279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0996 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0996  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
455 aa  948  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0998  extracellular solute-binding protein family 1  61.16 
 
 
451 aa  572  1e-162  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  27.09 
 
 
417 aa  115  2e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0614  extracellular solute-binding protein family 1  26.74 
 
 
435 aa  114  5e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  24.27 
 
 
451 aa  109  9e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  5.53575e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  24.5 
 
 
441 aa  103  7e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  22.62 
 
 
441 aa  102  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  29.79 
 
 
420 aa  99.8  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  26 
 
 
444 aa  97.1  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  3.99953e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  25.57 
 
 
468 aa  91.3  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  27.55 
 
 
422 aa  89.7  9e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  27.54 
 
 
439 aa  87.4  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  25.54 
 
 
408 aa  86.7  8e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  8.92518e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  25.84 
 
 
470 aa  86.3  1e-15  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  25.39 
 
 
423 aa  85.5  2e-15  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1136  extracellular solute-binding protein family 1  25.88 
 
 
431 aa  84.3  4e-15  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0296  hypothetical protein  27.03 
 
 
439 aa  82.8  1e-14  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  26.16 
 
 
435 aa  81.6  2e-14  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0059  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 
439 aa  81.6  3e-14  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  27.11 
 
 
434 aa  81.3  3e-14  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0434  extracellular solute-binding protein family 1  24.72 
 
 
444 aa  80.9  5e-14  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0598  extracellular solute-binding protein family 1  26.64 
 
 
446 aa  80.5  6e-14  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.764573  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  22.81 
 
 
424 aa  80.5  6e-14  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  28.1 
 
 
427 aa  80.1  7e-14  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  23.5 
 
 
455 aa  80.1  8e-14  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3651  hypothetical protein  25.83 
 
 
437 aa  79.3  1e-13  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.943877  normal  0.0762923 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4547  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 
423 aa  78.6  2e-13  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.909678  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  24.91 
 
 
427 aa  78.2  3e-13  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  25.59 
 
 
431 aa  78.2  3e-13  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1588  extracellular solute-binding protein  22.72 
 
 
452 aa  77.8  4e-13  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5027  extracellular solute-binding protein family 1  27.03 
 
 
434 aa  77.8  4e-13  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0894368  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1133  extracellular solute-binding protein family 1  25.09 
 
 
451 aa  77.4  5e-13  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3941  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.46 
 
 
436 aa  76.6  9e-13  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  25.34 
 
 
434 aa  75.9  1e-12  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27700  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.84 
 
 
426 aa  75.9  1e-12  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1301  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.01 
 
 
441 aa  75.1  2e-12  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  25.59 
 
 
434 aa  75.1  2e-12  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  21.47 
 
 
424 aa  75.1  2e-12  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 
408 aa  75.5  2e-12  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2306  extracellular solute-binding protein family 1  26.89 
 
 
432 aa  75.5  2e-12  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.432824  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  23.99 
 
 
422 aa  75.1  2e-12  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  25.65 
 
 
399 aa  73.9  5e-12  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  25.65 
 
 
413 aa  73.9  5e-12  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  24.37 
 
 
435 aa  74.3  5e-12  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3246  extracellular solute-binding protein family 1  24.09 
 
 
443 aa  73.6  7e-12  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5608  extracellular solute-binding protein family 1  22.19 
 
 
427 aa  73.2  9e-12  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.959607  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1355  extracellular solute-binding protein  28.31 
 
 
422 aa  72.8  1e-11  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120515 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  23.64 
 
 
495 aa  71.2  3e-11  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6532  extracellular solute-binding protein family 1  21.67 
 
 
427 aa  71.2  3e-11  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0178193 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.6 
 
 
427 aa  70.9  4e-11  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3251  extracellular solute-binding protein family 1  23.75 
 
 
428 aa  70.9  4e-11  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.292164  normal  0.0559218 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2234  extracellular solute-binding protein family 1  27.89 
 
 
419 aa  70.9  5e-11  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  28.26 
 
 
419 aa  70.5  7e-11  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  28.26 
 
 
420 aa  70.1  7e-11  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  28.26 
 
