67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2246 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2246  prophage CP4-57 regulatory  100 
 
 		 91 aa  179  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.422477 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2566  prophage CP4-57 regulatory  75.56 
 
 		 91 aa  135  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1562  phage transcriptional regulator, AlpA  65.52 
 
 		 79 aa  85.9  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.544133  normal  0.10217 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1256  phage transcriptional regulator, AlpA  52.63 
 
 		 64 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3477  phage transcriptional regulator, AlpA  52.94 
 
 		 60 aa  62.8  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1968  phage transcriptional regulator, AlpA  44.44 
 
 		 72 aa  61.2  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0901685  normal  0.059551 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2647  phage transcriptional regulator, AlpA  41.18 
 
 		 99 aa  58.9  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.561407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3251  hypothetical protein  41.79 
 
 		 77 aa  55.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1227  phage transcriptional regulator, AlpA  45.1 
 
 		 78 aa  52.8  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0127458  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2991  hypothetical protein  37.14 
 
 		 73 aa  52.8  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.120456  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0962  putative bacteriophage DNA-binding transcription regulator protein  39.47 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.907406 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2916  hypothetical protein  42.11 
 
 		 71 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0151072 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2070  hypothetical protein  43.08 
 
 		 76 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.21456  normal  0.582697 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1156  phage transcriptional regulator, AlpA  34.33 
 
 		 71 aa  52.4  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0255  prophage CP4-57 regulatory  46.3 
 
 		 77 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.883107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6511  phage transcriptional regulator, AlpA  43.1 
 
 		 77 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2796  phage transcriptional regulator, AlpA  38.89 
 
 		 109 aa  50.4  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0052  AlpA family protein  32.76 
 
 		 72 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3451  phage transcriptional regulator, AlpA  36.84 
 
 		 76 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1062  phage transcriptional regulator, AlpA  37.25 
 
 		 75 aa  49.7  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.979085  normal  0.790745 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0909  phage transcriptional regulator, AlpA  40.35 
 
 		 65 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0638  phage transcriptional regulator, AlpA  39.06 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0720576 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4074  prophage CP4-57 transcriptional regulator protein, AlpA family  32.76 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2749  phage transcriptional regulator, AlpA  43.14 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496617  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0999  phage transcriptional regulator, AlpA  40.74 
 
 		 57 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1611  phage transcriptional regulator, AlpA  40.82 
 
 		 74 aa  46.2  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0193561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2662  Phage transcriptional regulator, AlpA  39.22 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0154  phage transcriptional regulator, AlpA  45.1 
 
 		 80 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.77914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0062  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 		 84 aa  45.4  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0683  phage transcriptional regulator, AlpA  38.46 
 
 		 69 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2372  prophage CP4-57 regulatory  34.48 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296006  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3427  phage transcriptional regulator, AlpA  38 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2398  Phage transcriptional regulator, AlpA  26.44 
 
 		 103 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0592161  normal  0.404854 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2402  prophage CP4-57 regulatory  39.29 
 
 		 86 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0128248  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2390  prophage CP4-57 regulatory protein (AlpA)  41.18 
 
 		 78 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179728  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0440  Phage transcriptional regulator, AlpA  40 
 
 		 80 aa  44.3  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0882  phage transcriptional regulator, AlpA  38.46 
 
 		 75 aa  44.3  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3999  phage transcriptional regulator, AlpA  35.09 
 
 		 73 aa  44.3  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2277  prophage CP4-57 regulatory  41.51 
 
 		 71 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0443  phage transcriptional regulator, AlpA  41.18 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.614779 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0653  phage transcriptional regulator, AlpA  37.5 
 
 		 75 aa  44.3  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0437376  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2186  prophage CP4-57 regulatory protein (AlpA)  32.14 
 
 		 85 aa  43.9  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0232094  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0434  putative prophage CP4-57 regulatory protein  41.18 
 
 		 72 aa  43.9  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0988805  normal  0.918772 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3167  phage transcriptional regulator, AlpA  37.25 
 
 		 72 aa  43.9  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.786341  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4164  phage transcriptional regulator, AlpA  32.2 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0241  phage transcriptional regulator, AlpA  39.22 
 
 		 73 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6373  phage transcriptional regulator, AlpA  41.18 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0267057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0102  phage transcriptional regulator, AlpA  43.14 
 
 		 71 aa  42.7  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.11769 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1131  phage transcriptional regulator, AlpA  32.14 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.232619  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2652  phage transcriptional regulator, AlpA  39.22 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0273  phage transcriptional regulator, AlpA  39.22 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.334205  normal  0.0643219 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2699  hypothetical protein  39.06 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000249583  hitchhiker  0.000191723 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0336  phage transcriptional regulator, AlpA  39.22 
 
 		 66 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2193  prophage CP4-57 regulatory  28.77 
 
 		 87 aa  41.6  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1751  Phage transcriptional regulator, AlpA  35.29 
 
 		 79 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.1124  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4521  phage transcriptional regulator, AlpA  39.22 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.243833 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2174  hypothetical protein  38 
 
 		 57 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1406  putative transcriptional regulator  31.82 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0384  phage transcriptional regulator, AlpA  30.77 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000580996 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3429  DNA-binding protein, putative  36.73 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000259221  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004310  phage transcriptional regulator AlpA  32.65 
 
 		 66 aa  41.2  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.207831  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0993  phage transcriptional regulator, AlpA  37.25 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000350598  decreased coverage  0.00000494305 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2255  phage transcriptional regulator, AlpA  36.73 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.379253  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3522  phage transcriptional regulator, AlpA  30.61 
 
 		 65 aa  40.4  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1625  phage transcriptional regulator, AlpA  41.86 
 
 		 77 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.807663  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4520  phage transcriptional regulator, AlpA  36.73 
 
 		 88 aa  40.4  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2725  hypothetical protein  38.64 
 
 		 48 aa  40  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>