More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2040 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2040  surface antigen (D15)  100 
 
 		 909 aa  1852    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.813925 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2385  Patatin  49.94 
 
 		 894 aa  902    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0362  hypothetical protein  49.71 
 
 		 875 aa  851    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0290  hypothetical protein  43.75 
 
 		 981 aa  781    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0402  surface antigen (D15)  50.78 
 
 		 950 aa  912    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.858509  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1840  Patatin  57.79 
 
 		 900 aa  1045    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2033  patatin  51.94 
 
 		 923 aa  931    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0624212  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  32.77 
 
 		 740 aa  179  2e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  33.43 
 
 		 751 aa  178  4e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  33.71 
 
 		 728 aa  177  8e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  33.15 
 
 		 728 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  36.47 
 
 		 727 aa  175  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0435  patatin  36.95 
 
 		 751 aa  174  6.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00139608  decreased coverage  0.00000000672418 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3685  Patatin  34.95 
 
 		 720 aa  172  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000342926  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  35.47 
 
 		 728 aa  169  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  36.95 
 
 		 728 aa  168  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  35.56 
 
 		 733 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  33.96 
 
 		 728 aa  167  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3773  patatin  37.41 
 
 		 754 aa  165  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  35.74 
 
 		 740 aa  165  4.0000000000000004e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  35.15 
 
 		 738 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0391  patatin  35.28 
 
 		 790 aa  162  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0374937 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0323  patatin  36.68 
 
 		 735 aa  162  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000755516  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0432  patatin  32.58 
 
 		 738 aa  162  4e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00104069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3595  patatin  32.58 
 
 		 738 aa  161  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0117026  normal  0.37392 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3427  patatin  31.83 
 
 		 737 aa  161  5e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000209875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3379  patatin  37.5 
 
 		 737 aa  160  8e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3929  patatin  31.66 
 
 		 737 aa  160  9e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000709115  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0430  patatin  32.07 
 
 		 739 aa  160  9e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.2569  normal  0.405948 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4050  patatin  31.66 
 
 		 738 aa  160  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.129924  normal  0.182704 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3852  Patatin  31.66 
 
 		 738 aa  160  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00970151  unclonable  0.00000000000304178 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3909  patatin  31.66 
 
 		 738 aa  160  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000966561  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  31.35 
 
 		 767 aa  160  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  33.56 
 
 		 760 aa  157  9e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0428  hypothetical protein  30.9 
 
 		 736 aa  156  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  30.43 
 
 		 741 aa  157  1e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1334  patatin-like protein of phospholipase family protein  33.69 
 
 		 745 aa  155  2.9999999999999998e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  37.28 
 
 		 753 aa  153  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3628  patatin-like phospholipase family protein  35.06 
 
 		 735 aa  152  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3413  patatin  31.47 
 
 		 738 aa  152  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.016604  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1781  OMP85 family outer membrane protein  36.92 
 
 		 852 aa  152  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0838  Patatin  35.29 
 
 		 667 aa  151  6e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0379  hypothetical protein  33.33 
 
 		 734 aa  151  6e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101428  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0846  Outer membrane protein  36.59 
 
 		 930 aa  150  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558607  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2193  patatin-like phospholipase  36.59 
 
 		 920 aa  150  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193867  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0818  OMP85 family outer membrane protein  36.59 
 
 		 933 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0034  OMP85 family outer membrane protein  36.59 
 
 		 945 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.987848  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1589  OMP85 family outer membrane protein  36.59 
 
 		 728 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  35.46 
 
 		 813 aa  149  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  33.87 
 
 		 803 aa  147  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  33.87 
 
 		 803 aa  147  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  33.87 
 
 		 803 aa  147  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  34.04 
 
 		 748 aa  145  4e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4068  patatin  31.1 
 
 		 733 aa  144  5e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.288798 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0939  patatin family phospholipase  36.43 
 
 		 714 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  34.69 
 
 		 804 aa  144  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  35.79 
 
 		 798 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5919  hypothetical protein  33.33 
 
 		 750 aa  143  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.502789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  35.79 
 
 		 796 aa  143  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0461  Patatin  36.05 
 
 		 707 aa  142  3e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03442  hypothetical protein  31.75 
 
 		 771 aa  139  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2996  Patatin  30.52 
 
 		 746 aa  137  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000124103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5258  patatin  30.79 
 
 		 777 aa  137  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1271  Patatin  29.38 
 
 		 775 aa  134  6.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002569  hypothetical protein  31.7 
 
 		 776 aa  131  7.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.765659  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0132  hypothetical protein  33.22 
 
 		 764 aa  127  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.948806  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  31.19 
 
 		 311 aa  126  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1473  Patatin  31.6 
 
 		 745 aa  125  5e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  29.66 
 
 		 333 aa  123  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  30.34 
 
 		 320 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  29.66 
 
 		 320 aa  123  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  30.29 
 
 		 272 aa  119  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4900  phospholipase, putative  30.18 
 
 		 259 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  31.29 
 
 		 358 aa  118  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0909  Patatin  32.2 
 
 		 310 aa  116  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  30.47 
 
 		 253 aa  115  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2086  patatin  32.01 
 
 		 346 aa  115  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154282  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  29.39 
 
 		 275 aa  115  5e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  29.31 
 
 		 256 aa  114  6e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  28.99 
 
 		 275 aa  114  6e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  29.41 
 
 		 474 aa  114  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  30.4 
 
 		 306 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  30.4 
 
 		 305 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  30.4 
 
 		 305 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  30.69 
 
 		 330 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  30.77 
 
 		 306 aa  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  29.76 
 
 		 347 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  29.76 
 
 		 347 aa  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  30.54 
 
 		 345 aa  112  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  29.41 
 
 		 347 aa  112  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  28.06 
 
 		 260 aa  112  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  29.36 
 
 		 317 aa  112  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  28.95 
 
 		 346 aa  111  5e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  30.38 
 
 		 315 aa  111  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  29.28 
 
 		 346 aa  111  6e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  30.4 
 
 		 302 aa  111  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1874  Lysophospholipase  31.29 
 
 		 262 aa  110  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  30.04 
 
 		 308 aa  110  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  28.26 
 
 		 275 aa  109  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3706  patatin  30.59 
 
 		 348 aa  110  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453278 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>