More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2075 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2075  Cytochrome-c oxidase  100 
 
 
215 aa  436  1e-121  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15710  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  78.4 
 
 
213 aa  338  5e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.674032  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2008  cytochrome c oxidase subunit III  82.09 
 
 
218 aa  333  1e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.481722  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1446  cytochrome c oxidase subunit III  74.18 
 
 
213 aa  326  2.0000000000000001e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.190204  normal  0.245723 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1892  cytochrome c oxidase subunit III  70 
 
 
211 aa  298  6e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101725  hitchhiker  0.000286925 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1946  cytochrome c oxidase subunit III  65.57 
 
 
224 aa  292  3e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000125492 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2209  cytochrome c oxidase, subunit III  66.51 
 
 
212 aa  291  6e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00141599  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3134  cytochrome c oxidase, subunit III  62.79 
 
 
215 aa  275  5e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3250  cytochrome c oxidase subunit III  61.01 
 
 
219 aa  271  5.000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0735358 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16180  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  60.75 
 
 
217 aa  268  5e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.107626  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12120  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  64.8 
 
 
212 aa  266  1e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0237313  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14190  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  54.71 
 
 
244 aa  248  7e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124552  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1296  cytochrome-c oxidase  58.33 
 
 
205 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.805813 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3063  Cytochrome-c oxidase  63.89 
 
 
217 aa  242  3.9999999999999997e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458737  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2677  Cytochrome-c oxidase  60.82 
 
 
205 aa  232  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.697367 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1677  cytochrome c oxidase subunit III  57.71 
 
 
206 aa  228  5e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881512  normal  0.222894 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3302  cytochrome c oxidase, subunit III  60.61 
 
 
203 aa  225  4e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.639722  normal  0.219398 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3353  cytochrome c oxidase, subunit III  60.61 
 
 
203 aa  225  4e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2956  cytochrome c oxidase, subunit III  60.1 
 
 
220 aa  224  7e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112346  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3055  Cytochrome-c oxidase  59 
 
 
205 aa  223  1e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.407956  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3135  Cytochrome-c oxidase  56.16 
 
 
208 aa  221  4.9999999999999996e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3557  cytochrome c oxidase, subunit III  60.1 
 
 
220 aa  221  6e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3340  Cytochrome-c oxidase  60.3 
 
 
208 aa  221  7e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4120  Cytochrome-c oxidase  55.66 
 
 
200 aa  221  8e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929846  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3295  cytochrome c oxidase, subunit III  55.5 
 
 
199 aa  219  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.496142  normal  0.166605 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5384  cytochrome c oxidase, subunit III  60.1 
 
 
197 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3527  cytochrome c oxidase subunit III  55.5 
 
 
199 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5349  cytochrome c oxidase, subunit III  59.09 
 
 
197 aa  217  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2809  cytochrome c oxidase, subunit III  59.09 
 
 
197 aa  217  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5662  cytochrome c oxidase, subunit III  59.09 
 
 
197 aa  217  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3712  cytochrome c oxidase, subunit III  59.09 
 
 
197 aa  217  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.386532  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0964  cytochrome c oxidase, subunit III  52 
 
 
223 aa  216  2e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.158798 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12221  cytochrome C oxidase subunit III ctaE  56.57 
 
 
203 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3108  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  53.1 
 
 
239 aa  213  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175944  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3291  cytochrome c oxidase, subunit III  60.21 
 
 
180 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482439  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1022  cytochrome c oxidase subunit III  54.9 
 
 
194 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.113935  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1373  cytochrome c oxidase subunit III  57.01 
 
 
204 aa  211  7.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.907318  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10670  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  53.39 
 
 
209 aa  204  1e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364587  normal  0.27284 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2692  Cytochrome-c oxidase  58.33 
 
 
181 aa  203  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.48074  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3248  Cytochrome-c oxidase  56.28 
 
 
206 aa  202  3e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00270842  hitchhiker  0.0000224641 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1809  cytochrome c oxidase subunit III  50.88 
 
 
212 aa  201  7e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1828  cytochrome c oxidase subunit III  43.81 
 
 
198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  36.6 
 
 
206 aa  112  4.0000000000000004e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  35.07 
 
 
195 aa  109  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  33.33 
 
 
211 aa  107  9.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3541  cytochrome c oxidase, subunit I  37.14 
 
