195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0533 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0533  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 
286 aa  584  1e-166  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00550121  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0819  rod shape-determining protein MreC  60.71 
 
 
280 aa  352  4e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.727253  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0866  rod shape-determining protein MreC  59.35 
 
 
280 aa  348  4e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1166  rod shape-determining protein MreC  55.43 
 
 
283 aa  325  4e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0711  rod shape-determining protein MreC  48.51 
 
 
276 aa  273  3e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0573  rod shape-determining protein MreC  46.92 
 
 
266 aa  255  5e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.431817 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1803  rod shape-determining protein MreC  48.88 
 
 
285 aa  248  8e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00570  rod shape-determining protein  33.33 
 
 
257 aa  112  9e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.119359  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3831  rod shape-determining protein MreC  34.67 
 
 
280 aa  110  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.277446  normal  0.172349 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1457  rod shape-determining protein MreC  28.41 
 
 
276 aa  110  4e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1875  rod shape-determining protein MreC  28.86 
 
 
274 aa  108  9e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.813624  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5926  Rod shape-determining protein MreC  31.28 
 
 
278 aa  108  9e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1395  rod shape-determining protein MreC  27.99 
 
 
295 aa  107  2e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0343017 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1406  rod shape-determining protein MreC  27.27 
 
 
278 aa  103  4e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.27011  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0807  rod shape-determining protein MreC  32.43 
 
 
278 aa  95.5  9e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0193  rod shape-determining protein MreC  28.14 
 
 
295 aa  94.4  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2397  rod shape-determining protein MreC  27.3 
 
 
283 aa  91.7  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  25.7 
 
 
286 aa  91.7  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2109  rod shape-determining protein MreC  27.3 
 
 
283 aa  91.7  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2221  rod shape-determining protein MreC  33.52 
 
 
283 aa  90.1  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  27.23 
 
 
283 aa  88.2  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3307  rod shape-determining protein MreC  27.51 
 
 
279 aa  88.6  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.198941  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2374  rod shape-determining protein MreC  32.25 
 
 
286 aa  84.7  1e-15  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.879579  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1509  hypothetical protein  30.91 
 
 
257 aa  84  2e-15  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  33 
 
 
288 aa  84.7  2e-15  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  4.45773e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0513  rod shape-determining protein MreC  27.57 
 
 
285 aa  80.5  3e-14  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  26.32 
 
 
272 aa  80.1  4e-14  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  26.57 
 
 
277 aa  79.7  5e-14  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  26.44 
 
 
275 aa  75.9  8e-13  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.16691e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0995  rod shape-determining protein MreC  26.42 
 
 
285 aa  73.6  3e-12  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30539  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  27.53 
 
 
285 aa  73.2  5e-12  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  26.32 
 
 
296 aa  72.8  6e-12  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.40817e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  26.55 
 
 
304 aa  72.4  8e-12  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  26.29 
 
 
359 aa  71.6  1e-11  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1389  rod shape-determining protein MreC  27.67 
 
 
283 aa  72  1e-11  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0664  rod shape-determining protein MreC  24.74 
 
 
283 aa  72  1e-11  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.084926  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2548  rod shape-determining protein MreC  24.52 
 
 
288 aa  70.9  2e-11  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0372801  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  25.42 
 
 
288 aa  70.9  2e-11  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  23.45 
 
 
274 aa  71.6  2e-11  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3357  rod shape-determining protein MreC  24.14 
 
 
338 aa  70.1  3e-11  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368226  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  24.72 
 
 
281 aa  70.5  3e-11  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  26.75 
 
 
299 aa  70.1  4e-11  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  26.6 
 
 
277 aa  70.1  4e-11  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  1.23073e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  28.64 
 
 
273 aa  70.1  4e-11  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  26.13 
 
 
296 aa  69.7  5e-11  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2185  rod shape-determining protein MreC  28.63 
 
 
304 aa  69.7  5e-11  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  25.85 
 
 
274 aa  68.9  8e-11  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1350  rod shape-determining protein MreC  26.53 
 
 
287 aa  68.6  1e-10  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4585  rod shape-determining protein MreC  25.28 
 
 
283 aa  68.6  1e-10  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0107516  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4543  rod shape-determining protein MreC  25.84 
 
 
283 aa  67.4  3e-10  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1214  rod shape-determining protein MreC  26.13 
 
 
283 aa  67.4  3e-10  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0182396  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3166  rod shape-determining protein MreC  26.22 
 
 
285 aa  66.6  4e-10  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4570  rod shape-determining protein MreC  24.16 
 
 
283 aa  66.2  6e-10  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00639846  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  25.28 
 
