208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_0909 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0909  Aromatic-L-amino-acid decarboxylase  100 
 
 
486 aa  1016    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0883  Aromatic-L-amino-acid decarboxylase  99.38 
 
 
486 aa  1011    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2160  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  57.81 
 
 
479 aa  590  1e-167  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.222222  normal  0.771411 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3209  Pyridoxal-dependent decarboxylase  46.27 
 
 
579 aa  463  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2552  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  42.95 
 
 
470 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00803752 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3163  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  42.44 
 
 
478 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.491116  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1238  Pyridoxal-dependent decarboxylase  42.14 
 
 
486 aa  396  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1738  Pyridoxal-dependent decarboxylase  41.54 
 
 
474 aa  392  1e-108  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2223  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  42.11 
 
 
470 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0898505  normal  0.960692 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5685  Aromatic-L-amino-acid decarboxylase  45.26 
 
 
462 aa  392  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.025144  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2788  aromatic amino acid decarboxylase  42.26 
 
 
471 aa  384  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2867  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  42.26 
 
 
471 aa  385  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1334  aromatic amino acid decarboxylase  42.05 
 
 
471 aa  382  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1832  Pyridoxal-dependent decarboxylase  41.42 
 
 
475 aa  382  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.536749  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1957  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  40.25 
 
 
476 aa  381  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3364  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  42.35 
 
 
470 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.792573  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3466  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  39.83 
 
 
470 aa  369  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.811665  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0071  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  39.25 
 
 
474 aa  370  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.621553  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1126  Aromatic-L-amino-acid decarboxylase  41.05 
 
 
471 aa  365  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0279279 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1428  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  40.25 
 
 
476 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND00950  Aromatic-L-amino-acid decarboxylase, putative  37.6 
 
 
515 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.435109  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1409  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  38.36 
 
 
478 aa  331  2e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.557357  hitchhiker  0.0000101933 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3501  pyridoxal-dependent decarboxylase  36.92 
 
 
464 aa  321  1.9999999999999998e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00371632 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10299  aromatic-L-amino-acid decarboxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G02240)  33.84 
 
 
526 aa  300  4e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2555  decarboxylase, pyridoxal-dependent  27.16 
 
 
484 aa  242  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000100435 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2734  decarboxylase, pyridoxal-dependent  26.32 
 
 
484 aa  236  9e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08514e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2539  decarboxylase, pyridoxal-dependent  26.32 
 
 
484 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2724  decarboxylase, pyridoxal-dependent  26.32 
 
 
484 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04970  decarboxylase, pyridoxal-dependent  29.92 
 
 
479 aa  233  5e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.421495  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2983  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  30.81 
 
 
496 aa  224  3e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4339  Pyridoxal-dependent decarboxylase  29.24 
 
 
517 aa  222  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.843861  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0934  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.57 
 
 
466 aa  210  6e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000000218274  decreased coverage  0.000132275 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5531  putative pyridoxal-dependent decarboxylase  30.8 
 
 
502 aa  208  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.245703 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1102  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.23 
 
 
492 aa  206  6e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.967255  normal  0.206901 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4871  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.95 
 
 
486 aa  203  7e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16102  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4065  Pyridoxal-dependent decarboxylase  25.77 
 
 
529 aa  197  3e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.125159  normal  0.183613 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1305  Pyridoxal-dependent decarboxylase  25.63 
 
 
480 aa  197  4.0000000000000005e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2916  Aromatic-L-amino-acid decarboxylase  26.53 
 
 
510 aa  196  8.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.122607 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1124  aromatic amino acid decarboxylase, putative  25.81 
 
 
491 aa  194  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2115  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  26.07 
 
 
489 aa  194  2e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1334  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.18 
 
 
497 aa  194  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2157  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.7 
 
 
479 aa  193  5e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0114  Pyridoxal-dependent decarboxylase  28.63 
 
 
480 aa  185  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.15522  normal  0.0242531 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3338  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  29.36 
 
 
492 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133892  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4283  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.12 
 
 
486 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4177  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.07 
 
 
484 aa  179  8e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.51833  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4944  Pyridoxal-dependent decarboxylase  27.68 
 
 
486 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.326969  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1038  aromatic-L-amino-acid decarboxylase  28.79 
 
 
483 aa  177  3e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2266  Pyridoxal-dependent decarboxylase  29.13 
 
 
517 aa  170  5e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.981708  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1282  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.78 
 
 
477 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0743  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.42 
 
