More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_3035 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_3035  thioredoxin-related  100 
 
 
274 aa  553  1e-156  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  48.03 
 
 
287 aa  245  4.9999999999999997e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  43.17 
 
 
289 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  41.52 
 
 
287 aa  207  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  41.01 
 
 
290 aa  202  4e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  41.37 
 
 
290 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  43.17 
 
 
289 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  40.65 
 
 
290 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  42.09 
 
 
289 aa  196  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  40.29 
 
 
290 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  42.24 
 
 
286 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  41.73 
 
 
290 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3272  thioredoxin  41.37 
 
 
326 aa  195  6e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315754  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  40.29 
 
 
290 aa  195  7e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  39.78 
 
 
286 aa  192  5e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  40.65 
 
 
290 aa  192  7e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  40.65 
 
 
290 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  44.24 
 
 
280 aa  191  1e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  40.21 
 
 
320 aa  186  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  39.86 
 
 
330 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  39.5 
 
 
329 aa  183  3e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  38.18 
 
 
285 aa  182  3e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  39.5 
 
 
324 aa  182  5.0000000000000004e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  36.75 
 
 
287 aa  180  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0603  thioredoxin domain-containing protein  37.41 
 
 
287 aa  177  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0802586  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  38.13 
 
 
302 aa  175  7e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  37.14 
 
 
302 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  37.91 
 
 
317 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  38.65 
 
 
324 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  35.9 
 
 
269 aa  172  5e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  38.3 
 
 
324 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  38.3 
 
 
282 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  38.63 
 
 
282 aa  170  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0886  putative thioredoxin protein  38.97 
 
 
287 aa  170  3e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  38.3 
 
 
282 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  38.3 
 
 
282 aa  169  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2469  thioredoxin  35.92 
 
 
289 aa  168  7e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.744001  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2848  thioredoxin, putative  35.92 
 
 
289 aa  168  7e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2254  Thioredoxin domain  39.86 
 
 
338 aa  168  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.708544  normal  0.526752 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  36.17 
 
 
306 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2102  thioredoxin  40.58 
 
 
291 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  38.3 
 
 
282 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0835  thioredoxin  38.85 
 
 
304 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0466449 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1595  thioredoxin  34.89 
 
 
287 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.385204  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2792  thioredoxin  37.68 
 
 
307 aa  166  2.9999999999999998e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.284427 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  39.72 
 
 
301 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2526  Thioredoxin domain  38.3 
 
 
302 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  39.72 
 
 
282 aa  165  9e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  39.72 
 
 
282 aa  165  9e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  34.77 
 
 
289 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2251  thioredoxin domain-containing protein  37.94 
 
 
302 aa  162  7e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.285443 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  37.59 
 
 
281 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  36.17 
 
 
334 aa  161  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  37.32 
 
 
293 aa  161  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  35.11 
 
 
306 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0577  thioredoxin domain protein  34.43 
 
 
272 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0560  Thioredoxin domain protein  34.43 
 
 
272 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2208  Thioredoxin domain  37.94 
 
 
300 aa  160  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210633  normal  0.190287 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  39.86 
 
 
918 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  37.41 
 
 
293 aa  160  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  38.79 
 
 
282 aa  159  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  37.18 
 
 
310 aa  158  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  35 
 
 
306 aa  158  7e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  36.88 
 
 
282 aa  158  8e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  37.05 
 
 
280 aa  158  9e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  38.55 
 
 
281 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  35.46 
 
 
306 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  36.07 
 
 
277 aa  157  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01872  thioredoxin  37.55 
 
 
285 aa  156  4e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2127  thioredoxin domain-containing protein  36.01 
 
 
311 aa  156  4e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1374  thioredoxin  39.21 
 
 
286 aa  155  6e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  36.96 
 
 
282 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1307  thioredoxin  38.85 
 
 
286 aa  154  1e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334323  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  36.96 
 
 
282 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  37.72 
 
 
282 aa  154  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0664  Thioredoxin domain protein  36.63 
 
 
282 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0266  thioredoxin  37.02 
 
 
301 aa  153  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0081  thioredoxin-related  37.06 
 
 
310 aa  152  4e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3711  thioredoxin-related  36.3 
 
 
312 aa  152  5e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  36.59 
 
 
282 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2614  thioredoxin family protein  36.13 
 
 
271 aa  150  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  36.73 
 
 
280 aa  150  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0054  thioredoxin domain-containing protein  35.29 
 
 
311 aa  150  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  34.45 
 
 
302 aa  150  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  37.18 
 
 
286 aa  150  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  33.22 
 
 
305 aa  149  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2938  thioredoxin  34.64 
 
 
315 aa  149  5e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3667  thioredoxin domain-containing protein  36.43 
 
 
298 aa  148  8e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  32.54 
 
 
302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2914  thioredoxin  38.08 
 
 
285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0979  thioredoxin domain-containing protein  34.69 
 
 
263 aa  146  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.248497  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  32.88 
 
 
302 aa  144  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1312  thioredoxin  36.56 
 
 
302 aa  144  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.968155  hitchhiker  0.00158392 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1093  thioredoxin  32.25 
 
 
268 aa  143  3e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0251638  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1199  thioredoxin  35.14 
 
 
268 aa  143  4e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0450617 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0198  thioredoxin  33.33 
 
 
326 aa  143  4e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0675  thioredoxin domain-containing protein  32.97 
 
 
297 aa  142  6e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357396  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1331  putative thioredoxin  32.52 
 
 
285 aa  141  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5272  Thioredoxin domain protein  31.52 
 
 
272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.127007 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2894  thioredoxin  32.97 
 
 
304 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>