More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0310 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0310  50S ribosomal protein L10  100 
 
 		 165 aa  321  3e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0746923  normal  0.0249908 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3036  50S ribosomal protein L10  74.85 
 
 		 168 aa  239  1e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3347  50S ribosomal protein L10  78.79 
 
 		 167 aa  238  2e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862427  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2850  50S ribosomal protein L10  72.12 
 
 		 165 aa  237  6.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.675463 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0317  50S ribosomal protein L10  72.12 
 
 		 165 aa  236  8e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00438278  normal  0.203557 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2769  50S ribosomal protein L10  72.12 
 
 		 165 aa  236  8e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0338  50S ribosomal protein L10  72.12 
 
 		 165 aa  236  8e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550948  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3437  50S ribosomal protein L10  71.52 
 
 		 165 aa  234  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3316  50S ribosomal protein L10  71.52 
 
 		 168 aa  229  9e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2969  50S ribosomal protein L10  71.52 
 
 		 168 aa  229  9e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3191  50S ribosomal protein L10  71.17 
 
 		 173 aa  226  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579756  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  66.67 
 
 		 174 aa  220  9e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3336  50S ribosomal protein L10  71.52 
 
 		 173 aa  215  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3078  50S ribosomal protein L10  73.33 
 
 		 165 aa  214  2.9999999999999998e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.892062  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2643  50S ribosomal protein L10  73.33 
 
 		 165 aa  214  4e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3788  50S ribosomal protein L10  73.33 
 
 		 165 aa  214  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166109  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1912  50S ribosomal protein L10  73.33 
 
 		 165 aa  214  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000184172  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0239  50S ribosomal protein L10  72.73 
 
 		 165 aa  213  7e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0229066 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3467  50S ribosomal protein L10  73.62 
 
 		 184 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108818  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3818  50S ribosomal protein L10  73.62 
 
 		 184 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3756  50S ribosomal protein L10  73.62 
 
 		 184 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0407684  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  61.49 
 
 		 174 aa  210  5.999999999999999e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0304  50S ribosomal protein L10  73.1 
 
 		 167 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.125975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3654  50S ribosomal protein L10  73.1 
 
 		 167 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0512272  hitchhiker  0.000000643388 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0266  50S ribosomal protein L10  71.52 
 
 		 165 aa  210  7e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.646007  normal  0.635943 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0257  50S ribosomal protein L10  71.17 
 
 		 188 aa  206  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0591157  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3453  50S ribosomal protein L10  66.88 
 
 		 174 aa  206  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0925685  normal  0.446601 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3180  50S ribosomal protein L10  72.86 
 
 		 140 aa  205  3e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000385503  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0040  50S ribosomal protein L10  66.23 
 
 		 179 aa  200  6e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0245031  hitchhiker  0.0000000000023806 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0044  50S ribosomal protein L10  66.23 
 
 		 215 aa  201  6e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000127438  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3869  50S ribosomal protein L10  63.12 
 
 		 182 aa  178  2.9999999999999997e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0586  50S ribosomal protein L10  56.88 
 
 		 177 aa  170  6.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3642  50S ribosomal protein L10  57.5 
 
 		 183 aa  170  6.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.279713 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0396  50S ribosomal protein L10  61.11 
 
 		 173 aa  166  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.252363  hitchhiker  0.00709296 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0508  50S ribosomal protein L10  54.88 
 
 		 175 aa  164  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.270625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2262  50S ribosomal protein L10  56.44 
 
 		 174 aa  164  5.9999999999999996e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168271  normal  0.476107 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4533  50S ribosomal protein L10  55.15 
 
 		 168 aa  162  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3594  50S ribosomal protein L10  54.37 
 
 		 178 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.196569  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3899  50S ribosomal protein L10  54.6 
 
 		 168 aa  161  3e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3248  50S ribosomal protein L10  54.6 
 
 		 168 aa  161  3e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4444  50S ribosomal protein L10  54.37 
 
 		 176 aa  161  4.0000000000000004e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.651473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0286  ribosomal protein L10  52.41 
 
 		 166 aa  159  1e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0147275  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0317  50S ribosomal protein L10  49.35 
 
 		 173 aa  150  8.999999999999999e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.146286  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0488  50S ribosomal protein L10  49.35 
 
 		 173 aa  150  8.999999999999999e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.169718  hitchhiker  0.00000169108 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0385  50S ribosomal protein L10  50.32 
 
 		 177 aa  149  1e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0360  50S ribosomal protein L10  50.32 
 
 		 177 aa  149  1e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4285  ribosomal protein L10  45.78 
 
 		 166 aa  141  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000716484  hitchhiker  0.000000472968 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  47.47 
 
 		 174 aa  140  6e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4771  50S ribosomal protein L10  44.91 
 
 		 164 aa  140  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.709091  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0175  50S ribosomal protein L10  45.45 
 
 		 165 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220587  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4699  50S ribosomal protein L10  46.39 
 