 
743 aa  107  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0448  cytochrome c oxidase subunit III  36.92 
 
 
197 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  34.87 
 
 
207 aa  105  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  34.36 
 
 
214 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  33.01 
 
 
208 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  33.66 
 
 
208 aa  101  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  32.42 
 
 
203 aa  100  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3956  cytochrome c oxidase subunit III  34.87 
 
 
210 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0305  cytochrome c oxidase subunit III  34.2 
 
 
283 aa  99.4  4e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0569  cytochrome c oxidase subunit III  37.31 
 
 
205 aa  99.4  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0586  Cytochrome-c oxidase  37.31 
 
 
205 aa  99.4  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12651  cytochrome c oxidase subunit III  32.06 
 
 
198 aa  98.2  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  32.42 
 
 
202 aa  98.2  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2639  cytochrome c oxidase  34.36 
 
 
198 aa  95.9  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0979  cytochrome c oxidase subunit III  34.27 
 
 
198 aa  94.4  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.139868  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1958  cytochrome c oxidase subunit III  36.36 
 
 
298 aa  94.4  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.631978  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0407  cytochrome c oxidase, subunit III  31.77 
 
 
196 aa  93.2  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2884  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  33.69 
 
 
203 aa  94  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03910  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III (Ubiquinol oxidase chain C)  31.16 
 
 
205 aa  94  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  35.68 
 
 
204 aa  94  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3271  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.26 
 
 
204 aa  92.4  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1041  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  34.22 
 
 
204 aa  92  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0463711  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4148  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.07 
 
 
206 aa  91.7  7e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3860  cytochrome c oxidase, subunit III  32.07 
 
 
206 aa  91.7  8e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.516047  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3161  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  33.7 
 
 
209 aa  91.3  9e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000281204 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2812  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  33.7 
 
 
213 aa  91.3  9e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0044  ubiquinol oxidase subunit III  28.99 
 
 
209 aa  90.1  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2915  transmembrane cytochrome O ubiquinol oxidase (subunit III) oxidoreductase protein  33.16 
 
 
211 aa  89.7  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0164077  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4776  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  33.69 
 
 
222 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.485675  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0177  cytochrome c oxidase subunit III  34.63 
 
 
206 aa  89.7  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255539  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4352  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  31.52 
 
 
206 aa  89.7  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4220  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  31.52 
 
 
206 aa  89  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3793  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.62 
 
 
211 aa  89.4  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.425485  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0985  cytochrome c oxidase subunit III  31.1 
 
 
206 aa  89  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3647  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  33.88 
 
 
204 aa  88.6  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.435887  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0091  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  31.44 
 
 
203 aa  89  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3916  cytochrome c oxidase, subunit III  31.52 
 
 
206 aa  88.6  6e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0050  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  27.54 
 
 
209 aa  88.6  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0163303  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4300  cytochrome c oxidase subunit III  35.83 
 
 
204 aa  88.2  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000246716  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0044  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  28.5 
 
 
209 aa  87.8  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.240035  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3141  cytochrome c oxidase subunit III  33.02 
 
 
201 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.785996 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05493  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  31.91 
 
 
199 aa  87.8  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3825  cytochrome c oxidase, subunit III  31.02 
 
 
206 aa  87.4  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0572174 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0106  cytochrome c oxidase subunit III  30.93 
 
 
208 aa  87.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4033  cytochrome c oxidase, subunit III  30.98 
 
 
206 aa  87.8  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2267  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  31.25 
 
 
211 aa  87  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.462963  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0240  cytochrome c oxidase, subunit III  29.82 
 
 
209 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4243  cytochrome c oxidase, subunit III  39.16 
 
 
293 aa  87  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.373816  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0897  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  32.12 
 
 
204 aa  86.7  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.021824  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001555  cytochrome O ubiquinol oxidase subunit III  31.52 
 
 
200 aa  87.4  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4048  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  32.82 
 
 
221 aa  86.3  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235206  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0950  cytochrome c oxidase subunit III  32.61 
 
 
214 aa  85.9  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454047  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4071  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  28.84 
 
 
209 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.953748  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47180  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  28.84 
 
 
209 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.121208  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2714  ubiquinol oxidase, subunit III  30.92 
 
 
197 aa  85.9  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.67417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>