More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1363 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  100 
 
 		 464 aa  936    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  33.11 
 
 		 492 aa  270  5e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  34.19 
 
 		 454 aa  265  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  32.25 
 
 		 496 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1213  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  34.29 
 
 		 482 aa  258  2e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  32.63 
 
 		 667 aa  248  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  38.49 
 
 		 730 aa  236  8e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  32.69 
 
 		 463 aa  235  1.0000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  32.32 
 
 		 505 aa  229  9e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  30.62 
 
 		 508 aa  228  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  31.86 
 
 		 466 aa  226  6e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  39.09 
 
 		 804 aa  221  3e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  33.41 
 
 		 615 aa  218  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4449  capsular exopolysaccharide family  33.84 
 
 		 472 aa  216  8e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  40.92 
 
 		 753 aa  216  8e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  38.54 
 
 		 575 aa  213  3.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  37.06 
 
 		 736 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  39.39 
 
 		 790 aa  213  7e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2955  capsular exopolysaccharide family  30.69 
 
 		 521 aa  212  9e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  34.29 
 
 		 721 aa  211  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  32.13 
 
 		 503 aa  210  4e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0964  lipopolysaccharide biosynthesis  31.94 
 
 		 497 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05860  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  31.52 
 
 		 524 aa  206  5e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.517832  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  52.43 
 
 		 235 aa  206  6e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5247  capsular exopolysaccharide family  31.19 
 
 		 509 aa  206  8e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  47.93 
 
 		 232 aa  206  9e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3221  lipopolysaccharide biosynthesis  30.35 
 
 		 529 aa  205  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.929706  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2948  capsular exopolysaccharide family  30.75 
 
 		 484 aa  200  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0038  capsular exopolysaccharide family  30.63 
 
 		 474 aa  200  3.9999999999999996e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.956003  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1662  capsular polysaccharide biosynthesis protein  46.15 
 
 		 240 aa  200  3.9999999999999996e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.54254  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5453  tyrosine-protein kinase YwqD  46.79 
 
 		 225 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000155179  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  47 
 
 		 217 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  33.44 
 
 		 722 aa  196  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5396  tyrosine-protein kinase YwqD  44.91 
 
 		 233 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  47 
 
 		 217 aa  196  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4958  protein-tyrosine kinase  43.48 
 
 		 233 aa  194  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122806  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5554  tyrosine-protein kinase YwqD  43.48 
 
 		 233 aa  195  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000192889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5451  tyrosine-protein kinase YwqD  43.91 
 
 		 233 aa  195  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0440072  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5398  capsular exopolysaccharide family protein  43.48 
 
 		 233 aa  194  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.466197  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5073  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  45.37 
 
 		 234 aa  194  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0358  capsular exopolysaccharide family  28.82 
 
 		 490 aa  194  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2854  capsular exopolysaccharide family  32.48 
 
 		 525 aa  192  8e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5400  capsular exopolysaccharide family protein  44.95 
 
 		 225 aa  192  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00155134  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5075  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  44.5 
 
 		 225 aa  191  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.064024  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4960  tyrosine-protein kinase  44.95 
 
 		 225 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.94095e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  35.58 
 
 		 743 aa  191  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5552  tyrosine-protein kinase YwqD  44.04 
 
 		 225 aa  190  5e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000166595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  34.97 
 
 		 779 aa  189  8e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5398  tyrosine-protein kinase YwqD  44.04 
 
 		 257 aa  189  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  35.8 
 
 		 741 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  33.54 
 
 		 739 aa  187  4e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4107  capsular exopolysaccharide family  46.15 
 
 		 246 aa  187  4e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517117 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0946  protein-tyrosine kinase  33.68 
 
 		 443 aa  187  5e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.484543  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1155  tyrosine-protein kinase  41.56 
 
 		 257 aa  187  5e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000120781  hitchhiker  3.55737e-18 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  34.32 
 
 		 741 aa  186  6e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  35.8 
 
 		 741 aa  186  6e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  33.54 
 
 		 739 aa  186  7e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  33.54 
 
 		 739 aa  186  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  33.54 
 
 		 739 aa  186  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  33.75 
 
 		 734 aa  184  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  34.91 
 
 		 741 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1180  capsular exopolysaccharide family  43.84 
 
 		 211 aa  184  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  34.91 
 
 		 741 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  34.91 
 
 		 741 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  34.73 
 
 		 741 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1943  protein-tyrosine kinase  39.32 
 
 		 239 aa  182  8.000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.641105  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  33.53 
 
 		 741 aa  182  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3000  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  50.74 
 
 		 242 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3268  capsular exopolysaccharide family  41.74 
 
 		 221 aa  180  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.582826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0852  lipopolysaccharide biosynthesis  34.38 
 
 		 727 aa  180  5.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0448301 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  33.22 
 
 		 756 aa  179  9e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1126  capsular exopolysaccharide family  32.66 
 
 		 790 aa  177  5e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0796389  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  32.69 
 
 		 745 aa  176  8e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4185  lipopolysaccharide biosynthesis  30.23 
 
 		 473 aa  175  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  35.57 
 
 		 720 aa  175  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24630  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  30.86 
 
 		 492 aa  174  3.9999999999999995e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0081  capsular exopolysaccharide family  32.97 
 
 		 766 aa  173  5e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.80701 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  36.57 
 
 		 772 aa  173  5.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1178  exopolysaccharide export protein, putative, interruption-C  33.33 
 
 		 527 aa  173  6.999999999999999e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.704775  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  30.77 
 
 		 732 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3271  EpsB  31.23 
 
 		 746 aa  172  9e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3220  exopolysaccharide transport family protein  31.23 
 
 		 746 aa  172  9e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  30.43 
 
 		 740 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  32.23 
 
 		 746 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3258  exopolysaccharide transport family protein  31.23 
 
 		 746 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2744  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  39.73 
 
 		 230 aa  172  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2687  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  39.73 
 
 		 230 aa  172  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1353  non-specific protein-tyrosine kinase  29.68 
 
 		 624 aa  171  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  32.77 
 
 		 806 aa  171  3e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1354  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  31.23 
 
 		 746 aa  170  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.845392  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3404  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  43.9 
 
 		 220 aa  170  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00848041  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.5 
 
 		 730 aa  169  8e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4408  capsular exopolysaccharide family  29.4 
 
 		 746 aa  169  8e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2662  capsular exopolysaccharide family  33 
 
 		 726 aa  169  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.149577  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1090  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  33 
 
 		 726 aa  169  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1217  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  33 
 
 		 726 aa  169  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2615  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  33 
 
 		 726 aa  169  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.662631  normal  0.0600868 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1097  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  33 
 
 		 726 aa  169  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653674  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2334  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  33 
 
 		 726 aa  168  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3194  exopolysaccharide transport protein family  35.24 
 
 		 747 aa  169  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0576306 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>