate-binding protein  100 
 
 		 413 aa  824    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.244138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6869  extracellular solute-binding protein family 1  67.9 
 
 		 419 aa  543  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4845  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  55.18 
 
 		 388 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0226871  decreased coverage  0.000145502 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1562  extracellular solute-binding protein  54.9 
 
 		 385 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.155307 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1205  extracellular solute-binding protein  54.9 
 
 		 388 aa  405  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1684  extracellular solute-binding protein  54.9 
 
 		 388 aa  405  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1656  extracellular solute-binding protein  54.9 
 
 		 388 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.432631  normal  0.449187 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4443  extracellular solute-binding protein  54.6 
 
 		 392 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1609  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  53.78 
 
 		 388 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.154443 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1590  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  53.78 
 
 		 388 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4279  extracellular solute-binding protein family 1  53.5 
 
 		 389 aa  391  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.796314  normal  0.290658 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5538  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  51.38 
 
 		 396 aa  388  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2752  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  51.09 
 
 		 418 aa  370  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0810  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  50.55 
 
 		 393 aa  361  1e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0760  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  50.55 
 
 		 393 aa  361  1e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.372778  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5512  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  46.65 
 
 		 393 aa  360  4e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142427  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3337  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  47.37 
 
 		 394 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0518  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  46.5 
 
 		 385 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3703  extracellular solute-binding protein  31.78 
 
 		 377 aa  52.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6580  extracellular solute-binding protein family 1  24.76 
 
 		 381 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.384654  normal  0.213985 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5613  ABC transporter substrate binding protein  26.56 
 
 		 395 aa  51.2  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3226  putative ABC transporter solute-binding protein  26.26 
 
 		 401 aa  50.8  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0901142  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0180  extracellular solute-binding protein family 1  24.58 
 
 		 377 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0182  extracellular solute-binding protein  22.62 
 
 		 382 aa  49.3  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.455804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2122  putative ABC transporter solute-binding protein  27.27 
 
 		 409 aa  48.9  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1199  putative ABC transporter solute-binding protein  26.19 
 
 		 430 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.134978 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7450  extracellular solute-binding protein  24.1 
 
 		 380 aa  47.8  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0532  putative ABC transporter solute-binding protein  25.27 
 
 		 439 aa  47.4  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.96386  normal  0.487675 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2631  extracellular solute-binding protein  32.19 
 
 		 347 aa  47  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0644092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2181  ABC transporter substrate binding protein  26.73 
 
 		 409 aa  46.6  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.459496  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0759  putative ABC transporter solute-binding protein  48.57 
 
 		 429 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0200  putative ABC transporter solute-binding protein  28.02 
 
 		 401 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.91232  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1832  putative ABC transporter solute-binding protein  28.02 
 
 		 401 aa  45.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.563171 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2006  extracellular solute-binding protein  31.51 
 
 		 345 aa  44.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.569092  normal  0.043558 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1446  putative ABC transporter solute-binding protein  28.88 
 
 		 401 aa  44.3  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.50777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0791  putative ABC transporter solute-binding protein  30.07 
 
 		 403 aa  43.1  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2438  hypothetical protein  26.29 
 
 		 409 aa  43.1  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.557423  normal  0.459913 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>