 
274 aa  66.2  6e-10  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  24.78 
 
 
273 aa  64.7  2e-09  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1490  rod shape-determining protein MreC  28.96 
 
 
381 aa  64.3  2e-09  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.116968 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0839  Rod shape-determining protein MreC  25.54 
 
 
284 aa  63.5  3e-09  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4196  rod shape-determining protein MreC  24.72 
 
 
283 aa  63.9  3e-09  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4297  rod shape-determining protein MreC  22.49 
 
 
283 aa  63.5  3e-09  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4185  rod shape-determining protein MreC  25.28 
 
 
283 aa  63.5  4e-09  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2562  rod shape-determining protein MreC  26.2 
 
 
286 aa  63.5  4e-09  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.028075  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1686  rod shape-determining protein MreC  31.43 
 
 
273 aa  63.2  5e-09  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.134471 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1213  rod shape-determining protein MreC  27.88 
 
 
279 aa  62.8  6e-09  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  1.51101e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5931  rod shape-determining protein MreC  29.8 
 
 
296 aa  62.4  8e-09  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0609837  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0163  rod shape-determining protein MreC  27.75 
 
 
296 aa  62.4  9e-09  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0588  rod shape-determining protein MreC  25.97 
 
 
316 aa  62  1e-08  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0508667  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0669  rod shape-determining protein MreC  25.97 
 
 
316 aa  62  1e-08  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.111553  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  23.36 
 
 
274 aa  61.2  2e-08  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1460  rod shape-determining protein MreC  30.81 
 
 
273 aa  60.8  2e-08  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  5.90087e-08  hitchhiker  3.34343e-06 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4349  rod shape-determining protein MreC  23.6 
 
 
283 aa  60.8  2e-08  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.287267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4683  rod shape-determining protein MreC  23.6 
 
 
283 aa  60.8  2e-08  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  28.42 
 
 
243 aa  61.2  2e-08  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4531  rod shape-determining protein MreC  24.16 
 
 
283 aa  60.1  4e-08  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0484  rod shape-determining protein MreC  23.84 
 
 
285 aa  59.7  5e-08  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116086  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  26.64 
 
 
357 aa  59.3  6e-08  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2536  rod shape-determining protein MreC  31.16 
 
 
291 aa  58.9  9e-08  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  22.83 
 
 
271 aa  58.9  1e-07  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3390  rod shape-determining protein MreC  23.9 
 
 
257 aa  58.5  1e-07  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4169  rod shape-determining protein MreC  25.48 
 
 
249 aa  58.5  1e-07  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00060382  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4129  rod shape-determining protein MreC  25.48 
 
 
249 aa  58.5  1e-07  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0839  rod shape-determining protein MreC  27.07 
 
 
362 aa  58.5  1e-07  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237231  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2467  rod shape-determining protein MreC  25.99 
 
 
366 aa  58.5  1e-07  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.323191 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  24.83 
 
 
317 aa  58.2  2e-07  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  4.08962e-08 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3387  Rod shape-determining protein MreC  29.93 
 
 
298 aa  58.2  2e-07  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165741  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1628  rod shape-determining protein MreC  27.56 
 
 
276 aa  57  3e-07  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0740  rod shape-determining protein MreC  27.44 
 
 
281 aa  57  3e-07  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.394484  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  21.76 
 
 
317 aa  57.4  3e-07  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0574  rod shape-determining protein MreC  24.64 
 
 
285 aa  57.4  3e-07  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.931469  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  25.65 
 
 
292 aa  57  4e-07  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1631  rod shape-determining protein MreC  25.58 
 
 
282 aa  57  4e-07  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.017053  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1733  Rod shape-determining protein MreC  26.54 
 
 
256 aa  56.6  4e-07  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000284211  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2500  rod shape-determining protein MreC  24.15 
 
 
291 aa  56.6  5e-07  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09210  cell shape-determining protein  28.57 
 
 
425 aa  55.8  8e-07  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.76787 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  25.88 
 
 
272 aa  55.8  8e-07  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0299  rod shape-determining protein MreC  26.88 
 
 
249 aa  55.5  1e-06  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0934  rod shape-determining protein MreC  27.11 
 
 
332 aa  55.1  1e-06  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1355  rod shape-determining protein MreC  23.67 
 
 
291 aa  55.1  1e-06  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1317  rod shape-determining protein MreC  28.71 
 
 
297 aa  55.5  1e-06  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0592341  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1706  rod shape-determining protein MreC  24.7 
 
 
280 aa  55.1  1e-06  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00180064  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1739  rod shape-determining protein MreC  24.7 
 
 
280 aa  55.1  1e-06  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  9.99106e-05  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>