More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0097 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0084  membrane-associated zinc metalloprotease  69.76 
 
 		 453 aa  653    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.47842  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0097  membrane-associated zinc metalloprotease  100 
 
 		 453 aa  916    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000512767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0120  membrane-associated zinc metalloprotease  76.6 
 
 		 453 aa  732    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2681  peptidase RseP  66.23 
 
 		 446 aa  622  1e-177  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0079  membrane-associated zinc metalloprotease  66.23 
 
 		 453 aa  619  1e-176  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.736118  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0076  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  63 
 
 		 454 aa  607  9.999999999999999e-173  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0009  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  63.47 
 
 		 453 aa  593  1e-168  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000631419  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1961  membrane-associated zinc metalloprotease  38.89 
 
 		 469 aa  331  1e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3176  membrane-associated zinc metalloprotease  37 
 
 		 444 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.836726 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5920  membrane-associated zinc metalloprotease  37.72 
 
 		 438 aa  271  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.928218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0469  hypothetical protein  36.78 
 
 		 438 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4131  membrane-associated zinc metalloprotease  37.2 
 
 		 438 aa  248  2e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.158582 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0482  peptidase M50  36.42 
 
 		 442 aa  235  1.0000000000000001e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0205055  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0383  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  35.34 
 
 		 439 aa  231  2e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0892  membrane-associated zinc metalloprotease  33.19 
 
 		 439 aa  231  2e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2050  peptidase M50  35.84 
 
 		 444 aa  224  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0906941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1159  peptidase M50  34.91 
 
 		 447 aa  224  4e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2995  peptidase RseP  34.3 
 
 		 430 aa  216  9e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.207005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1279  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.9 
 
 		 448 aa  204  3e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.196606  normal  0.702874 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1451  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  33.26 
 
 		 452 aa  202  9e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1167  membrane-associated zinc metalloprotease  33.26 
 
 		 452 aa  202  9e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1874  peptidase RseP  30.26 
 
 		 463 aa  199  6e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03975  membrane-associated zinc metalloprotease  33.94 
 
 		 440 aa  199  6e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.419536  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1001  membrane-associated zinc metalloprotease  29.49 
 
 		 438 aa  196  8.000000000000001e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17140  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.68 
 
 		 450 aa  194  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1749  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  33.91 
 
 		 455 aa  194  4e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.853109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4179  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.4 
 
 		 450 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.374735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1490  RIP metalloprotease RseP  32.46 
 
 		 450 aa  193  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1598  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  32.4 
 
 		 452 aa  193  5e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4075  membrane-associated zinc metalloprotease  32.9 
 
 		 450 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.274449 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1350  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  32.4 
 
 		 450 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.512727  normal  0.377982 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38920  membrane-associated zinc metallopeptidase MucP  33.05 
 
 		 450 aa  192  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.241633  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1541  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  32.02 
 
 		 450 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521262  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1153  membrane-associated zinc metalloprotease  32.18 
 
 		 450 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0664  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  31.43 
 
 		 455 aa  190  4e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.399038  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2590  peptidase RseP  30.92 
 
 		 466 aa  190  4e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0359861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2171  membrane-associated zinc metalloprotease  30.15 
 
 		 454 aa  186  6e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1447  membrane-associated zinc metalloprotease  30.75 
 
 		 469 aa  186  8e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.843225  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1277  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31 
 
 		 456 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.358202  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3046  putative membrane-associated zinc metalloprotease  33.69 
 
 		 450 aa  184  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1856  peptidase RseP  29.94 
 
 		 454 aa  184  3e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2628  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.67 
 
 		 453 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000538528  normal  0.548541 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1355  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.64 
 
 		 456 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000225455  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1108  peptidase RseP  30.89 
 
 		 450 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.200515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2808  peptidase RseP  31.73 
 
 		 456 aa  181  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000246609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1459  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.03 
 
 		 455 aa  182  2e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  31.17 
 
 		 458 aa  181  2.9999999999999997e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.3628  normal  0.340979 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2541  putative membrane-associated zinc metalloprotease  32.42 
 
 		 449 aa  180  4e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1689  peptidase RseP  30.15 
 
 		 461 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.439361  normal  0.213094 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2798  membrane-associated zinc metalloprotease  29.57 
 
