More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1450 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_1450  peptide ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  100 
 
 
511 aa  1037  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  4.30411e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1935  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  66.26 
 
 
511 aa  685  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1569  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  66.34 
 
 
511 aa  700  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1755  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  65.66 
 
 
511 aa  689  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1652  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  53.32 
 
 
511 aa  571  1e-161  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.2387  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2116  hypothetical protein  52.53 
 
 
510 aa  542  1e-153  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0169  hypothetical protein  33.4 
 
 
518 aa  271  3e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  31.9 
 
 
538 aa  258  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  32.31 
 
 
538 aa  257  3e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  30.02 
 
 
509 aa  256  5e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  31.56 
 
 
533 aa  248  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  32.12 
 
 
534 aa  244  3e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  30.88 
 
 
540 aa  240  4e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  30.25 
 
 
540 aa  240  5e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3039  4-phytase  29.39 
 
 
518 aa  237  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  30.14 
 
 
539 aa  236  6e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  1.25789e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  29.66 
 
 
546 aa  235  1e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  7.75897e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  31.84 
 
 
576 aa  234  2e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  29.88 
 
 
565 aa  228  2e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  31.82 
 
 
551 aa  220  6e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  28.74 
 
 
526 aa  218  2e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  30.41 
 
 
508 aa  216  1e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1538  extracellular solute-binding protein family 5  29.18 
 
 
563 aa  215  2e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000498479  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0094  extracellular solute-binding protein  29.01 
 
 
498 aa  198  2e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0910  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 
555 aa  191  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.463169  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5725  extracellular solute-binding protein family 5  27.65 
 
 
519 aa  192  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  27.92 
 
 
505 aa  189  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  28.41 
 
 
520 aa  188  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 
559 aa  187  3e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  29.42 
 
 
502 aa  187  4e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  31.13 
 
 
528 aa  184  2e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  28.21 
 
 
509 aa  185  2e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7214  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  32.87 
 
 
532 aa  184  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  29.67 
 
 
528 aa  183  6e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  3.82125e-05  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  28.82 
 
 
516 aa  182  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  28.94 
 
 
520 aa  182  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1902  extracellular solute-binding protein family 5  26.78 
 
 
501 aa  182  1e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000145643  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  27.77 
 
 
557 aa  181  3e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  26.68 
 
 
532 aa  180  6e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  1.84044e-11  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4611  extracellular solute-binding protein family 5  28.45 
 
 
553 aa  179  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.596915 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0140  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.3 
 
 
534 aa  178  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259377  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5299  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  28.46 
 
 
556 aa  178  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4877  putative ABC transporter, substrate binding protein  29.81 
 
 
560 aa  177  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.674427  normal  0.0830201 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4683  extracellular solute-binding protein  30.79 
 
 
564 aa  177  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2203  extracellular solute-binding protein family 5  28.72 
 
 
549 aa  176  8e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1860  extracellular solute-binding protein family 5  27.99 
 
 
544 aa  176  9e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.44883  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  28.6 
 
 
544 aa  176  1e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  29.17 
 
 
542 aa  176  1e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  29.51 
 
 
544 aa  175  2e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  28.35 
 
 
524 aa  174  3e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.72 
 
 
510 aa  174  3e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0161  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.52 
 
 
529 aa  174  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.485134  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1284  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  29.19 
 
 
545 aa  173  8e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000669385  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  28.27 
 
 
524 aa  171  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0520  extracellular solute-binding protein family 5  27.97 
 
 
545 aa  172  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2547  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 
534 aa  172  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1565  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  30.07 
 
 
534 aa  172  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4831  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  29.02 
 
 
527 aa  169  9e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153883  normal  0.947205 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  31.26 
 
 
532 aa  169  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  27.9 
 
 
536 aa  169  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2583  putative ABC transporter, substrate binding subunit  30.07 
 
 
524 aa  168  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0432339 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  29.18 
 
 
528 aa  167  4e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0645  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  29.47 
 
 
524 aa  167  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1518  peptide ABC transporter, peptide-binding protein  28.51 
 
 
538 aa  166  1e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000374669  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0208  extracellular solute-binding protein  27.84 
 
 
575 aa  166  1e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0132  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 
532 aa  165  2e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  25.41 
 
 
510 aa  165  2e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.64 
 
 
539 aa  164  2e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0266  extracellular solute-binding protein family 5  27.98 
 
 
575 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0996  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.29 
 
 
528 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.41324e-61 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0807  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.29 
 
 
528 aa  164  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  1.07652e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0106  extracellular solute-binding protein family 5  29.11 
 
 
533 aa  164  4e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0909337  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0725  extracellular solute-binding protein  30.37 
 
 
556 aa  164  4e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0858  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  27.35 
 
 
528 aa  164  5e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  4.78589e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1000  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.29 
 
 
529 aa  163  5e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7212  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  29.19 
 
 
531 aa  163  5e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0908  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  27.35 
 
 
528 aa  164  5e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  8.13115e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  28.17 
 
 
512 aa  163  7e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  29.21 
 
 
515 aa  163  9e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2258  solute-binding family 5 protein  27.16 
 
 
579 aa  162  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2555  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, oligopeptide/dipeptide-binding protein  27.16 
 
 
580 aa  162  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0750  extracellular solute-binding protein  26.23 
 
 
535 aa  162  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  29.45 
 
 
534 aa  162  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0822  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.14 
 
 
528 aa  162  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.76887e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1321  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  27.36 
 
 
513 aa  161  2e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  4.77414e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  28.17 
 
 
532 aa  161  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0803  extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 
529 aa  161  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  1.65149e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  27.93 
 
 
535 aa  161  3e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1834  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  26.32 
 
 
523 aa  160  4e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.250373  hitchhiker  0.0023879 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1621  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.18 
 
 
594 aa  160  5e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4386  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.88 
 
 
529 aa  160  5e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.775513  hitchhiker  3.14637e-22 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1507  extracellular solute-binding protein family 5  28.09 
 
 
516 aa  160  6e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221484  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4254  extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 
527 aa  160  6e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340537  normal  0.123719 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0748  extracellular solute-binding protein  25.66 
 
 
535 aa  160  6e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0044  extracellular solute-binding protein family 5  26.95 
 
 
535 aa  160  6e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0691  extracellular solute-binding protein family 5  27.7 
 
 
600 aa  160  6e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0219  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 
575 aa  160  7e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  29.7 
 
 
535 aa  159  8e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  27.15 
 
 
535 aa  159  9e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0945  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.48 
 
 
528 aa  159  9e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00751792  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>