39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4213 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4213  O-antigen polymerase  100 
 
 		 430 aa  852    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.144935  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4577  O-antigen polymerase  27.54 
 
 		 480 aa  145  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3597  O-antigen polymerase  27.75 
 
 		 438 aa  123  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.312058 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3351  O-antigen polymerase  27.62 
 
 		 444 aa  121  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0765  O-antigen polymerase  30.97 
 
 		 442 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1285  O-antigen polymerase  27.11 
 
 		 418 aa  109  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1314  O-antigen polymerase  26.85 
 
 		 418 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0134  hypothetical protein  27.92 
 
 		 435 aa  85.1  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.74095  normal  0.279508 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3018  O-antigen polymerase  34.15 
 
 		 446 aa  66.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1297  hypothetical protein  28.68 
 
 		 444 aa  64.7  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.289978  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1077  O-antigen polymerase  26.48 
 
 		 433 aa  59.7  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.9264  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1310  hypothetical protein  23.39 
 
 		 439 aa  58.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2299  hypothetical protein  23.44 
 
 		 424 aa  57  0.0000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.590409  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0063  O-antigen polymerase  30.82 
 
 		 531 aa  55.1  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0639643 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21831  hypothetical protein  23.81 
 
 		 439 aa  53.1  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.285408 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2670  hypothetical protein  28.46 
 
 		 425 aa  50.8  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.131305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4678  O-antigen polymerase  43.06 
 
 		 544 aa  50.8  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002359  lipid A core-O-antigen ligase  25.44 
 
 		 561 aa  50.1  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3942  O-antigen polymerase  32.46 
 
 		 506 aa  50.1  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471657 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2811  hypothetical protein  26.94 
 
 		 597 aa  49.3  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  25.97 
 
 		 428 aa  49.3  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18371  hypothetical protein  28.68 
 
 		 443 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4227  O-antigen polymerase  23.94 
 
 		 457 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4286  inorganic carbon transporter  23.94 
 
 		 457 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0357  inorganic carbon transporter  30.32 
 
 		 467 aa  48.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.152421  normal  0.510876 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30011  hypothetical protein  28.57 
 
 		 437 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.562127 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3326  O-antigen polymerase  23.77 
 
 		 502 aa  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13891  hypothetical protein  22.48 
 
 		 416 aa  47.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4268  O-antigen polymerase  26.71 
 
 		 503 aa  47.4  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0142  O-antigen polymerase  30.69 
 
 		 496 aa  47  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3256  O-antigen polymerase  29.93 
 
 		 1025 aa  46.6  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.711295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03709  hypothetical protein  23.25 
 
 		 594 aa  45.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1186  Tetratricopeptide domain protein  33.64 
 
 		 829 aa  45.4  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0301041  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4672  O-antigen polymerase  32.97 
 
 		 503 aa  43.9  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5389  O-antigen polymerase (wzy)  27.06 
 
 		 405 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.933006  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0234  O-antigen polymerase  31.06 
 
 		 402 aa  43.5  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4110  O-antigen polymerase  31.16 
 
 		 930 aa  43.5  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0108  exopolysaccharide production protein, putative  28.16 
 
 		 441 aa  43.5  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1691  O-antigen polymerase  26.58 
 
 		 512 aa  43.1  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121195  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>