More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4532 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4532  RNP-1 like RNA-binding protein  100 
 
 
98 aa  203  6e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.319676 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4705  RNP-1 like RNA-binding protein  82.47 
 
 
99 aa  170  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.433444  normal  0.441649 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1118  RNP-1 like RNA-binding protein  79.8 
 
 
101 aa  148  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.761285  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4663  RNP-1 like RNA-binding protein  73.74 
 
 
101 aa  142  1e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  79.27 
 
 
111 aa  140  5e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0027  RNA-binding region RNP-1  73.96 
 
 
99 aa  140  7e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.128331  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1984  RNA-binding region RNP-1  77.65 
 
 
109 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4702  RNA-binding region RNP-1  72.92 
 
 
102 aa  139  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000166798  normal  0.614105 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0128  RNA-binding region RNP-1  78.31 
 
 
103 aa  136  7.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0974  RNA-binding region RNP-1  80.49 
 
 
103 aa  135  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.02422  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3132  RNA-binding region RNP-1  77.11 
 
 
103 aa  135  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4044  RNP-1 like RNA-binding protein  76.83 
 
 
102 aa  133  8e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4701  RNA-binding region RNP-1  73.26 
 
 
97 aa  132  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000966249  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0656  RNP-1 like RNA-binding protein  65.56 
 
 
110 aa  130  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.827058 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0341  RNP-1 like RNA-binding protein  67.03 
 
 
94 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0348  RNP-1 like RNA-binding protein  67.03 
 
 
94 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1863  RNA-binding region RNP-1  71.26 
 
 
89 aa  127  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.253261  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1670  RNP-1 like RNA-binding protein  63 
 
 
105 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1050  RNP-1 like RNA-binding protein  60.42 
 
 
98 aa  123  9e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1079  RNP-1 like RNA-binding protein  60.42 
 
 
98 aa  123  9e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000508915  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1679  RNA-binding region RNP-1  68.54 
 
 
94 aa  122  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1345  RNP-1 like RNA-binding protein  59.8 
 
 
104 aa  120  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1552  RNP-1 like RNA-binding protein  61.22 
 
 
92 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.863608 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1525  RNP-1 like RNA-binding protein  61.22 
 
 
92 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4642  RNA-binding region RNP-1  75.58 
 
 
102 aa  118  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0167628  normal  0.0600558 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  68.29 
 
 
99 aa  117  7.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1999  RNA-binding region RNP-1  57.89 
 
 
95 aa  115  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0252  RNP-1 like RNA-binding protein  64.56 
 
 
90 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.313784 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4357  RNP-1 like RNA-binding protein  60.2 
 
 
97 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1085  RNP-1 like RNA-binding protein  56.84 
 
 
96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.239557 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0679  RNA-binding region RNP-1  73.17 
 
 
107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09671  RNA-binding protein RbpD  59.26 
 
 
104 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11941  peptidylprolyl isomerase  49.48 
 
 
97 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.408542  normal  0.27768 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2851  RNP-1 like RNA-binding protein  61.22 
 
 
97 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00131  RNA recognition motif-containing protein  56.25 
 
 
202 aa  98.2  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00131  RNA recognition motif-containing protein  53.75 
 
 
245 aa  98.6  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00821888 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1510  RNA recognition motif-containing protein  52.5 
 
 
81 aa  97.8  4e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.206818  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1645  RNA recognition motif-containing protein  56.96 
 
 
95 aa  96.7  9e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1404  RNA-binding region RNP-1  56.96 
 
 
95 aa  96.3  1e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.187524  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0014  RNA recognition motif-containing protein  53.75 
 
 
173 aa  96.3  1e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00121  RNA recognition motif-containing protein  53.75 
 
 
250 aa  94.7  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0705626  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1340  RNA recognition motif-containing protein  53.75 
 
 
250 aa  94.7  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0014  RNA-binding region RNP-1  55 
 
 
196 aa  95.1  3e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0890039  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00121  RNA recognition motif-containing protein  53.75 
 
 
222 aa  93.2  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.239184  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3646  RNP-1 like RNA-binding protein  53.41 
 
 
115 aa  92.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170125  normal  0.308444 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1059  RNA recognition motif-containing protein  51.25 
 
 
82 aa  92.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19341  hypothetical protein  51.25 
 
 
82 aa  92.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.39481  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1392  RNP-1 like RNA-binding protein  50.59 
 
 
89 aa  92.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000190115  unclonable  0.00000764419 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2119  RNP-1 like RNA-binding protein  50.6 
 
 
90 aa  91.7  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1551  RNA recognition motif-containing protein  51.81 
 
 
90 aa  91.7  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000189829  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1499  RNA-binding region RNP-1  45.26 
 
 
100 aa  91.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212691  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1236  RNP-1 like RNA-binding protein  50.6 
 