 		 494 aa  179  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000647763  normal  0.117018 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2895  membrane-associated zinc metalloprotease  30.58 
 
 		 456 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000920242  normal  0.27342 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2701  peptidase RseP  30.9 
 
 		 456 aa  178  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000971838  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1534  protease ecfE  29.41 
 
 		 454 aa  177  3e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000633641  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2634  peptidase RseP  30.9 
 
 		 456 aa  177  3e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113842  normal  0.0898661 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1452  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.17 
 
 		 456 aa  177  5e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00139274  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2448  membrane-associated zinc metalloprotease  29.89 
 
 		 461 aa  177  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.699947  hitchhiker  0.00215564 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1523  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  29.32 
 
 		 455 aa  176  7e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1488  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.58 
 
 		 456 aa  176  8e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000665578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0815  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  31.99 
 
 		 454 aa  176  9e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.225956  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1636  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  30.58 
 
 		 456 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3274  membrane-associated zinc metalloprotease  31.92 
 
 		 461 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000455239  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1146  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  30.51 
 
 		 456 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0106908  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1457  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.96 
 
 		 456 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000042456  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5322  peptidase RseP  29.09 
 
 		 456 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430006  normal  0.522456 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1490  membrane-associated zinc metalloprotease  30.46 
 
 		 453 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01380  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  31.56 
 
 		 450 aa  173  5e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1166  membrane-associated zinc metalloprotease  29.77 
 
 		 454 aa  173  5e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351032  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0180  zinc metallopeptidase RseP  32.3 
 
 		 450 aa  173  6.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000271457  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0568  hypothetical protein  31.81 
 
 		 450 aa  172  1e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00174  zinc metallopeptidase  32.3 
 
 		 450 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0881068  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3427  membrane-associated zinc metalloprotease  32.3 
 
 		 450 aa  171  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000034207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00173  hypothetical protein  32.3 
 
 		 450 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.131717  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3484  zinc metallopeptidase RseP  32.3 
 
 		 450 aa  171  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00175231  normal  0.0731606 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0178  zinc metallopeptidase RseP  32.3 
 
 		 450 aa  171  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111428  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1560  membrane-associated zinc metalloprotease EcfE  30.54 
 
 		 452 aa  171  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.294155  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1561  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  30.61 
 
 		 456 aa  171  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000461405  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0186  zinc metallopeptidase RseP  32.3 
 
 		 450 aa  171  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000411751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0187  zinc metallopeptidase RseP  32.3 
 
 		 450 aa  171  3e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000756829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2576  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  28.39 
 
 		 463 aa  170  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.222453  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2485  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  28.39 
 
 		 463 aa  170  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3998  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.73 
 
 		 441 aa  169  7e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.434108 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2429  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  28.75 
 
 		 463 aa  169  8e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0781389  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1331  membrane-associated zinc metalloprotease  30.49 
 
 		 462 aa  169  9e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1548  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  28.75 
 
 		 463 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2606  membrane-associated zinc metalloprotease  27.87 
 
 		 456 aa  169  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.514268  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3263  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.75 
 
 		 463 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.388567  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0169  zinc metallopeptidase RseP  32.08 
 
 		 450 aa  169  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000438283  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1442  peptidase RseP  28.09 
 
 		 463 aa  168  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000104376 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2048  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.75 
 
 		 463 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1320  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.75 
 
 		 463 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0767878  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3154  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.06 
 
 		 461 aa  169  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000101225  hitchhiker  0.00850689 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0534  protease EcfE  31.14 
 
 		 459 aa  168  2e-40  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.196657  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1387  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.48 
 
 		 480 aa  167  2.9999999999999998e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.204632  normal  0.0100882 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2878  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.02 
 
 		 456 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000126252  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1264  membrane-associated zinc metalloprotease  29.66 
 
 		 456 aa  166  9e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0544  hypothetical protein  32.06 
 
 		 475 aa  164  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1914  putative membrane-associated Zn-dependent protease  29.71 
 
 		 446 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0382298  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0714  zinc metallopeptidase RseP  31.51 
 
 		 450 aa  165  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000864253  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0948  zinc metallopeptidase RseP  31.19 
 
 		 451 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000214354  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2034  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  27.8 
 
 		 463 aa  164  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.931148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>