More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1469 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1469  single-strand binding protein  100 
 
 		 121 aa  244  4e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.254699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1462  single-stranded DNA-binding protein  70.09 
 
 		 120 aa  170  5.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000000299636  hitchhiker  0.000565917 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1149  single-stranded DNA-binding protein  66.67 
 
 		 119 aa  167  4e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499901 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0865  single-strand-binding protein  69.72 
 
 		 120 aa  159  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0459658  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1200  single-stranded DNA-binding protein  65.42 
 
 		 129 aa  150  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20751  single-stranded DNA-binding protein  65.42 
 
 		 129 aa  150  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.156801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01781  single-stranded DNA-binding protein  63.39 
 
 		 128 aa  150  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0148  single-stranded DNA-binding protein  61.86 
 
 		 125 aa  149  8.999999999999999e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0104  single-stranded DNA-binding protein  60.17 
 
 		 125 aa  146  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4131  single-strand binding protein  60.34 
 
 		 122 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4171  single-strand binding protein  60.34 
 
 		 122 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000225771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3392  single-strand binding protein  57.14 
 
 		 123 aa  143  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.196775 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0301  single-stranded DNA-binding protein  63.55 
 
 		 120 aa  140  4e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17491  single-stranded DNA-binding protein  58.88 
 
 		 127 aa  140  7e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.932532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18331  single-stranded DNA-binding protein  57.94 
 
 		 123 aa  137  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18151  single-stranded DNA-binding protein  57.94 
 
 		 124 aa  137  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.472056  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1716  single-stranded DNA-binding protein  57.01 
 
 		 133 aa  135  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18121  single-stranded DNA-binding protein  55.96 
 
 		 123 aa  135  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  hitchhiker  0.00558651  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0119  single-strand binding protein  48.18 
 
 		 127 aa  110  8.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5420  single-strand binding protein  46.23 
 
 		 135 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2617  single-strand binding protein  35.24 
 
 		 224 aa  83.6  8e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000158869  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16725  predicted protein  33.91 
 
 		 115 aa  82  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2020  single-strand binding protein  38.32 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00175419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5984  single-strand binding protein  35.19 
 
 		 171 aa  80.9  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  34.65 
 
 		 174 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4439  single-strand binding protein  37.74 
 
 		 170 aa  77.4  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10587  predicted protein  34.96 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0851904  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1545  single-strand binding protein  34.82 
 
 		 166 aa  77  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00898888  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0242  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  36.13 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.916441  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1771  single-strand binding protein  32.76 
 
 		 138 aa  75.1  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0689148  normal  0.0680563 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1132  single-stranded DNA-binding protein  39.81 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3951  single-strand binding protein  34.74 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3808  single-strand binding protein  34.74 
 
 		 163 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39281  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3865  single-strand binding protein  32.08 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2690  single-strand binding protein  32.08 
 
 		 172 aa  72  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0960941  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2049  single-strand binding protein  30.17 
 
 		 138 aa  72  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0114  single-stranded DNA-binding protein (SSB)  33.96 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2378  single-strand binding protein  30.95 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.14117e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0535  single-strand binding protein  29.63 
 
 		 220 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3307  single-strand binding protein  33.04 
 
 		 167 aa  70.9  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.358097  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4025  single-strand binding protein  29.63 
 
 		 231 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000941126  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0450  single-strand binding protein  33.06 
 
 		 188 aa  70.9  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544035  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3926  single-strand binding protein  33.68 
 
 		 156 aa  70.5  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3710  single-strand binding protein  28.07 
 
 		 242 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000568362  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0640  single-strand binding protein  29.63 
 
 		 225 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000164603  unclonable  0.0000000189971 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1321  single-strand binding protein  30 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443248  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2281  single-strand binding protein  30 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134741  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1958  single-strand binding protein  33.07 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000182579  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2626  single-strand binding protein  34.96 
 
 		 176 aa  70.1  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.377428  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  35.85 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  33.64 
 
 		 173 aa  69.7  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1705  single-strand binding protein  30 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.17313e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  33.94 
 
 		 159 aa  68.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2288  single-strand binding protein  30.91 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  33.94 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0813  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 180 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.307719 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0351  single-stranded DNA-binding protein  33.64 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0967385  normal  0.582722 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1124  single-strand binding protein  32.11 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1019  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0415033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0027  single-strand binding protein  31.36 
 
 		 175 aa  67.8  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664632  normal  0.0441795 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0817  single-strand binding protein  31.82 
 
 		 188 aa  67  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  33.96 
 
 		 149 aa  67  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03522  Single-strand binding protein (SSB) (Helix-destabilizing protein)  31.58 
 
 		 161 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.721181  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03473  hypothetical protein  31.58 
 
 		 161 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.953641  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1992  single-strand binding protein  32.08 
 
 		 230 aa  67  0.00000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000347052  decreased coverage  0.0000711736 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1214  single-stranded DNA-binding protein  36.79 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.589073  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0166  single-strand binding protein  39.24 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000052118  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3401  single-strand binding protein  31.36 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  normal  0.54881 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0652  single-stranded DNA-binding protein  36.79 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0952  single-stranded DNA-binding protein  38.32 
 
 		 175 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0107  single-strand binding protein  31.86 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0655467  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1089  single-stranded DNA-binding protein  36.79 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3819  single-strand binding protein  30.16 
 
 		 175 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.131469  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4370  single-strand binding protein  32.41 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000199018  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  33.02 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2388  single-strand binding protein  29.36 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.875154 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  30.48 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  32.11 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0555  single-strand binding protein  31.78 
 
 		 183 aa  64.7  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0828  single-strand binding protein  34.78 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00178667  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0779  single-strand binding protein  33.93 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  31.25 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00235  single-strand binding protein  31.43 
 
 		 196 aa  64.3  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.508026  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1683  putative single-strand binding protein  30.51 
 
 		 213 aa  64.3  0.0000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0484  single-strand binding protein  30.25 
 
 		 176 aa  64.3  0.0000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759205  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1586  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  36.19 
 
 		 188 aa  64.3  0.0000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0327  single-strand binding protein  29.09 
 
 		 201 aa  64.3  0.0000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00747942  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4713  single-strand binding protein  31.53 
 
 		 187 aa  64.3  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0379  single-strand binding protein  31.82 
 
 		 184 aa  63.5  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.806317  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1729  single-stranded DNA binding protein  29.91 
 
 		 149 aa  63.5  0.0000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0980  single-strand binding protein  31.5 
 
 		 136 aa  63.5  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  33.02 
 
 		 147 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  31.13 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  33.64 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1606  single stranded DNA-binding protein  35.78 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.597102  normal  0.594419 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1997  amino acid carrier protein AlsT  36.79 
 
 		 175 aa  63.5  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.473255  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3665  single-strand binding protein  31.37 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4323  single-strand binding protein  29.31 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0296  single-strand binding protein  30.63 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.170779 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  29.91 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>