More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2425 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 
188 aa  391  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.15 
 
 
199 aa  157  6e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  39.67 
 
 
178 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  42.08 
 
 
183 aa  154  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.94 
 
 
180 aa  145  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  37.1 
 
 
183 aa  144  5e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  39.13 
 
 
178 aa  143  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  41.85 
 
 
181 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  38.8 
 
 
180 aa  137  7e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.23 
 
 
188 aa  137  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.29 
 
 
192 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  40.76 
 
 
181 aa  132  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  38.25 
 
 
181 aa  132  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.38 
 
 
192 aa  132  3.9999999999999996e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  36.96 
 
 
185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0435  deaminase-reductase domain-containing protein  36.32 
 
 
190 aa  129  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.86 
 
 
189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.45 
 
 
188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.72 
 
 
194 aa  124  7e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3049  dihydrofolate reductase  34.64 
 
 
177 aa  122  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.611041  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  34.05 
 
 
199 aa  123  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0841  hypothetical protein  37.97 
 
 
189 aa  122  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  34.05 
 
 
203 aa  121  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.85 
 
 
201 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.39 
 
 
185 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.38 
 
 
182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.97 
 
 
178 aa  119  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1753  dihydrofolate reductase  33.85 
 
 
182 aa  119  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  33.7 
 
 
183 aa  118  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.05 
 
 
176 aa  118  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5174  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.03 
 
 
187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  34.78 
 
 
181 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.51 
 
 
183 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263452 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25630  dihydrofolate reductase  32 
 
 
196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.258312 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3231  deaminase-reductase domain-containing protein  33.85 
 
 
199 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  34.24 
 
 
180 aa  114  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.8 
 
 
187 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  32.96 
 
 
179 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1598  bifunctional deaminase-reductase-like protein  33.51 
 
 
188 aa  112  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1622  deaminase-reductase domain-containing protein  33.51 
 
 
188 aa  112  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  31.75 
 
 
179 aa  111  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3362  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.09 
 
 
186 aa  111  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1417  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.46 
 
 
187 aa  111  7.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291407  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1568  deaminase-reductase domain-containing protein  33.51 
 
 
188 aa  111  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.03 
 
 
188 aa  110  8.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1408  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.22 
 
 
193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7653  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.07 
 
 
187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1023  bifunctional deaminase-reductase-like protein  34.05 
 
 
178 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.75 
 
 
187 aa  109  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4888  deaminase-reductase domain-containing protein  32.45 
 
 
187 aa  108  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.600343 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.57 
 
 
201 aa  108  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.45 
 
 
181 aa  108  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.04 
 
 
189 aa  108  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1347  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.91 
 
 
185 aa  108  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.211147 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1407  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
190 aa  106  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.436948  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  30.85 
 
 
178 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1605  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.51 
 
 
187 aa  105  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.184387  normal  0.0697027 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.98 
 
 
188 aa  104  6e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3071  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.84 
 
 
188 aa  104  8e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.94 
 
 
187 aa  103  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.898411  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1147  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.65 
 
 
183 aa  103  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000436586 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  29.95 
 
 
204 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1353  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.57 
 
 
217 aa  102  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3644  hypothetical protein  35.94 
 
 
190 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4303  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.83 
 
 
208 aa  101  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.933393  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  30.61 
 
 
198 aa  99.8  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.84 
 
 
204 aa  99.4  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  28.36 
 
 
228 aa  99.8  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2243  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.55 
 
 
184 aa  99  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0952608  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  28.19 
 
 
180 aa  97.8  9e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5175  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.46 
 
 
219 aa  97.4  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0126564 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.59 
 
 
178 aa  97.1  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  29.32 
 
 
215 aa  97.1  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0585  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.47 
 
 
188 aa  96.3  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705013  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2260  deaminase-reductase domain-containing protein  29.9 
 
 
218 aa  96.3  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.163458  normal  0.0390077 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.84 
 
 
221 aa  95.1  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335275  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3816  deaminase-reductase domain-containing protein  31.18 
 
 
187 aa  95.1  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.600873  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3320  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.27 
 
 
182 aa  94.7  7e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4632  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.75 
 
 
183 aa  94.7  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170903  normal  0.134226 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.26 
 
 
178 aa  94.4  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30 
 
 
186 aa  94  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1818  deaminase-reductase domain-containing protein  30.41 
 
 
200 aa  94  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0584367  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4053  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.8 
 
 
204 aa  94  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5813  deaminase-reductase domain-containing protein  30.26 
 
 
188 aa  94  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4109  deaminase-reductase domain-containing protein  28.86 
 
 
195 aa  94  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1616  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.23 
 
 
204 aa  92.8  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.363546  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3728  deaminase-reductase domain-containing protein  28.86 
 
 
195 aa  93.6  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6617  deaminase-reductase domain-containing protein  30.41 
 
 
188 aa  93.2  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0136  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.32 
 
 
212 aa  92.8  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1267  deaminase-reductase domain-containing protein  29.89 
 
 
200 aa  92.4  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.924885  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.84 
 
 
221 aa  92  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488933  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1010  bifunctional deaminase-reductase-like  26.8 
 
 
221 aa  91.7  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3694  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  25.65 
 
 
201 aa  92  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  normal  0.227028 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0471  deaminase-reductase domain-containing protein  29.03 
 
 
184 aa  91.7  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0146314  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3313  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.02 
 
 
181 aa  91.7  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6250  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.34 
 
 
182 aa  91.7  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3191  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.86 
 
 
183 aa  91.3  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3935  deaminase-reductase domain-containing protein  29.63 
 
 
181 aa  91.3  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0619635  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0204  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.28 
 
 
186 aa  90.5  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.07 
 
 
177 aa  90.9  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>