More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7293 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_7293  Glycine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 425 aa  882    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3859  serine hydroxymethyltransferase  69.91 
 
 		 423 aa  635    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3814  serine hydroxymethyltransferase  66.74 
 
 		 433 aa  622  1e-177  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.866873  normal  0.501976 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3633  serine hydroxymethyltransferase  69.29 
 
 		 431 aa  624  1e-177  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3410  serine hydroxymethyltransferase  68.25 
 
 		 424 aa  610  1e-173  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.751124  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1617  serine hydroxymethyltransferase  67.06 
 
 		 424 aa  600  1e-170  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4970  Glycine hydroxymethyltransferase  66.19 
 
 		 428 aa  599  1e-170  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00413503  hitchhiker  0.000000000000204325 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0275  serine hydroxymethyltransferase  64.85 
 
 		 422 aa  594  1e-168  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.246164 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09233  serine hydroxymethyltransferase  63.03 
 
 		 439 aa  582  1.0000000000000001e-165  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.293634  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0042  serine hydroxymethyltransferase  62.97 
 
 		 426 aa  573  1.0000000000000001e-162  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0127  Glycine hydroxymethyltransferase  62.26 
 
 		 435 aa  549  1e-155  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0630  serine hydroxymethyltransferase  64.11 
 
 		 440 aa  549  1e-155  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0584  serine hydroxymethyltransferase  64.32 
 
 		 440 aa  546  1e-154  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0130889  normal  0.707508 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1789  serine hydroxymethyltransferase  61.1 
 
 		 438 aa  544  1e-153  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0727  serine hydroxymethyltransferase  63.43 
 
 		 438 aa  542  1e-153  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0601  serine hydroxymethyltransferase  62.62 
 
 		 440 aa  538  9.999999999999999e-153  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1965  serine hydroxymethyltransferase  59.67 
 
 		 441 aa  535  1e-151  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.128494  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1590  serine hydroxymethyltransferase  62.75 
 
 		 440 aa  533  1e-150  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.079275 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1155  serine hydroxymethyltransferase  61.1 
 
 		 436 aa  533  1e-150  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0389  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 		 436 aa  529  1e-149  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285606 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1418  serine hydroxymethyltransferase  54.27 
 
 		 420 aa  483  1e-135  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0614522  normal  0.461409 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  53.88 
 
 		 416 aa  483  1e-135  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  57.04 
 
 		 412 aa  483  1e-135  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  54.42 
 
 		 415 aa  482  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  54.18 
 
 		 415 aa  480  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  53.7 
 
 		 415 aa  478  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  53.94 
 
 		 415 aa  475  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  56.97 
 
 		 415 aa  477  1e-133  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  52.84 
 
 		 414 aa  474  1e-133  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  53.7 
 
 		 415 aa  474  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  54.25 
 
 		 418 aa  471  1e-132  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1094  serine hydroxymethyltransferase  54.65 
 
 		 417 aa  473  1e-132  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1160  serine hydroxymethyltransferase  54.65 
 
 		 417 aa  472  1e-132  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  52.94 
 
 		 424 aa  473  1e-132  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1094  serine hydroxymethyltransferase  54.65 
 
 		 417 aa  472  1e-132  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0756  serine hydroxymethyltransferase  53.5 
 
 		 425 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3471  serine hydroxymethyltransferase  54.65 
 
 		 417 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0064  serine hydroxymethyltransferase  56.53 
 
 		 412 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2780  serine hydroxymethyltransferase  54.89 
 
 		 417 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1463  glycine hydroxymethyltransferase  52.36 
 
 		 415 aa  470  1.0000000000000001e-131  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  54.72 
 
 		 427 aa  471  1.0000000000000001e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0782  serine hydroxymethyltransferase  53.5 
 
 		 425 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0841  glycine hydroxymethyltransferase  52.98 
 
 		 417 aa  468  1.0000000000000001e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33053  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  53.83 
 
 		 437 aa  468  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1141  serine hydroxymethyltransferase  54.89 
 
 		 414 aa  471  1.0000000000000001e-131  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.217478  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3305  serine hydroxymethyltransferase  53.94 
 
 		 417 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.297219  hitchhiker  0.000907019 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3161  serine hydroxymethyltransferase  53.94 
 
