More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0748 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  51.94 
 
 		 635 aa  661    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0801  threonyl-tRNA synthetase  57.59 
 
 		 647 aa  797    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00121365  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1373  threonyl-tRNA synthetase  66.25 
 
 		 645 aa  889    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000340223  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05580  Threonyl-tRNA synthetase  59.41 
 
 		 646 aa  799    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000588041  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0748  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 652 aa  1351    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2631  threonyl-tRNA synthetase  66.77 
 
 		 643 aa  902    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2317  threonyl-tRNA synthetase  66.61 
 
 		 643 aa  899    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1372  threonyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 		 635 aa  630  1e-179  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000383369  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  48.22 
 
 		 634 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000136416  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3262  threonyl-tRNA synthetase  46.73 
 
 		 643 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00002753  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  47.21 
 
 		 635 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4707  threonyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 		 645 aa  596  1e-169  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000334194  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4472  threonyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 		 645 aa  597  1e-169  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.419718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4307  threonyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 		 645 aa  597  1e-169  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00228432  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4318  threonyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 		 645 aa  597  1e-169  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0311311  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4820  threonyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 		 645 aa  597  1e-169  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00851939  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  46.51 
 
 		 634 aa  597  1e-169  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4691  threonyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 		 645 aa  597  1e-169  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.88699e-59 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4701  threonyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 		 645 aa  595  1e-169  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2661  threonyl-tRNA synthetase  46.37 
 
 		 644 aa  596  1e-169  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000386283  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4685  threonyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 		 645 aa  596  1e-169  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00204863  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0552  threonyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 		 645 aa  596  1e-169  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000171694  unclonable  1.90469e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4407  threonyl-tRNA synthetase  45.96 
 
 		 645 aa  593  1e-168  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00383919  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0797  threonyl-tRNA synthetase  45.93 
 
 		 652 aa  586  1e-166  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  45.81 
 
 		 635 aa  586  1e-166  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 		 633 aa  583  1.0000000000000001e-165  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2175  threonyl-tRNA synthetase  45.02 
 
 		 648 aa  581  1e-164  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2219  threonyl-tRNA synthetase  45.24 
 
 		 647 aa  580  1e-164  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0771332 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  43.19 
 
 		 662 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1246  threonyl-tRNA synthetase  43.25 
 
 		 645 aa  559  1e-158  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.1161  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3742  threonyl-tRNA synthetase  43.72 
 
 		 646 aa  560  1e-158  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.190527  hitchhiker  0.00137888 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1906  threonyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 		 641 aa  561  1e-158  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  43.96 
 
 		 639 aa  557  1e-157  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0711  threonyl-tRNA synthetase  43.41 
 
 		 647 aa  552  1e-156  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1221  threonyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 		 647 aa  553  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.001104  hitchhiker  0.00620187 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1740  threonyl-tRNA synthetase  42.66 
 
 		 645 aa  555  1e-156  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0523763  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1774  threonyl-tRNA synthetase  42.66 
 
 		 645 aa  555  1e-156  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  44.01 
 
 		 635 aa  555  1e-156  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0613  threonyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 648 aa  549  1e-155  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1643  threonyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 		 645 aa  548  1e-154  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193799  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  43.65 
 
 		 636 aa  543  1e-153  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00815  threonyl-tRNA synthetase  43.93 
 
 		 648 aa  541  9.999999999999999e-153  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.270847  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0725  threonyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 		 638 aa  538  1e-151  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0172  threonyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 		 659 aa  534  1e-150  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0559  threonyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 		 644 aa  534  1e-150  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00454252 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 638 aa  529  1e-149  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1824  threonyl-tRNA synthetase  44.79 
 
 		 636 aa  530  1e-149  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000392835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0992  threonyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 647 aa  524  1e-147  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 637 aa  522  1e-147  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000137846  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0123  threonyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 		 677 aa  523  1e-147  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0729429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0121  threonyl-tRNA synthetase  44.25 
 
 		 596 aa  521  1e-146  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1664  threonyl-tRNA synthetase  41.76 
 
 		 640 aa  519  1e-146  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000605435  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 645 aa  518  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0156  threonyl-tRNA synthetase  41.02 
 
 		 657 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  41.76 
 
 		 640 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2665  threonyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 		 584 aa  515  1.0000000000000001e-145  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000220787  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 		 636 aa  514  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0024  threonyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 		 648 aa  514  1e-144  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0176  threonyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 657 aa  514  1e-144  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 		 640 aa  514  1e-144  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2501  threonyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 		 675 aa  512  1e-144  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0167  threonyl-tRNA synthetase  39.51 
 
 		 657 aa  511  1e-143  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  42.06 
 
 		 636 aa  510  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 		 636 aa  510  1e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0992  threonyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 653 aa  508  9.999999999999999e-143  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0108  threonyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 643 aa  506  9.999999999999999e-143  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 		 644 aa  508  9.999999999999999e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 		 644 aa  508  9.999999999999999e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 		 636 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1025  threonyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 		 638 aa  506  9.999999999999999e-143  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.572663  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2181  threonyl-tRNA synthetase  40.22 
 
 		 646 aa  507  9.999999999999999e-143  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1715  threonyl-tRNA synthetase  39.2 
 
 		 657 aa  504  1e-141  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  40.56 
 
 		 645 aa  503  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0768  threonyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 		 641 aa  504  1e-141  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.67512  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  39.5 
 
 		 638 aa  501  1e-140  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 		 638 aa  501  1e-140  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 		 643 aa  500  1e-140  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1732  threonyl-tRNA synthetase  43.02 
 
 		 630 aa  501  1e-140  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0392  threonyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 		 633 aa  499  1e-140  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 		 648 aa  499  1e-140  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4204  threonyl-tRNA synthetase  37.97 
 
 		 736 aa  496  1e-139  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 640 aa  498  1e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04450  threonyl-tRNA synthetase /Ser-tRNA(Thr) hydrolase  43.62 
 
 		 586 aa  497  1e-139  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0386598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4615  threonyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 635 aa  496  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00961863  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1647  threonyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 		 635 aa  496  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0710025 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4736  threonyl-tRNA synthetase  40.15 
 
 		 659 aa  497  1e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0627  threonyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 		 588 aa  496  1e-139  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0993  threonyl-tRNA synthetase  40.03 
 
 		 635 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31786  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0460  threonyl-tRNA synthetase / Ser-tRNA(Thr) hydrolase  39.72 
 
 		 663 aa  496  1e-139  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0696284  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1475  threonyl-tRNA synthetase  40.03 
 
 		 635 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0274744  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1977  threonyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 		 635 aa  492  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0202  threonyl-tRNA synthetase  39.56 
 
 		 635 aa  495  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00540019  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1096  threonyl-tRNA synthetase  39.56 
 
 		 635 aa  495  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869704  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1383  threonyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 608 aa  494  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.520119 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2388  threonyl-tRNA synthetase  38.66 
 
 		 639 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2595  threonyl-tRNA synthetase  39.56 
 
 		 635 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 		 646 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2854  threonyl-tRNA synthetase  39.94 
 
 		 635 aa  494  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0336987 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0963  threonyl-tRNA synthetase  39.56 
 
 		 635 aa  495  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0747512  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0424  threonyl-tRNA synthetase  39.74 
 
 		 644 aa  494  9.999999999999999e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000699319  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>