More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0350 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_0350  hypothetical protein  100 
 
 
336 aa  676  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2466  hypothetical protein  81 
 
 
321 aa  504  1e-142  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5203  hypothetical protein  70 
 
 
332 aa  431  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3086  hypothetical protein  63.33 
 
 
332 aa  394  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  46.33 
 
 
328 aa  296  3e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  46.33 
 
 
328 aa  296  4e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  45.51 
 
 
328 aa  278  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  46.84 
 
 
331 aa  277  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  42.99 
 
 
336 aa  273  2e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  41.39 
 
 
331 aa  273  4e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  43.79 
 
 
335 aa  272  8e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  45 
 
 
339 aa  271  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  44.88 
 
 
327 aa  270  3e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  41.16 
 
 
328 aa  268  7e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  43.61 
 
 
328 aa  268  1e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  43.93 
 
 
326 aa  268  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  46.86 
 
 
323 aa  268  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  43.19 
 
 
339 aa  267  2e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  42.05 
 
 
324 aa  266  3e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0847  hypothetical protein  45.02 
 
 
331 aa  266  3e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.318374  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  41.39 
 
 
325 aa  265  9e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  41.2 
 
 
330 aa  264  2e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  41.2 
 
 
330 aa  264  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  42.42 
 
 
349 aa  263  3e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  40.12 
 
 
344 aa  263  3e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  43.85 
 
 
323 aa  261  9e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  41.91 
 
 
330 aa  261  1e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  42.59 
 
 
323 aa  261  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  41.91 
 
 
330 aa  261  1e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  43 
 
 
330 aa  260  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  40.36 
 
 
332 aa  260  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  43.93 
 
 
327 aa  259  5e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  41.39 
 
 
328 aa  258  7e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  42.77 
 
 
358 aa  258  8e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  42.47 
 
 
335 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  42.52 
 
 
324 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  42.38 
 
 
326 aa  257  2e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  42 
 
 
322 aa  256  4e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  41.86 
 
 
321 aa  255  6e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  40.57 
 
 
336 aa  255  6e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3122  hypothetical protein  42.05 
 
 
343 aa  254  1e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00641753  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  41.64 
 
 
360 aa  254  2e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  40 
 
 
325 aa  254  2e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  40.78 
 
 
339 aa  254  2e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  40 
 
 
327 aa  253  2e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  41.75 
 
 
334 aa  253  3e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  2.18374e-05 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  44.22 
 
 
355 aa  252  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  42.32 
 
 
326 aa  252  6e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  43.17 
 
 
339 aa  252  7e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  39.26 
 
 
331 aa  252  8e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  39.26 
 
 
331 aa  251  1e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  40.73 
 
 
327 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0265  hypothetical protein  42.62 
 
 
323 aa  250  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  39.87 
 
 
322 aa  250  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  41.58 
 
 
337 aa  249  3e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  42.28 
 
 
325 aa  249  4e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  7.81341e-10 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  41.86 
 
 
322 aa  249  5e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  41.1 
 
 
325 aa  248  7e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  40.31 
 
 
325 aa  248  7e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  41.07 
 
 
348 aa  249  7e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  43.26 
 
 
334 aa  248  8e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  39.2 
 
 
331 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  40.19 
 
 
334 aa  247  2e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  43.93 
 
 
333 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  40.94 
 
 
328 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  40.36 
 
 
330 aa  246  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  40.06 
 
 
346 aa  246  3e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  38.62 
 
 
334 aa  246  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  37.5 
 
 
335 aa  246  5e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  40 
 
 
345 aa  245  6e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  40.33 
 
 
343 aa  245  6e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  40 
 
 
345 aa  245  6e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  41.23 
 
 
324 aa  245  8e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  40.4 
 
 
334 aa  245  9e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  40.46 
 
 
304 aa  244  1e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2668  hypothetical protein  40.25 
 
 
336 aa  244  1e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  39.34 
 
 
337 aa  244  1e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  40 
 
 
314 aa  244  1e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  42.86 
 
 
353 aa  244  2e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  41.61 
 
 
328 aa  243  2e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5060  hypothetical protein  41.14 
 
 
331 aa  243  2e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  41.06 
 
 
325 aa  243  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5968  hypothetical protein  41.18 
 
 
344 aa  243  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  40.31 
 
 
332 aa  243  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3347  hypothetical protein  35.91 
 
 
330 aa  243  3e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261888  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  42.02 
 
 
310 aa  243  3e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2198  hypothetical protein  39.69 
 
 
331 aa  243  4e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000306315  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1904  hypothetical protein  38.63 
 
 
326 aa  243  4e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  43.69 
 
 
386 aa  243  4e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  38.82 
 
 
318 aa  242  6e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  39.67 
 
 
356 aa  242  6e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3665  hypothetical protein  42.62 
 
 
326 aa  242  6e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155683  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  41.03 
 
 
322 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  38.24 
 
 
324 aa  241  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2777  hypothetical protein  41.01 
 
 
322 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.89737  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  39.76 
 
 
336 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  39.74 
 
 
324 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  37.46 
 
 
335 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3056  hypothetical protein  39.74 
 
 
332 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176831  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2820  hypothetical protein  43 
 
 
359 aa  239  3e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.407557  normal  0.294179 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>