59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2122 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2122  putative ABC transporter solute-binding protein  100 
 
 		 409 aa  849    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0791  putative ABC transporter solute-binding protein  60.61 
 
 		 403 aa  508  1e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0759  putative ABC transporter solute-binding protein  60.2 
 
 		 429 aa  498  1e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0532  putative ABC transporter solute-binding protein  58.03 
 
 		 439 aa  476  1e-133  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.96386  normal  0.487675 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1199  putative ABC transporter solute-binding protein  60.55 
 
 		 430 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.134978 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4231  putative ABC transporter solute-binding protein  43.85 
 
 		 410 aa  317  2e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4046  putative ABC transporter solute-binding protein  38.35 
 
 		 406 aa  277  3e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3278  putative ABC transporter solute-binding protein  38.02 
 
 		 408 aa  276  7e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1446  putative ABC transporter solute-binding protein  40.53 
 
 		 401 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.50777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2438  hypothetical protein  34.56 
 
 		 409 aa  272  7e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.557423  normal  0.459913 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2251  putative ABC transporter solute-binding protein  38.34 
 
 		 399 aa  265  8.999999999999999e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3226  putative ABC transporter solute-binding protein  35.87 
 
 		 401 aa  265  2e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0901142  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0200  putative ABC transporter solute-binding protein  37.78 
 
 		 401 aa  263  4e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.91232  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1832  putative ABC transporter solute-binding protein  38.67 
 
 		 401 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.563171 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1236  hypothetical protein  39.32 
 
 		 429 aa  260  3e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2068  putative ABC transporter solute-binding protein  38.17 
 
 		 424 aa  257  3e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.730242  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2473  putative ABC transporter solute-binding protein  38.85 
 
 		 388 aa  231  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1693  putative ABC transporter solute-binding protein  36.09 
 
 		 390 aa  231  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.949015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1838  putative ABC transporter solute-binding protein  38.58 
 
 		 388 aa  229  5e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1888  extracellular solute-binding protein family 1  38.58 
 
 		 388 aa  229  5e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00824785  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01723  hypothetical protein  38.58 
 
 		 388 aa  229  5e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01711  hypothetical protein  38.58 
 
 		 388 aa  229  5e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1878  putative ABC transporter solute-binding protein  38.58 
 
 		 388 aa  229  6e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000418187 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1977  putative ABC transporter solute-binding protein  38.58 
 
 		 388 aa  229  7e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2003  putative ABC transporter solute-binding protein  38.32 
 
 		 388 aa  226  6e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.203142  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1436  putative ABC transporter solute-binding protein  38.32 
 
 		 388 aa  226  6e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.463512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2768  putative ABC transporter solute-binding protein  37.74 
 
 		 381 aa  223  6e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.211813  normal  0.195627 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2153  extracellular solute-binding protein  34.4 
 
 		 404 aa  220  3e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000427732 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1269  putative ABC transporter solute-binding protein  33.78 
 
 		 382 aa  218  2e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000820878  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0361  putative ABC transporter solute-binding protein  35.62 
 
 		 380 aa  215  9.999999999999999e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.083844  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0976  putative ABC transporter solute-binding protein  32.3 
 
 		 435 aa  215  9.999999999999999e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0656307 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02678  putative ABC transporter solute-binding protein  33.33 
 
 		 403 aa  208  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003793  ABC transporter substrate-binding protein YnjB  32.56 
 
 		 386 aa  206  7e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000277117  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2959  putative ABC transporter solute-binding protein  32.09 
 
 		 419 aa  203  4e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01789  putative ABC-type transport system, periplasmic component  32.45 
 
 		 384 aa  193  6e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0393  putative ABC transporter solute-binding protein  30.56 
 
 		 373 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.235452  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5613  ABC transporter substrate binding protein  28.57 
 
 		 395 aa  81.6  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6580  extracellular solute-binding protein family 1  28.18 
 
 		 381 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.384654  normal  0.213985 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7450  extracellular solute-binding protein  23.05 
 
 		 380 aa  73.6  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2094  putative spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  23.25 
 
 		 377 aa  62.8  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1874  extracellular solute-binding protein family 1  24.64 
 
 		 375 aa  55.1  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.58176  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1656  extracellular solute-binding protein  24.18 
 
 		 388 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.432631  normal  0.449187 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4279  extracellular solute-binding protein family 1  23.29 
 
 		 389 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.796314  normal  0.290658 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1590  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  23.97 
 
 		 388 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1205  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 		 388 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1684  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 		 388 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1609  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  24.18 
 
 		 388 aa  51.6  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.154443 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4845  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  24.35 
 
 		 388 aa  50.4  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0226871  decreased coverage  0.000145502 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0182  extracellular solute-binding protein  24.56 
 
 		 382 aa  50.1  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.455804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1562  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 		 385 aa  50.1  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.155307 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3703  extracellular solute-binding protein  24.35 
 
 		 377 aa  49.7  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4218  spermidine/putrescine transport system substrate-binding protein  27.27 
 
 		 413 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.244138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0857  extracellular solute-binding protein  25.31 
 
 		 355 aa  48.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.761478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4443  extracellular solute-binding protein  22.61 
 
 		 392 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0180  extracellular solute-binding protein family 1  23.98 
 
 		 377 aa  47  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2752  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.33 
 
 		 418 aa  46.6  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0518  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  22.09 
 
 		 385 aa  46.6  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5512  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.23 
 
 		 393 aa  45.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142427  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5538  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  20 
 
 		 396 aa  43.1  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>