More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0164 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0164  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  100 
 
 		 192 aa  391  1e-108  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0658  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  63.87 
 
 		 191 aa  235  4e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.545827  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0539  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  59.69 
 
 		 187 aa  219  3e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0476  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  58.03 
 
 		 190 aa  216  2e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1642  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  56.32 
 
 		 191 aa  208  4e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0497  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  54.21 
 
 		 187 aa  201  6e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.655461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0543  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  49.22 
 
 		 186 aa  189  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0769  Holliday junction resolvase  38.74 
 
 		 182 aa  140  9.999999999999999e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1109  Holliday junction resolvase  44.67 
 
 		 159 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000183978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2183  Holliday junction resolvase  35.45 
 
 		 200 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.198911 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1243  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.04 
 
 		 202 aa  131  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1114  Holliday junction resolvase  41.67 
 
 		 164 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  44.67 
 
 		 164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000174044 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3314  Holliday junction resolvase  44.67 
 
 		 164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1346  Holliday junction resolvase  38.51 
 
 		 166 aa  129  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000795843  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2672  Holliday junction resolvase  43.1 
 
 		 176 aa  128  6e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00163378  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2240  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34.39 
 
 		 182 aa  128  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0079  Holliday junction resolvase  33.33 
 
 		 181 aa  127  7.000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1798  Holliday junction endonuclease RuvC  39.33 
 
 		 161 aa  127  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582609 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1887  Holliday junction resolvase  44.97 
 
 		 173 aa  127  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0903  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.91 
 
 		 164 aa  125  3e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1438  Holliday junction resolvase  43.62 
 
 		 173 aa  124  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000786785  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2535  Holliday junction resolvase  46.32 
 
 		 173 aa  123  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.278528 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  43.62 
 
 		 173 aa  123  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00124897  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0400  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  33.16 
 
 		 187 aa  122  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.253093 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0111  Holliday junction resolvase  40.79 
 
 		 156 aa  122  3e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01598  Holliday junction resolvase  43.62 
 
 		 173 aa  121  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0740  Holliday junction resolvase  39.74 
 
 		 173 aa  121  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.100777  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3627  Holliday junction resolvase  39.33 
 
 		 165 aa  120  9e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535771  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0180  Holliday junction resolvase  36 
 
 		 162 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12330  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.33 
 
 		 165 aa  120  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.128626  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1221  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.67 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.69785  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3179  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.56 
 
 		 164 aa  119  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.844491  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1324  Holliday junction resolvase  36.13 
 
 		 189 aa  118  3.9999999999999996e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2400  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.57 
 
 		 191 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.553379  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1415  Holliday junction resolvase  42 
 
 		 171 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000523238  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1660  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.33 
 
 		 163 aa  118  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.183319  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0426  Holliday junction resolvase  40.13 
 
 		 181 aa  118  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.633574  normal  0.046933 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04920  Holliday junction resolvase  33.68 
 
 		 184 aa  117  7.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0995  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  43.87 
 
 		 183 aa  117  7.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.410626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1377  Holliday junction resolvase  33.68 
 
 		 184 aa  117  9e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.180632  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1702  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40 
 
 		 167 aa  117  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.131729  normal  0.717874 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2259  Holliday junction resolvase  44.12 
 
 		 173 aa  117  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2157  Holliday junction resolvase  44.85 
 
 		 173 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1408  Holliday junction resolvase  40.7 
 
 		 174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0741674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1747  Holliday junction resolvase  41.18 
 
 		 170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.607448  normal  0.595925 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0420  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.33 
 
 		 167 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1632  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.84 
 
 		 160 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.286173  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3618  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  43.79 
 
 		 166 aa  116  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1831  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  42.28 
 
 		 173 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0716  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.27 
 
 		 173 aa  116  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.075927  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1270  Holliday junction resolvase  42.2 
 
 		 174 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460583  normal  0.748169 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4409  Holliday junction resolvase  40.46 
 
 		 175 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.049138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0486  Holliday junction resolvase  38.55 
 
 		 181 aa  114  8.999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0443  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34.67 
 
 		 165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1666  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.18 
 
 		 163 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2104  Holliday junction resolvase  39.46 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  42.67 
 
 		 164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1364  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.67 
 
 		 162 aa  113  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.553646  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  42 
 
 		 164 aa  112  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2354  Holliday junction resolvase  39.87 
 
 		 180 aa  112  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.542113 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1573  Holliday junction resolvase  39.6 
 
 		 158 aa  112  3e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2011  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40 
 
 		 164 aa  112  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1897  Holliday junction resolvase  38.78 
 
 		 160 aa  112  4.0000000000000004e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2032  Holliday junction resolvase  43.38 
 
 		 173 aa  112  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000234301  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2145  Holliday junction resolvase  43.38 
 
 		 173 aa  112  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.25841  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_385  crossover junction endodeoxyribonuclease  34 
 
 		 165 aa  111  5e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1322  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.57 
 
 		 179 aa  112  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725718  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3343  Holliday junction resolvase  41.33 
 
 		 180 aa  111  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2423  Holliday junction resolvase  43.38 
 
 		 173 aa  112  5e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0385722  normal  0.655907 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3979  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.88 
 
 		 176 aa  111  6e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2431  Holliday junction resolvase  41.18 
 
 		 173 aa  111  6e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0114674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0026  Holliday junction resolvase  38.78 
 
 		 160 aa  111  6e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580095  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2093  Holliday junction resolvase  42.65 
 
 		 173 aa  111  6e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00029798  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2104  Holliday junction resolvase  36 
 
 		 159 aa  111  7.000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0617  Holliday junction resolvase  41.33 
 
 		 180 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0509  Holliday junction resolvase  42.65 
 
 		 189 aa  111  7.000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0379  Holliday junction resolvase  36.31 
 
 		 181 aa  111  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1822  Holliday junction resolvase  38.93 
 
 		 157 aa  111  8.000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.21855  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01834  Holliday junction resolvase  41.91 
 
 		 173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.837934  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1777  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.91 
 
 		 173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00202932  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1109  Holliday junction resolvase  41.91 
 
 		 173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0699  Holliday junction resolvase  39.61 
 
 		 194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.207762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1323  Holliday junction resolvase  41.91 
 
 		 173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2599  Holliday junction resolvase  41.91 
 
 		 173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109079  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0394  Holliday junction resolvase  36.31 
 
 		 181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.638558 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1249  Holliday junction resolvase  39.76 
 
 		 180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1247  Holliday junction resolvase  41.99 
 
 		 178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0671  Holliday junction resolvase  39.61 
 
 		 194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.674635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1769  Holliday junction resolvase  41.91 
 
 		 173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0125353  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01822  hypothetical protein  41.91 
 
 		 173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.621329  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1130  Holliday junction resolvase  42 
 
 		 275 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1452  Holliday junction resolvase  35.33 
 
 		 182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.883917  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1956  Holliday junction resolvase  41.91 
 
 		 173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.396234  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0268  Holliday junction resolvase  42 
 
 		 284 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3405  Holliday junction resolvase  42 
 
 		 180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1349  Holliday junction resolvase  41.18 
 
 		 173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353939 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2534  Holliday junction resolvase  42 
 
 		 180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0890  Holliday junction resolvase  35.1 
 
 		 164 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0795494 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3399  Holliday junction resolvase  42 
 
 		 180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>