 		 417 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.261571  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1610  serine hydroxymethyltransferase  53.36 
 
 		 429 aa  467  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3162  serine hydroxymethyltransferase  53.94 
 
 		 417 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.911286  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1209  serine hydroxymethyltransferase  54.18 
 
 		 417 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02801  serine hydroxymethyltransferase  54.87 
 
 		 423 aa  466  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0671  serine hydroxymethyltransferase  53.94 
 
 		 417 aa  461  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.557812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4802  serine hydroxymethyltransferase  55.97 
 
 		 427 aa  462  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  53.41 
 
 		 417 aa  463  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  55.11 
 
 		 411 aa  464  1e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3097  serine hydroxymethyltransferase  55.24 
 
 		 412 aa  464  1e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175089 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4877  serine hydroxymethyltransferase  53.94 
 
 		 417 aa  462  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.402887  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  53.22 
 
 		 417 aa  464  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1142  serine hydroxymethyltransferase  53.22 
 
 		 417 aa  464  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.510367  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0702  serine hydroxymethyltransferase  53.94 
 
 		 417 aa  461  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0603318  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1177  serine hydroxymethyltransferase  52.35 
 
 		 432 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0289619  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  52.97 
 
 		 410 aa  464  1e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  52.73 
 
 		 410 aa  462  1e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2660  serine hydroxymethyltransferase  54.27 
 
 		 425 aa  464  1e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1033  serine hydroxymethyltransferase  53.46 
 
 		 417 aa  462  1e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414818  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1185  serine hydroxymethyltransferase  53.46 
 
 		 417 aa  462  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4027  glycine hydroxymethyltransferase  55.95 
 
 		 421 aa  464  1e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17117  normal  0.0123375 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  55.13 
 
 		 412 aa  462  1e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  53.46 
 
 		 413 aa  464  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1014  serine hydroxymethyltransferase  53.22 
 
 		 417 aa  462  1e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02811  serine hydroxymethyltransferase  54.39 
 
 		 423 aa  460  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0703  serine hydroxymethyltransferase  53.94 
 
 		 417 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0573  serine hydroxymethyltransferase  53.94 
 
 		 417 aa  459  9.999999999999999e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  53.07 
 
 		 413 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0745  serine hydroxymethyltransferase  52.26 
 
 		 415 aa  458  9.999999999999999e-129  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4898  glycine hydroxymethyltransferase  52.13 
 
 		 427 aa  459  9.999999999999999e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  54.25 
 
 		 413 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  54.39 
 
 		 413 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  54.25 
 
 		 413 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2390  serine hydroxymethyltransferase  53.55 
 
 		 416 aa  459  9.999999999999999e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0832592 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  54.01 
 
 		 413 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1266  serine hydroxymethyltransferase  52.46 
 
 		 432 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0458809  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0209  serine hydroxymethyltransferase  52.69 
 
 		 427 aa  458  9.999999999999999e-129  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  52.73 
 
 		 415 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  54.42 
 
 		 414 aa  461  9.999999999999999e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  53.77 
 
 		 413 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1813  serine hydroxymethyltransferase  51.66 
 
 		 414 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1468  serine hydroxymethyltransferase  52.34 
 
 		 423 aa  459  9.999999999999999e-129  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1854  serine hydroxymethyltransferase  54.27 
 
 		 412 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  53.4 
 
 		 422 aa  459  9.999999999999999e-129  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4513  serine hydroxymethyltransferase  53.7 
 
 		 417 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0695784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0759  serine hydroxymethyltransferase  53.22 
 
 		 417 aa  457  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  51.9 
 
 		 412 aa  457  1e-127  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0451  serine hydroxymethyltransferase  52.74 
 
 		 414 aa  456  1e-127  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.178848  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0489  serine hydroxymethyltransferase  52.98 
 
 		 413 aa  457  1e-127  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2082  serine hydroxymethyltransferase  51.66 
 
 		 419 aa  455  1e-127  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000584892  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  52.26 
 
 		 412 aa  457  1e-127  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2076  serine hydroxymethyltransferase  54.74 
 
 		 427 aa  457  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.745833  hitchhiker  0.000706319 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0260  serine hydroxymethyltransferase  53.92 
 
 		 423 aa  456  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1093  serine hydroxymethyltransferase  53.7 
 
 		 417 aa  455  1e-127  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>