 
420 aa  70.1  7e-11  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  27.54 
 
 
419 aa  69.7  9e-11  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  8.66815e-05 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.69 
 
 
438 aa  69.7  1e-10  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1060  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  21.9 
 
 
408 aa  69.7  1e-10  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.065415  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2572  extracellular solute-binding protein  22.12 
 
 
414 aa  69.3  1e-10  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2049  extracellular solute-binding protein  26.64 
 
 
435 aa  69.3  1e-10  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  27.54 
 
 
419 aa  69.7  1e-10  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  22.06 
 
 
448 aa  68.6  2e-10  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0616  extracellular solute-binding protein family 1  23.56 
 
 
432 aa  68.6  2e-10  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  24.06 
 
 
410 aa  67.8  3e-10  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.71 
 
 
435 aa  68.2  3e-10  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3623  extracellular solute-binding protein family 1  21.94 
 
 
442 aa  67.4  5e-10  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00170169  normal  0.0768086 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8236  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  28.12 
 
 
434 aa  67  6e-10  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.764848 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  26.81 
 
 
419 aa  67  6e-10  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1113  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  21.95 
 
 
419 aa  66.6  9e-10  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0203061  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  27.5 
 
 
417 aa  66.2  1e-09  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1001  extracellular solute-binding protein family 1  25.4 
 
 
427 aa  65.9  1e-09  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.628257  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1597  extracellular solute-binding protein family 1  28.1 
 
 
456 aa  65.1  2e-09  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1696  extracellular solute-binding protein  25.3 
 
 
436 aa  65.1  2e-09  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00506774  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 
421 aa  65.1  3e-09  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2703  extracellular solute-binding protein family 1  23.58 
 
 
423 aa  64.3  4e-09  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.830349  normal  0.531916 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  23.1 
 
 
408 aa  64.3  4e-09  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09490  extracellular solute-binding protein family 1  22.37 
 
 
424 aa  63.9  6e-09  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.48456e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0208  extracellular solute-binding protein family 1  26.38 
 
 
454 aa  63.5  7e-09  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  21.92 
 
 
422 aa  63.5  8e-09  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2950  extracellular solute-binding protein  27.1 
 
 
435 aa  63.5  8e-09  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.110397  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6024  extracellular solute-binding protein  25.87 
 
 
412 aa  63.2  9e-09  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3657  sugar ABC transporter, substrate-binding protein  27.05 
 
 
423 aa  63.2  9e-09  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3858  extracellular solute-binding protein  26.75 
 
 
449 aa  63.2  9e-09  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  2.2263e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  25.87 
 
 
412 aa  62.8  1e-08  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7922  extracellular solute-binding protein family 1  24.49 
 
 
445 aa  62.8  1e-08  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6324  extracellular solute-binding protein  25.87 
 
 
412 aa  62.8  1e-08  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4984  extracellular solute-binding protein family 1  22.18 
 
 
428 aa  62.8  1e-08  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0972  extracellular solute-binding protein family 1  21.85 
 
 
442 aa  63.2  1e-08  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  25.87 
 
 
412 aa  62.8  1e-08  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  27.56 
 
 
414 aa  62.4  2e-08  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1105  extracellular solute-binding protein family 1  24.77 
 
 
442 aa  62  2e-08  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314126  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  25.63 
 
 
433 aa  62.4  2e-08  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2502  extracellular solute-binding protein family 1  24.76 
 
 
493 aa  61.6  3e-08  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0940  extracellular solute-binding protein family 1  24.47 
 
 
441 aa  61.6  3e-08  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.558741 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  23.56 
 
 
441 aa  61.2  4e-08  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3600  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 
425 aa  60.8  4e-08  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2072  extracellular solute-binding protein family 1  23.88 
 
 
431 aa  61.2  4e-08  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  2.38529e-08  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4609  extracellular solute-binding protein family 1  23.56 
 
 
427 aa  61.2  4e-08  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4241  extracellular solute-binding protein family 1  22.76 
 
 
422 aa  61.2  4e-08  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3716  extracellular solute-binding protein family 1  22.14 
 
 
440 aa  60.8  5e-08  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  4.72149e-06 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>