151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1342 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_2154  DNA polymerase II  45.91 
 
 
783 aa  706  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  7.68017e-06  hitchhiker  0.000641936 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0961  DNA polymerase II  52.02 
 
 
785 aa  808  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0393  DNA polymerase II  47.47 
 
 
794 aa  748  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1884  DNA polymerase II  52.08 
 
 
786 aa  797  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.115615  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1342  DNA polymerase Pol2  100 
 
 
781 aa  1584  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  2.27387e-08  normal  0.522725 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1049  DNA polymerase II  52.47 
 
 
783 aa  791  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0144376 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1320  DNA polymerase II  50.95 
 
 
784 aa  764  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.4978 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1060  DNA-directed DNA polymerase  30.28 
 
 
764 aa  404  1e-111  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.474491  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0530  DNA polymerase Pol2  29.48 
 
 
781 aa  334  4e-90  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1378  DNA polymerase Pol2  28.66 
 
 
780 aa  328  2e-88  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00266736 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1258  replicative DNA polymerase I  29.07 
 
 
780 aa  325  2e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1367  DNA polymerase Pol2  28.98 
 
 
810 aa  303  8e-81  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.815142  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0653  DNA polymerase Pol2  27.82 
 
 
811 aa  300  9e-80  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1397  DNA polymerase Pol2  27.33 
 
 
941 aa  273  1e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.61356  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1688  replicative DNA polymerase I  27.75 
 
 
910 aa  271  3e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1777  replicative DNA polymerase I  28.79 
 
 
932 aa  265  2e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.227569  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0798  DNA polymerase B region  29.43 
 
 
812 aa  255  2e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.189737  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1740  DNA polymerase B region  28.78 
 
 
795 aa  250  8e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.883106  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0616  hypothetical protein  28.11 
 
 
796 aa  241  5e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1499  DNA-directed DNA polymerase  28.92 
 
 
912 aa  233  8e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1108  DNA polymerase B region  28.82 
 
 
821 aa  231  3e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.42537  normal  0.497226 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44713  predicted protein  26.94 
 
 
982 aa  230  6e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0816  DNA polymerase I  28.66 
 
 
854 aa  230  7e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.766661  hitchhiker  0.00661096 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1156  DNA polymerase B region  28.2 
 
 
818 aa  221  3e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.809491  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0922  DNA-directed DNA polymerase  28.87 
 
 
607 aa  219  1e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.434202  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00560  delta DNA polymerase, putative  27.42 
 
 
1058 aa  219  1e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63206  DNA polymerase delta catalytic subunit (DNA polymerase III)  27.32 
 
 
1070 aa  218  3e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.442314 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1087  DNA polymerase I  27.96 
 
 
853 aa  218  5e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1361  DNA polymerase I  27.5 
 
 
854 aa  217  7e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0798  DNA polymerase I  28.03 
 
 
853 aa  217  9e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54677  DNA polymerase delta  26.7 
 
 
1087 aa  214  6e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1316  DNA-directed DNA polymerase  26.03 
 
 
784 aa  212  2e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.198282  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1907  DNA polymerase I  27.5 
 
 
877 aa  209  2e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.488214 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0298  DNA polymerase I  26.71 
 
 
835 aa  202  2e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.131674  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1620  DNA-directed DNA polymerase  27.64 
 
 
882 aa  202  2e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0874595  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07325  catalytic subunit of DNA polymerase delta (Eurofung)  25.8 
 
 
1044 aa  199  2e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0144  DNA polymerase I  27.94 
 
 
871 aa  190  1e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.248865  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02749  DNA polymerase II  25.33 
 
 
816 aa  189  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0177  DNA polymerase B region  26.05 
 
 
929 aa  181  6e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1999  DNA polymerase II  27.59 
 
 
786 aa  180  8e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.449398  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2142  DNA polymerase II  26.71 
 
 
789 aa  175  2e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.249301  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1903  DNA polymerase II  27.22 
 
 
786 aa  175  3e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.856945 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0948  DNA polymerase I  24.61 
 
 
852 aa  172  3e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.158363 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2393  DNA polymerase II  27.17 
 
 
786 aa  171  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3302  DNA polymerase II  27.17 
 
 
786 aa  171  6e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4655  DNA polymerase II  27.48 
 
 
791 aa  169  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.230041  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0831  DNA polymerase II  24.03 
 
 
787 aa  169  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0134615  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04130  DNA polymerase alpha catalytic subunit, putative  25.47 
 
 
1485 aa  169  2e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.717791  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2361  DNA polymerase II  26.96 
 
 
787 aa  168  3e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.168731  normal  0.46504 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2621  DNA polymerase II  27.36 
 
