More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0296 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0296  GTP-binding signal recognition particle  100 
 
 
449 aa  898    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000583511  normal  0.0555503 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0597  GTP-binding signal recognition particle  52.07 
 
 
433 aa  467  9.999999999999999e-131  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.000223356  hitchhiker  0.00000371893 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1726  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  52.9 
 
 
431 aa  464  1e-129  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.878395 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1519  GTP-binding signal recognition particle  52.76 
 
 
433 aa  457  1e-127  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.262746  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1769  GTP-binding signal recognition particle  53.69 
 
 
433 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.0023858 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0502  GTP-binding signal recognition particle  46.79 
 
 
431 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0747031  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1757  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  45.84 
 
 
446 aa  395  1e-109  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.941567  normal  0.290924 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1950  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  46.65 
 
 
447 aa  387  1e-106  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.910344  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0141  signal recognition particle protein Srp54  40.18 
 
 
439 aa  352  1e-95  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0918  signal recognition particle protein Srp54  40 
 
 
443 aa  348  2e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1119  signal recognition particle protein Srp54  39.69 
 
 
450 aa  341  2e-92  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.227466  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0799  signal recognition particle protein Srp54  39.78 
 
 
450 aa  339  5e-92  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0917  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  41.44 
 
 
449 aa  337  2.9999999999999997e-91  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000000145882  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3023  signal recognition particle protein Srp54  39.46 
 
 
437 aa  333  4e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0865  signal recognition particle protein Srp54  39.25 
 
 
450 aa  333  4e-90  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0440978  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1474  signal recognition particle protein Srp54  38.78 
 
 
446 aa  332  6e-90  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.570422  decreased coverage  0.000118802 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0496  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  40.78 
 
 
464 aa  330  4e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.50914 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1260  signal recognition particle protein Srp54  41.78 
 
 
450 aa  329  6e-89  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1261  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  41.14 
 
 
469 aa  328  9e-89  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0369  signal recognition particle protein Srp54  41.69 
 
 
444 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1964  signal recognition particle protein Srp54  40.19 
 
 
443 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1226  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  41.23 
 
 
468 aa  323  4e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0025  signal recognition particle protein Srp54  39.78 
 
 
450 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.205386  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1802  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  38.9 
 
 
464 aa  319  5e-86  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0531  GTP-binding signal recognition particle  43.34 
 
 
442 aa  319  5e-86  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0544  signal recognition particle protein Srp54  38.02 
 
 
440 aa  317  2e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0717053  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1877  signal recognition particle protein Srp54  38.17 
 
 
441 aa  316  4e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.189511 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0260  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  40.5 
 
 
463 aa  316  5e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26018  IISP family transporter: Signal recognition particle 54 kDa protein (SRP54)  35.86 
 
 
513 aa  283  6.000000000000001e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13417  predicted protein  37.33 
 
 
510 aa  282  1e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0638  signal recognition particle protein  39.1 
 
 
444 aa  276  5e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000602256  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  36.77 
 
 
479 aa  270  2.9999999999999997e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  37.65 
 
 
469 aa  270  4e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  37.93 
 
 
444 aa  269  7e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_73416  Signal recognition particle 54 kDa protein  34.91 
 
 
561 aa  268  2e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0128602 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  36.11 
 
 
443 aa  265  1e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  37.99 
 
 
446 aa  264  2e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1418  signal recognition particle protein  35.7 
 
 
447 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000224408  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  36.45 
 
 
447 aa  262  1e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0296  signal recognition particle protein  36.36 
 
 
435 aa  261  2e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130095  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09710  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  36.64 
 
 
515 aa  260  3e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.955104 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  35.96 
 
 
446 aa  260  4e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  36.71 
 
 
446 aa  258  2e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1387  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  34.56 
 
 
443 aa  256  6e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133728  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3668  signal recognition particle protein  35.47 
 
 
449 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000016406  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3944  signal recognition particle protein  35.47 
 
 
449 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000995401  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1299  signal recognition particle protein  35.47 
 
 
449 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000157828  unclonable  2.8199000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3887  signal recognition particle protein  35.24 
 
 
449 aa  253  3e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000347799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3586  signal recognition particle protein  35.24 
 
 
449 aa  253  3e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3604  signal recognition particle protein  35.24 
 