 
489 aa  160  5e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0590  putative L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  23.22 
 
 
484 aa  156  9e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.126403  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3330  Pyridoxal-dependent decarboxylase  28.21 
 
 
503 aa  154  5e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.405304  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1055  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.06 
 
 
530 aa  149  8e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0285  pyridoxal-dependent decarboxylase  24.6 
 
 
529 aa  148  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5923  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.16 
 
 
483 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520992  normal  0.358507 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2647  pyridoxal-dependent decarboxylase  31.83 
 
 
478 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.88616  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1440  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.03 
 
 
474 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.108677 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2835  Pyridoxal-dependent decarboxylase  24.24 
 
 
507 aa  143  8e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.579316  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2531  Pyridoxal-dependent decarboxylase  27.23 
 
 
460 aa  143  9e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00114613  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2838  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  24.72 
 
 
522 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0758155  normal  0.28501 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2413  Pyridoxal-dependent decarboxylase  28.26 
 
 
459 aa  139  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.190091 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3049  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.46 
 
 
471 aa  139  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1074  Pyridoxal-dependent decarboxylase  25.29 
 
 
551 aa  139  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0179371  normal  0.433316 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2448  pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein  24.47 
 
 
515 aa  139  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1171  pyridoxal-dependent decarboxylase  24.73 
 
 
475 aa  138  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0333328 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1241  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.56 
 
 
466 aa  138  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2547  pyridoxal-dependent decarboxylase  24.47 
 
 
515 aa  138  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3190  pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein  24.47 
 
 
515 aa  138  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.399603  normal  0.0148161 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2702  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.98 
 
 
463 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.146813  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2746  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.98 
 
 
463 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0606  non-ribosomal peptide synthetase module-containing protein  25.62 
 
 
462 aa  137  5e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.902571  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16491  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  28.2 
 
 
470 aa  137  5e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.360036 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10619  glutamate decarboxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11120)  26.65 
 
 
577 aa  136  7.000000000000001e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0303168  normal  0.118033 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2732  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.98 
 
 
463 aa  136  8e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.238333 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0076  Pyridoxal-dependent decarboxylase  28.12 
 
 
458 aa  136  9e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3459  pyridoxal-dependent decarboxylase  23.67 
 
 
511 aa  136  9e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0060  Pyridoxal-dependent decarboxylase  24.24 
 
 
465 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.474391 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2310  L-2,4-diaminobutyrate decarboxylase  27.65 
 
 
489 aa  136  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.506086  normal  0.726788 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7120  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.57 
 
 
466 aa  136  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00363554  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2740  pyridoxal-dependent decarboxylase  24.21 
 
 
530 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.14205  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6192  Pyridoxal-dependent decarboxylase  28.34 
 
 
492 aa  134  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.478239  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55334  glutamate decarboxylase 2  26.27 
 
 
507 aa  134  5e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0178  Pyridoxal-dependent decarboxylase  25.17 
 
 
462 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2925  Pyridoxal-dependent decarboxylase  25.61 
 
 
470 aa  131  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3171  pyridoxal-dependent decarboxylase  23.9 
 
 
505 aa  131  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.902274  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4221  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.61 
 
 
488 aa  130  5.0000000000000004e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.488782 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4529  pyridoxal-dependent decarboxylase  26.85 
 
 
350 aa  130  6e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2551  pyridoxal-dependent decarboxylase  23.48 
 
 
534 aa  129  9.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.547739 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4423  pyridoxal-dependent decarboxylase  23.36 
 
 
473 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.904496 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2033  pyridoxal-dependent decarboxylase  27 
 
 
490 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.376208  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03010  PLP-dependent enzyme, glutamate decarboxylase  23.98 
 
 
442 aa  129  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1168  Pyridoxal-dependent decarboxylase  23.94 
 
 
482 aa  127  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4295  Pyridoxal-dependent decarboxylase  21.49 
 
 
508 aa  128  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000243421 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2354  Pyridoxal-dependent decarboxylase  24.02 
 
 
495 aa  127  7e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0161317  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3871  pyridoxal-dependent decarboxylase  23.01 
 
 
480 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2418  pyridoxal-dependent decarboxylase  24.15 
 
 
490 aa  126  8.000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000894226  normal  0.0292471 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1409  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.57 
 
 
474 aa  125  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2059  Pyridoxal-dependent decarboxylase  24.28 
 
 
495 aa  125  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00190827  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1181  Pyridoxal-dependent decarboxylase  24.75 
 
 
464 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.823264 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>