 
787 aa  168  4e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00407821  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3734  DNA polymerase II  26.69 
 
 
787 aa  168  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1511  DNA polymerase II  26.04 
 
 
794 aa  167  9e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  1.96312e-05 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0375  DNA polymerase B region  27.5 
 
 
1353 aa  166  2e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3658  DNA polymerase II  27.17 
 
 
792 aa  165  2e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0583295  normal  0.426144 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0929  DNA polymerase II  27.17 
 
 
816 aa  165  4e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193818  normal  0.499363 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3630  DNA polymerase II  26.14 
 
 
786 aa  164  5e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003097  DNA polymerase II  24.37 
 
 
787 aa  163  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122511  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0731  DNA polymerase II  27.08 
 
 
787 aa  162  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.13833  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86981  DNA-directed DNA polymerase alpha Required for mitotic DNA synthesis, premeiotic DNA synthesis, recombination, and full sporulation  24.41 
 
 
1463 aa  162  3e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1250  DNA polymerase II  27.42 
 
 
801 aa  161  4e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0167112  hitchhiker  0.000178487 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0609  DNA polymerase II  26.97 
 
 
790 aa  160  6e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.231029  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40120  DNA polymerase II  27.1 
 
 
787 aa  160  6e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2210  DNA polymerase II  24.45 
 
 
782 aa  160  7e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.40989 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3400  DNA polymerase II  27.24 
 
 
788 aa  160  8e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1645  DNA polymerase II  26.38 
 
 
789 aa  160  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0528782  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_297  predicted protein  25.11 
 
 
990 aa  159  1e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400359  normal  0.313206 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3234  DNA polymerase II  26.96 
 
 
788 aa  159  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.642975 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3819  DNA polymerase II  26.2 
 
 
788 aa  158  4e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2482  DNA polymerase II  28.75 
 
 
795 aa  158  4e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.205655  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2629  DNA polymerase II  24.97 
 
 
810 aa  158  4e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0639534  hitchhiker  5.29366e-05 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5258  DNA polymerase II  25.92 
 
 
791 aa  157  5e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.946105  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2428  DNA polymerase II  27.06 
 
 
821 aa  155  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.124227  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4331  DNA polymerase II  25.76 
 
 
794 aa  156  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.333031 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5084  DNA polymerase II  27.2 
 
 
788 aa  156  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1820  DNA polymerase II  27.38 
 
 
808 aa  155  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0570  DNA polymerase II  27.46 
 
 
790 aa  155  3e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5848  DNA polymerase II  25.86 
 
 
794 aa  155  3e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.595461  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5012  DNA polymerase II  25.86 
 
 
794 aa  155  3e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2537  DNA polymerase II  27 
 
 
810 aa  155  3e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.132688  unclonable  4.08112e-05 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1567  DNA polymerase II  27.68 
 
 
793 aa  154  4e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000253112  hitchhiker  1.62261e-05 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2469  DNA polymerase II  27.17 
 
 
810 aa  154  4e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00196726  hitchhiker  0.000569309 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3085  DNA polymerase II  27.27 
 
 
807 aa  154  6e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000404512  hitchhiker  3.70941e-05 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00061  hypothetical protein  26.03 
 
 
783 aa  154  7e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00062  DNA polymerase II  26.03 
 
 
783 aa  154  7e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01452  DNA polymerase II  26.41 
 
 
790 aa  154  9e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0109  DNA polymerase II  26.43 
 
 
783 aa  153  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.455197  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1857  DNA polymerase II  26.89 
 
 
809 aa  153  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.885669  normal  0.10624 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3597  DNA polymerase II  26.09 
 
 
783 aa  152  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  unclonable  3.26268e-08 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0064  DNA polymerase II  26.09 
 
 
783 aa  152  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.406876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3539  DNA-directed DNA polymerase  26.09 
 
 
783 aa  152  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0052  DNA polymerase II  26.03 
 
 
783 aa  152  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3628  DNA polymerase II  26.1 
 
 
788 aa  152  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0102  DNA polymerase II  26.29 
 
 
783 aa  151  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2655  DNA polymerase II  25.42 
 
 
799 aa  151  4e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.697172  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0062  DNA polymerase II  25.96 
 
 
783 aa  151  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0283986  normal  0.967142 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3572  DNA polymerase II  26.64 
 
 
786 aa  151  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.252391 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4584  DNA polymerase II  26.19 
 
 
788 aa  150  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.657494  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0062  DNA polymerase II  26.09 
 
 
783 aa  150  7e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00931565  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0104  DNA polymerase II  25.85 
 
 
783 aa  150  1e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0103  DNA polymerase II  25.92 
 
 
783 aa  149  2e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.249231 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>