 
90 aa  91.3  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.05811 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0013  RNA-binding region RNP-1 (RNA recognition motif)  51.25 
 
 
222 aa  90.9  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2264  RNP-1 like RNA-binding protein  54.22 
 
 
101 aa  89.7  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683035  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1175  RNA-binding region RNP-1  55 
 
 
114 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00471275  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0493  RNP-1 like RNA-binding protein  57.5 
 
 
88 aa  88.6  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.547596  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00121  RNA recognition motif-containing protein  48.75 
 
 
217 aa  89  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.044748  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0980  RNA-binding region RNP-1  50 
 
 
81 aa  88.6  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.000651233  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3805  RNA-binding region RNP-1  50.62 
 
 
162 aa  88.6  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.169382 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1587  RNP-1 like RNA-binding protein  53.09 
 
 
146 aa  88.6  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2020  RNP-1 like RNA-binding protein  55.42 
 
 
88 aa  87.8  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000000834021  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0186  RNP-1 like RNA-binding protein  53.09 
 
 
157 aa  87.8  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2100  RNP-1 like RNA-binding protein  48.19 
 
 
90 aa  87  7e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1489  RNP-1 like RNA-binding protein  54.88 
 
 
86 aa  87  8e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  unclonable  0.0000000000203081 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00121  RNA recognition motif-containing protein  48.1 
 
 
203 aa  87  8e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.3683  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0319  RNP-1 like RNA-binding protein  49.38 
 
 
137 aa  86.3  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0803  RNP-1 like RNA-binding protein  50.6 
 
 
85 aa  84.7  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1024  RNP-1 like RNA-binding protein  55.7 
 
 
89 aa  84.7  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.107096  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0251  RNA-binding protein, RNP-1  52.56 
 
 
107 aa  85.1  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.425967  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2141  RNP-1-like RNA-binding protein  48.86 
 
 
116 aa  84.7  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.55091 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2364  RNP-1 like RNA-binding protein  54.02 
 
 
89 aa  84.7  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000400721  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1010  RNA-binding protein  54.43 
 
 
95 aa  84.3  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04600  single-stranded DNA binding protein, putative  41.98 
 
 
441 aa  83.6  8e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2093  RNP-1 like RNA-binding protein  53.25 
 
 
91 aa  83.6  8e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1273  RNP-1 like RNA-binding protein  45.57 
 
 
90 aa  82.8  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000138361  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1023  RNA recognition motif-containing protein  45.78 
 
 
90 aa  82.8  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024568  normal  0.0362085 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1038  RNP-1 like RNA-binding protein  46.32 
 
 
98 aa  82.8  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1753  RNP-1 like RNA-binding protein  49.41 
 
 
87 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.787076 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0793  RNA-binding region RNP-1  50 
 
 
87 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000000424033  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0050  RNP-1 like RNA-binding protein  48.78 
 
 
88 aa  81.6  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2332  RNP-1 like RNA-binding protein  46.91 
 
 
108 aa  80.9  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.200874 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1806  RNP-1 like RNA-binding protein  47.73 
 
 
90 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2964  RNP-1 like RNA-binding protein  52.44 
 
 
88 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1471  RNP-1 like RNA-binding protein  46.25 
 
 
104 aa  80.1  0.000000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0175415  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0127  RNP-1 like RNA-binding protein  45.45 
 
 
90 aa  79.7  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00042932  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4781  RNP-1-like RNA-binding protein  46.91 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0195  RNP-1 like RNA-binding protein  52.56 
 
 
88 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00308169 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4579  RNP-1 like RNA-binding protein  44.44 
 
 
148 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_8269  predicted protein  48.72 
 
 
77 aa  79.3  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4731  RNP-1 like RNA-binding protein  44.44 
 
 
150 aa  78.2  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384433  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6047  RNP-1 like RNA-binding protein  45.68 
 
 
176 aa  78.6  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240011  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2769  RNA-binding protein, RNP-1  41.94 
 
 
119 aa  78.2  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000135251  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15501  RNA-binding protein RbpD  43.21 
 
 
96 aa  78.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6046  RNP-1 like RNA-binding protein  48.15 
 
 
124 aa  78.6  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.35961  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0084  RNP-1 like RNA-binding protein  47.56 
 
 
122 aa  78.6  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000718119  unclonable  0.00000880793 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4780  RNP-1-like RNA-binding protein  45.68 
 
 
123 aa  77.8  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5290  RNP-1 like RNA-binding protein  45.68 
 
 
181 aa  77.8  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0150  RNP-1 like RNA-binding protein  45.68 
 
 
175 aa  77.8  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1932  RNP-1 like RNA-binding protein  44.44 
 
 
132 aa  77  0.00000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0944  RNP-1 like RNA-binding protein  48.19 
 
 
117 aa  77  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>