More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0909 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0909  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 151 aa  300  4.0000000000000003e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184208  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  51.33 
 
 		 163 aa  147  6e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  47.3 
 
 		 144 aa  118  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  39.87 
 
 		 155 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3938  lipoprotein signal peptidase  42.48 
 
 		 152 aa  108  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000501111  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3945  lipoprotein signal peptidase  42.48 
 
 		 152 aa  108  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000105724  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1277  lipoprotein signal peptidase  41.5 
 
 		 154 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0128808  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0434  lipoprotein signal peptidase  41.5 
 
 		 154 aa  107  7.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2542  lipoprotein signal peptidase  45.64 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0674041  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3720  lipoprotein signal peptidase  41.18 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00905453  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  41.89 
 
 		 161 aa  103  7e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  41.26 
 
 		 161 aa  103  8e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0889  lipoprotein signal peptidase  40.97 
 
 		 170 aa  103  9e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0472  lipoprotein signal peptidase  40.97 
 
 		 170 aa  103  9e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2327  lipoprotein signal peptidase  40.97 
 
 		 170 aa  103  9e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1105  lipoprotein signal peptidase  40.97 
 
 		 170 aa  103  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1119  lipoprotein signal peptidase  40.69 
 
 		 173 aa  103  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2904  lipoprotein signal peptidase  40.97 
 
 		 170 aa  103  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.353036  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1606  lipoprotein signal peptidase  40.97 
 
 		 170 aa  103  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2910  lipoprotein signal peptidase  40.97 
 
 		 170 aa  103  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0390  lipoprotein signal peptidase  40.97 
 
 		 170 aa  103  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0884  lipoprotein signal peptidase  40.97 
 
 		 170 aa  103  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.978547 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0196  lipoprotein signal peptidase  43.41 
 
 		 170 aa  101  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0222  lipoprotein signal peptidase  43.41 
 
 		 170 aa  101  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3473  lipoprotein signal peptidase  43.08 
 
 		 170 aa  100  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.911066  normal  0.126226 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1280  lipoprotein signal peptidase  41.61 
 
 		 163 aa  99.8  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1255  lipoprotein signal peptidase  41.61 
 
 		 163 aa  99.8  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1910  lipoprotein signal peptidase  42.11 
 
 		 154 aa  99  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  38.41 
 
 		 145 aa  99  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3994  lipoprotein signal peptidase  42.48 
 
 		 152 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000820029  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4314  lipoprotein signal peptidase  41.78 
 
 		 163 aa  98.6  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081258  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3744  lipoprotein signal peptidase  42.48 
 
 		 152 aa  98.6  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00517012  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3635  lipoprotein signal peptidase  42.48 
 
 		 152 aa  98.6  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00213979  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3652  lipoprotein signal peptidase  42.48 
 
 		 152 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000204349  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3907  lipoprotein signal peptidase  42.48 
 
 		 152 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000548028 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4032  lipoprotein signal peptidase  42.48 
 
 		 152 aa  98.6  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000325041  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1247  lipoprotein signal peptidase  42.48 
 
 		 152 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000373462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1409  lipoprotein signal peptidase  39.01 
 
 		 170 aa  97.1  9e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  40.43 
 
 		 160 aa  95.9  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1323  lipoprotein signal peptidase  38.36 
 
 		 152 aa  95.9  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  39.16 
 
 		 162 aa  95.5  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0481  signal peptidase II  37.66 
 
 		 170 aa  95.9  2e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3756  lipoprotein signal peptidase  38.71 
 
 		 164 aa  95.5  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  37.66 
 
 		 162 aa  94  6e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1404  lipoprotein signal peptidase  37.59 
 
 		 176 aa  93.2  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2630  peptidase A8, signal peptidase II  34.72 
 
 		 166 aa  91.7  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  35.48 
 
 		 163 aa  90.9  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  38.51 
 
 		 171 aa  90.9  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3274  lipoprotein signal peptidase  36.92 
 
 		 171 aa  90.5  7e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00894133  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  39.23 
 
 		 178 aa  89.4  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1860  signal peptidase II  39.86 
 
 		 174 aa  89.4  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  36.55 
 
 		 176 aa  89  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1688  lipoprotein signal peptidase  33.11 
 
 		 149 aa  88.6  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  37.88 
 
 		 166 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  37.88 
 
 		 166 aa  88.2  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  37.88 
 
 		 166 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  37.88 
 
 		 166 aa  88.2  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  37.88 
 
 		 166 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  37.88 
 
 		 166 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3463  lipoprotein signal peptidase  35.46 
 
 		 359 aa  88.2  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  37.88 
 
 		 166 aa  88.2  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4320  signal peptidase II  35.46 
 
 		 359 aa  88.2  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2364  lipoprotein signal peptidase  39.47 
 
 		 158 aa  87.4  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  38.03 
 
 		 164 aa  87.4  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0921  lipoprotein signal peptidase  40.82 
 
 		 145 aa  87.8  5e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000390697  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1243  signal peptidase II  34.87 
 
 		 364 aa  87.4  6e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  37.24 
 
 		 170 aa  87  7e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  37.88 
 
 		 166 aa  87  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0868  signal peptidase II  40.71 
 
 		 150 aa  87  8e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  41.54 
 
 		 174 aa  87  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3135  lipoprotein signal peptidase  37.42 
 
 		 160 aa  86.7  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.269423  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3850  lipoprotein signal peptidase  36.15 
 
 		 164 aa  86.7  9e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  35.56 
 
 		 166 aa  86.3  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  41.54 
 
 		 174 aa  86.3  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  36.3 
 
 		 166 aa  86.3  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1239  lipoprotein signal peptidase  38.46 
 
 		 165 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261124  normal  0.0513456 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  34.72 
 
 		 170 aa  86.3  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1371  lipoprotein signal peptidase  35.86 
 
 		 150 aa  86.7  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  36.96 
 
 		 182 aa  86.3  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  34.72 
 
 		 170 aa  86.3  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  34.72 
 
 		 170 aa  86.3  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  35.56 
 
 		 166 aa  86.3  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  36.3 
 
 		 166 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  36.3 
 
 		 166 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1814  lipoprotein signal peptidase  36.09 
 
 		 358 aa  85.5  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.344803 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  34.81 
 
 		 166 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  36.3 
 
 		 166 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0762  lipoprotein signal peptidase  37.68 
 
 		 161 aa  85.1  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  35.88 
 
 		 179 aa  85.5  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  35.17 
 
 		 163 aa  85.1  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2110  lipoprotein signal peptidase  36.64 
 
 		 167 aa  85.1  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  39.23 
 
 		 173 aa  84.7  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0948  lipoprotein signal peptidase  33.78 
 
 		 153 aa  84.7  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  37.86 
 
 		 157 aa  84.7  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  34.51 
 
 		 160 aa  84.7  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  37.69 
 
 		 164 aa  84.3  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2143  signal peptidase II  39.61 
 
 		 156 aa  84.3  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  32.43 
 
 		 173 aa  84.3  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  37.4 
 
 		 169 aa  84  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5353  lipoprotein signal peptidase  36.03 
 
 		 357 aa  83.6  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00779044  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>