271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1936 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  435  1e-121  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2854  cyclase family protein  50 
 
 
213 aa  217  1e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2444  cyclase family protein  50 
 
 
214 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  47.12 
 
 
219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  43.4 
 
 
212 aa  193  1e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0103  cyclase family protein  47.39 
 
 
211 aa  184  9e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  44.66 
 
 
217 aa  171  7.999999999999999e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  33.02 
 
 
213 aa  141  9e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0346  hypothetical protein  34.6 
 
 
210 aa  135  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0361  hypothetical protein  34.6 
 
 
210 aa  135  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0461  hypothetical protein  34.27 
 
 
210 aa  135  5e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  34.6 
 
 
210 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0332  cyclase  34.6 
 
 
210 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0395  putative cyclase  34.27 
 
 
210 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0456  putative cyclase  34.27 
 
 
210 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0341  cyclase family protein  34.12 
 
 
210 aa  134  9e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0408  putative cyclase  33.8 
 
 
210 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  33.8 
 
 
210 aa  132  5e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1005  cyclase family protein  39.55 
 
 
214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.319318  normal  0.15577 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  36.45 
 
 
220 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0973  cyclase family protein  38.21 
 
 
208 aa  124  1e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0579739 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2609  cyclase family protein  34.56 
 
 
222 aa  122  5e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  33.17 
 
 
216 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4034  putative cyclase  37.44 
 
 
377 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1722  hypothetical protein  34.13 
 
 
201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.990715  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1077  cyclase family protein  34.43 
 
 
210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323976  normal  0.0992095 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2262  cyclase family protein  31.51 
 
 
236 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  30.48 
 
 
216 aa  119  3.9999999999999996e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1870  putative cyclase  36.99 
 
 
217 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124068  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3365  cyclase family protein  37.84 
 
 
216 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3915  cyclase family protein  40.11 
 
 
249 aa  115  3.9999999999999997e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4071  cyclase family protein  36.67 
 
 
207 aa  115  6e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65145  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3853  cyclase family protein  42 
 
 
193 aa  114  7.999999999999999e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00415586  normal  0.0437489 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0623  cyclase family protein  33.49 
 
 
220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0925  cyclase family protein  36.23 
 
 
215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2042  cyclase family protein  33.49 
 
 
210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111986 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1012  cyclase family protein  35.27 
 
 
224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1354  cyclase family protein  35.35 
 
 
229 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3349  cyclase, putative  32.09 
 
 
227 aa  112  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.471747  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0130  cyclase family protein  35.89 
 
 
216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0275  hypothetical protein  31.74 
 
 
238 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.228886 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  32.06 
 
 
226 aa  109  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0573  cyclase family protein  30.95 
 
 
209 aa  108  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0489129  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0174  cyclase family protein  33.02 
 
 
237 aa  108  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3004  cyclase family protein  36.04 
 
 
237 aa  108  8.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0209001  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  32.06 
 
 
226 aa  107  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0986  hypothetical protein  30.91 
 
 
219 aa  107  1e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.428694  normal  0.859391 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1971  cyclase family protein  32.72 
 
 
294 aa  107  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4339  cyclase family protein  33.01 
 
 
217 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0530585  decreased coverage  0.000845413 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0042  putative cyclase  35.19 
 
 
226 aa  106  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.836357 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1514  cyclase family protein  30.05 
 
 
205 aa  103  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5044  cyclase family protein  30.91 
 
 
219 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250627  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1500  cyclase family protein  32.29 
 
 
238 aa  103  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.256572  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5193  cyclase family protein  31.96 
 
 
295 aa  102  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.98741  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1367  cyclase family protein  32.54 
 
 
213 aa  102  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0951074 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2278  cyclase family protein  30.62 
 
 
205 aa  101  7e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000843972  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0812  cyclase family protein  28 
 
 
243 aa  100  1e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2301  putative cyclase  35.41 
 
 
217 aa  100  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.285068  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1205  cyclase family protein  32.09 
 
 
210 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0347  cyclase family protein  30.14 
 
 
205 aa  99.4  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  28.04 
 
 
214 aa  99.4  4e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1418  cyclase family protein  29.81 
 
 
205 aa  98.6  6e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0662308  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0374  putative cyclase  30.28 
 
 
228 aa  98.6  7e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13480  cyclase family protein  28.3 
 
 
221 aa  97.4  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0322742  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1294  cyclase family protein  29.41 
 
 
265 aa  96.7  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0317  cyclase family protein  34.62 
 
 
210 aa  95.5  5e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.555056  normal  0.951673 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1902  putative cyclase  32.2 
 
 
280 aa  94  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2226  cyclase family protein  33.01 
 
 
204 aa  93.2  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2610  putative cyclase  28.7 
 
 
261 aa  94  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1555  putative cyclase  25.22 
 
 
237 aa  92.8  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1511  putative cyclase  29.86 
 
 
217 aa  92.8  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.3685  normal  0.674616 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1749  twin-arginine translocation pathway signal  27.03 
 
 
272 aa  92  6e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.651596  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2561  hypothetical protein  31.56 
 
 
230 aa  91.7  8e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1868  cyclase family protein  29.91 
 
 
215 aa  91.7  8e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00308105  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2320  putative cyclase  27.13 
 
 
291 aa  91.7  8e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000000962152  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  29.91 
 
 
223 aa  90.9  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2933  cyclase family protein  30.7 
 
 
268 aa  90.5  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2003  cyclase family protein  32.86 
 
 
222 aa  89.7  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.134376  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2580  putative cyclase  30.94 
 
 
219 aa  89  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.450576 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2415  hypothetical protein  30.47 
 
 
231 aa  87.8  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0047  cyclase family protein  30.14 
 
 
213 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1259  cyclase family protein  28.77 
 
 
215 aa  87.4  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.240385  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0049  cyclase family protein  30.14 
 
 
213 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1418  hypothetical protein  30.09 
 
 
222 aa  86.7  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.822292  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1533  putative cyclase  34.27 
 
 
213 aa  87.4  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.141047  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4050  cyclase family protein  30.09 
 
 
275 aa  87  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0383  cyclase family protein  32.37 
 
 
205 aa  86.7  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.777945  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3116  cyclase family protein  32.59 
 
 
218 aa  86.7  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.018572  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0641  cyclase, putative  31.1 
 
 
208 aa  86.3  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0675  cyclase, putative  31.1 
 
 
208 aa  86.3  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0313  cyclase family protein  32.26 
 
 
256 aa  85.1  7e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0059  cyclase family protein  30.66 
 
 
213 aa  85.1  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2549  cyclase family protein  31.67 
 
 
216 aa  84.3  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.564227 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1211  cyclase family protein  29.2 
 
 
275 aa  84  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1973  cyclase family protein  29.83 
 
 
280 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.720532  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1902  cyclase family protein  35.29 
 
 
209 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258214  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2527  arylformamidase  37.43 
 
 
209 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001519 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1664  cyclase, putative  27.23 
 
 
231 aa  82  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.547861  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2765  arylformamidase  33.02 
 
 
209 aa  82  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.820064  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2558  cyclase family protein  32.7 
 
 
209 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>