 
449 aa  253  3e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000432061  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3893  signal recognition particle protein  35.24 
 
 
449 aa  253  3e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3859  signal recognition particle protein  35.24 
 
 
449 aa  253  3e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8952e-61 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  35.57 
 
 
449 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  34.34 
 
 
481 aa  251  2e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3696  signal recognition particle protein  35.01 
 
 
449 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000361017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3983  signal recognition particle protein  35.01 
 
 
449 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000408298  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1667  signal recognition particle protein  35.03 
 
 
444 aa  250  3e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000671364  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1450  signal recognition particle protein  35.96 
 
 
443 aa  250  4e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2497  signal recognition particle protein  35.47 
 
 
449 aa  250  4e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000243009  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0319  signal recognition particle protein  34.32 
 
 
439 aa  249  6e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000288102  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  36.11 
 
 
453 aa  249  7e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2449  signal recognition particle protein  33.03 
 
 
463 aa  249  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000152943  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1804  signal recognition particle protein  35.46 
 
 
512 aa  247  3e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08246  hypothetical protein similar to srpA gene product (Broad)  33.93 
 
 
542 aa  247  4e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0951188 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1611  signal recognition particle protein  35.59 
 
 
522 aa  246  6.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.000856469  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1286  signal recognition particle protein  34.34 
 
 
444 aa  245  9.999999999999999e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.524326  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1368  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  33.89 
 
 
447 aa  245  9.999999999999999e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018858  normal  0.195447 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  34.02 
 
 
448 aa  245  9.999999999999999e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  34.56 
 
 
455 aa  244  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000079449  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1538  signal recognition particle protein  34.68 
 
 
436 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000016303  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2888  signal recognition particle protein  34.49 
 
 
518 aa  244  3e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3390  signal recognition particle protein  32.81 
 
 
440 aa  244  3e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.202247  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0661  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  35.32 
 
 
535 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4358  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  33.1 
 
 
490 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366323  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0709  signal recognition particle protein  35.11 
 
 
448 aa  243  6e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000338232  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  33.1 
 
 
512 aa  243  7e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1563  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  34.88 
 
 
551 aa  243  7e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.333794  normal  0.0756555 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03630  Signal recognition particle 54 kDa protein, putative  33.7 
 
 
591 aa  242  1e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.641738  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3494  signal recognition particle protein  33.03 
 
 
453 aa  241  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.28336e-32 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0849  signal recognition particle protein  34.2 
 
 
459 aa  241  1e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.265552 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1417  signal recognition particle protein  34.71 
 
 
445 aa  241  1e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.0000000188375  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2754  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  32.71 
 
 
443 aa  241  1e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1985  signal recognition particle protein  34.4 
 
 
515 aa  241  2e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.421506  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1227  signal recognition particle protein  34.93 
 
 
433 aa  241  2e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121808  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1707  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  34.17 
 
 
511 aa  241  2.9999999999999997e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0983445  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1228  signal recognition particle protein  34.7 
 
 
433 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000301134  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3432  signal recognition particle protein  33.03 
 
 
453 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000327935  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0592  signal recognition particle protein  33.63 
 
 
515 aa  240  4e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  31.79 
 
 
450 aa  239  5.999999999999999e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000192246  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4758  signal recognition particle protein  32.21 
 
 
439 aa  239  5.999999999999999e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259533  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1321  signal recognition particle protein  34.11 
 
 
455 aa  239  8e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000465855  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1296  signal recognition particle protein  34.11 
 
 
455 aa  239  8e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000399025  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05710  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  35.42 
 
 
470 aa  239  8e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000640801  normal  0.0289565 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4622  signal recognition particle protein  33.48 
 
 
449 aa  239  9e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000364274  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0982  signal recognition particle protein Ffh  34.26 
 
 
521 aa  238  1e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0983  signal recognition particle protein  34.37 
 
 
525 aa  238  1e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0432973  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2056  signal recognition particle protein  34.91 
 
 
446 aa  239  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000690531  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2081  signal recognition particle protein  34.91 
 
 
517 aa  238  2e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  33.26 
 
 
452 aa  237  3e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1099  signal recognition particle protein  32.18 
 
 
453 aa  236  4e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000944997  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>