More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1385 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1385  Patatin  100 
 
 		 424 aa  847    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.858901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1198  patatin  47.71 
 
 		 394 aa  321  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0901523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2164  patatin  47.03 
 
 		 398 aa  310  4e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.22699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0065  Patatin  44.54 
 
 		 405 aa  288  1e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1144  patatin  40.89 
 
 		 411 aa  273  4.0000000000000004e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3528  patatin  35.05 
 
 		 420 aa  204  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.372261  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0488  alpha/beta fold family hydrolase  37.47 
 
 		 397 aa  195  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.30127  normal  0.0348857 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0816  patatin  33.7 
 
 		 413 aa  181  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5830  patatin  31.97 
 
 		 411 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11080  hypothetical protein  32.67 
 
 		 294 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000671536  normal  0.268784 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0775  patatin  26.47 
 
 		 351 aa  80.9  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  27.53 
 
 		 302 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  27.2 
 
 		 347 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  29.84 
 
 		 358 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  27.13 
 
 		 302 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  26.82 
 
 		 306 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  26.82 
 
 		 347 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  26.82 
 
 		 474 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  26.82 
 
 		 347 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  29.13 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  28.24 
 
 		 317 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4393  patatin  31.22 
 
 		 301 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  31.17 
 
 		 728 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  27.03 
 
 		 358 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  31.91 
 
 		 748 aa  75.9  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  25.6 
 
 		 306 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  32.77 
 
 		 308 aa  76.3  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  26.12 
 
 		 308 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  25.6 
 
 		 305 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  30.47 
 
 		 728 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  25.6 
 
 		 305 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4688  patatin  32.35 
 
 		 288 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.602517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1045  Patatin  30.84 
 
 		 322 aa  75.5  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0588831  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  28.74 
 
 		 751 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  30.77 
 
 		 728 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2029  patatin  33.63 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.209272 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  28.14 
 
 		 728 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  29.53 
 
 		 316 aa  74.3  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  30.2 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4237  patatin  30.8 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.228516 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4171  patatin  30.8 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.520167  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  25.71 
 
 		 349 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3685  Patatin  30.08 
 
 		 720 aa  71.6  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000342926  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  27.06 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  29.96 
 
 		 727 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  22.07 
 
 		 740 aa  71.2  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  29.13 
 
 		 733 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  26.27 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  23.51 
 
 		 275 aa  68.9  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1218  patatin  29.07 
 
 		 288 aa  69.3  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0148109 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3379  patatin  28.79 
 
 		 737 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2996  Patatin  29.96 
 
 		 746 aa  69.7  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000124103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3773  patatin  27.6 
 
 		 754 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  27.04 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3209  patatin-like phospholipase  26.58 
 
 		 347 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000473323  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1377  patatin-like phospholipase  26.58 
 
 		 347 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00276521  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  27.98 
 
 		 330 aa  67  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0428  hypothetical protein  30.52 
 
 		 736 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  29.69 
 
 		 753 aa  66.6  0.0000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5258  patatin  29.8 
 
 		 777 aa  66.6  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  28.22 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1258  Patatin  31.56 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0393654  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0432  patatin  30.52 
 
 		 738 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00104069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3595  patatin  30.52 
 
 		 738 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0117026  normal  0.37392 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  30.29 
 
 		 320 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  26.76 
 
 		 740 aa  66.2  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  24.48 
 
 		 275 aa  65.5  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  26 
 
 		 741 aa  65.9  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0664  patatin  25.43 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0430  patatin  30.52 
 
 		 739 aa  64.7  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.2569  normal  0.405948 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0838  Patatin  28.23 
 
 		 667 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  29.05 
 
 		 803 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  29.05 
 
 		 803 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  30.23 
 
 		 345 aa  64.7  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  29.05 
 
 		 803 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3413  patatin  28.92 
 
 		 738 aa  64.3  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.016604  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  24.41 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  27.2 
 
 		 333 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  29.84 
 
 		 813 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  27.27 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  28.03 
 
 		 728 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7582  Patatin  28.25 
 
 		 331 aa  63.9  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1781  OMP85 family outer membrane protein  27.84 
 
 		 852 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  27.2 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  27.76 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0379  hypothetical protein  29.62 
 
 		 734 aa  63.2  0.000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101428  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1043  hypothetical protein  27.67 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.175435  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  29.88 
 
 		 804 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  27.2 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4813  Patatin  30.58 
 
 		 520 aa  63.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.985393 
 
 
-
 
NC_004310  BR1077  hypothetical protein  27.67 
 
 		 315 aa  63.2  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1912  patatin  27.11 
 
 		 282 aa  62.8  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000188558  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3556  Patatin  36.17 
 
 		 331 aa  62.8  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  27.47 
 
 		 798 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  27.59 
 
 		 796 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0958  patatin family protein  28.81 
 
 		 303 aa  62  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1891  patatin  28.16 
 
 		 296 aa  62  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.358546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0391  patatin  26.67 
 
 		 790 aa  62.4  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0374937 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3852  Patatin  28.86 
 
 		 738 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00970151  unclonable  0.00000000000304178 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3909  patatin  28.86 
 
 		 738 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000966561  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>