 		 166 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000246782  hitchhiker  0.00000548606 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1064  50S ribosomal protein L10  55.48 
 
 		 175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0220515  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4557  50S ribosomal protein L10  45.18 
 
 		 166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.669843  decreased coverage  0.0090203 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5088  50S ribosomal protein L10  45.18 
 
 		 166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000128873  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  47.95 
 
 		 174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00227  50S ribosomal protein L10  44.91 
 
 		 178 aa  138  3.9999999999999997e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0617  ribosomal protein L10  44.58 
 
 		 166 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.532211  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0314  ribosomal protein L10  46.1 
 
 		 175 aa  136  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000329441  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0222  50S ribosomal protein L10  46.99 
 
 		 166 aa  136  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0190  50S ribosomal protein L10  46.99 
 
 		 166 aa  136  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000262315  hitchhiker  0.00315877 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0185  50S ribosomal protein L10  46.99 
 
 		 166 aa  136  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000592329  normal  0.0118628 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0190  50S ribosomal protein L10  46.99 
 
 		 166 aa  136  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000177262  hitchhiker  0.000758972 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4065  50S ribosomal protein L10  46.99 
 
 		 166 aa  136  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000275908  hitchhiker  0.00991378 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0187  50S ribosomal protein L10  46.99 
 
 		 166 aa  136  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000330294  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3768  50S ribosomal protein L10  46.99 
 
 		 166 aa  136  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000062266  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0191  50S ribosomal protein L10  46.99 
 
 		 166 aa  136  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000192331  hitchhiker  0.000568378 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0149  50S ribosomal protein L10  44.85 
 
 		 165 aa  135  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000191294  normal  0.034689 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002171  LSU ribosomal protein L10p (P0)  43.71 
 
 		 164 aa  135  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000109594  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  46.67 
 
 		 172 aa  135  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4473  50S ribosomal protein L10  46.99 
 
 		 166 aa  136  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04532  50S ribosomal protein L10  45.86 
 
 		 177 aa  135  4e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.165522  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0922  50S ribosomal protein L10  47.37 
 
 		 176 aa  134  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00116615  hitchhiker  0.00000161737 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0161  50S ribosomal protein L10  45.78 
 
 		 166 aa  134  4e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000494732  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0171  50S ribosomal protein L10  45.78 
 
 		 163 aa  134  4e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0111095  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0275  50S ribosomal protein L10  44.24 
 
 		 165 aa  134  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000206065  normal  0.0858323 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0596  50S ribosomal protein L10  46.71 
 
 		 172 aa  134  5e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0140503  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0867  50S ribosomal protein L10  48.3 
 
 		 175 aa  133  9e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0204  50S ribosomal protein L10  45.78 
 
 		 166 aa  133  9e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000122994  hitchhiker  0.000100039 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4326  50S ribosomal protein L10  43.98 
 
 		 166 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000437071  unclonable  0.0000000000820773 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2868  50S ribosomal protein L10  44.31 
 
 		 164 aa  133  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000140329  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3733  50S ribosomal protein L10  44.24 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3887  50S ribosomal protein L10  44.24 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.452938  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0139  50S ribosomal protein L10  45.18 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000054937  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0203  50S ribosomal protein L10  44.24 
 
 		 165 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0744309  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0208  50S ribosomal protein L10  44.24 
 
 		 165 aa  131  5e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000217712  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0747  50S ribosomal protein L10  44.59 
 
 		 178 aa  130  6.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0329012  normal  0.965103 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03861  50S ribosomal protein L10  43.64 
 
 		 165 aa  130  7.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000311393  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4010  ribosomal protein L10  43.64 
 
 		 165 aa  130  7.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000237202  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4433  50S ribosomal protein L10  43.64 
 
 		 165 aa  130  7.999999999999999e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000818528  hitchhiker  0.00000264015 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03814  hypothetical protein  43.64 
 
 		 165 aa  130  7.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360524  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2728  50S ribosomal protein L10  44.24 
 
 		 162 aa  130  7.999999999999999e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000179395  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4525  50S ribosomal protein L10  43.64 
 
 		 165 aa  130  7.999999999999999e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111294  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4218  50S ribosomal protein L10  43.64 
 
 		 165 aa  130  7.999999999999999e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.4618e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4473  50S ribosomal protein L10  43.64 
 
 		 165 aa  130  7.999999999999999e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239877  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5450  50S ribosomal protein L10  43.64 
 
 		 165 aa  130  7.999999999999999e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000850473  hitchhiker  0.000626343 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4040  50S ribosomal protein L10  43.64 
 
 		 165 aa  130  7.999999999999999e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00830699  hitchhiker  0.000887574 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0195  50S ribosomal protein L10  43.64 
 
 		 165 aa  130  9e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000187486  normal  0.229046 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2108  50S ribosomal protein L10  41.57 
 
 		 175 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000349119  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06150  50S ribosomal protein L10  43.37 
 
 		 166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3448  ribosomal protein L10  43.71 
 
 		 167 aa  129  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000199113  hitchhiker  0.00604494 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>