More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7670 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7670  nucleotide sugar dehydrogenase  100 
 
 		 439 aa  887    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.888609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3900  UDP-glucose 6-dehydrogenase  67.86 
 
 		 456 aa  593  1e-168  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0133556 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1344  UDP-glucose 6-dehydrogenase  66.89 
 
 		 439 aa  589  1e-167  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.73347 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0408  UDP-glucose 6-dehydrogenase  66.97 
 
 		 439 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.782404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0421  nucleotide sugar dehydrogenase  63.8 
 
 		 439 aa  556  1e-157  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0713  nucleotide sugar dehydrogenase  64.63 
 
 		 437 aa  556  1e-157  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.227984 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0966  UDP-glucose 6-dehydrogenase  63.06 
 
 		 442 aa  551  1e-156  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0289  UDP-glucose 6-dehydrogenase  63.43 
 
 		 444 aa  547  1e-154  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0143156  normal  0.166513 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2901  nucleotide sugar dehydrogenase  62.95 
 
 		 443 aa  543  1e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00203008  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0931  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.39 
 
 		 442 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0948  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.39 
 
 		 442 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0598  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61.85 
 
 		 446 aa  535  1e-151  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.602937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4461  nucleotide sugar dehydrogenase  62.95 
 
 		 438 aa  537  1e-151  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10327  UDP-glucose 6-dehydrogenase udgA  62.39 
 
 		 443 aa  534  1e-150  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3207  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.08 
 
 		 437 aa  533  1e-150  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0912  nucleotide sugar dehydrogenase  63.35 
 
 		 439 aa  528  1e-149  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.680002  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26860  nucleotide sugar dehydrogenase  60.5 
 
 		 437 aa  528  1e-149  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2984  nucleotide sugar dehydrogenase  61.73 
 
 		 434 aa  525  1e-148  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5905  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.49 
 
 		 495 aa  523  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.717039 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3192  nucleotide sugar dehydrogenase  61.68 
 
 		 452 aa  524  1e-147  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972746  normal  0.0135987 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2544  UDP-glucose 6-dehydrogenase  63.12 
 
 		 462 aa  518  1e-146  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28520  nucleotide sugar dehydrogenase  60.32 
 
 		 494 aa  518  1e-146  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.55315  normal  0.0721644 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1163  nucleotide sugar dehydrogenase  60.45 
 
 		 477 aa  517  1.0000000000000001e-145  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3879  nucleotide sugar dehydrogenase  62.9 
 
 		 443 aa  511  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4579  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61.36 
 
 		 440 aa  509  1e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.473294  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3173  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.18 
 
 		 440 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4346  nucleotide sugar dehydrogenase  58.07 
 
 		 465 aa  503  1e-141  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282957  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3113  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.18 
 
 		 440 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0709  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60 
 
 		 444 aa  499  1e-140  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3549  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.55 
 
 		 547 aa  495  1e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6546  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.91 
 
 		 490 aa  484  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1006  nucleotide sugar dehydrogenase  60.77 
 
 		 435 aa  479  1e-134  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0179197 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7280  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.26 
 
 		 465 aa  476  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0910689 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08720  predicted UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.6 
 
 		 488 aa  474  1e-132  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0436357  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0875  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.19 
 
 		 475 aa  467  9.999999999999999e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.180829  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0933  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.96 
 
 		 475 aa  464  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.321058 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0034  nucleotide sugar dehydrogenase  53.59 
 
 		 440 aa  456  1e-127  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.250011 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02040  nucleotide sugar dehydrogenase  54.61 
 
 		 494 aa  441  1e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1069  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.44 
 
 		 454 aa  442  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5678  nucleotide sugar dehydrogenase  50.99 
 
 		 474 aa  438  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1504  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.1 
 
 		 438 aa  387  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.262172  normal  0.0661871 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1159  nucleotide sugar dehydrogenase  51.17 
 
 		 434 aa  358  9.999999999999999e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000026307 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2368  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.05 
 
 		 441 aa  356  3.9999999999999996e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.32995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.27 
 
 		 434 aa  344  2e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3775  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.99 
 
 		 434 aa  344  2e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0333  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.25 
 
 		 438 aa  341  1e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0119  nucleotide sugar dehydrogenase  39.5 
 
 		 435 aa  337  1.9999999999999998e-91  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000027408  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4447  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.79 
 
 		 438 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.86 
 
 		 451 aa  336  5.999999999999999e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0608813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2306  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.44 
 
 		 434 aa  335  1e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595452  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0653  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.44 
 
 		 434 aa  335  1e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0616726  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3370  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  42.18 
 
 		 438 aa  333  4e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  41.23 
 
 		 434 aa  332  1e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  40.55 
 
 		 442 aa  330  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2639  nucleotide sugar dehydrogenase  40.14 
 
 		 434 aa  330  4e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0698  nucleotide sugar dehydrogenase  40.86 
 
 		 459 aa  329  5.0000000000000004e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0795  nucleotide sugar dehydrogenase  39.91 
 
 		 434 aa  329  7e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2987  nucleotide sugar dehydrogenase  40.32 
 
 		 441 aa  329  7e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4606  nucleotide sugar dehydrogenase  41.04 
 
 		 456 aa  328  9e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.094228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3681  nucleotide sugar dehydrogenase  40.55 
 
 		 433 aa  327  3e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.72238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  40.91 
 
 		 440 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2489  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.59 
 
 		 436 aa  327  4.0000000000000003e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  40.77 
 
 		 434 aa  325  7e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  41 
 
 		 438 aa  325  1e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3028  nucleotide sugar dehydrogenase  41 
 
 		 438 aa  324  2e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1853  nucleotide sugar dehydrogenase  41.29 
 
 		 441 aa  323  4e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  37.56 
 
 		 427 aa  323  5e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1435  nucleotide sugar dehydrogenase  40.62 
 
 		 440 aa  323  6e-87  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1593  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.31 
 
 		 436 aa  322  7e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0901  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.44 
 
 		 440 aa  322  7e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.665804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3394  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.44 
 
 		 440 aa  322  7e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.852833  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2116  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.86 
 
 		 438 aa  322  8e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0210  UDP-glucose 6-dehydrogenase  44.34 
 
 		 453 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1839  nucleotide sugar dehydrogenase  40.77 
 
 		 434 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.86 
 
 		 436 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0953  nucleotide sugar dehydrogenase  42.15 
 
 		 447 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1352  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.09 
 
 		 443 aa  320  1.9999999999999998e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000465012  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4824  nucleotide sugar dehydrogenase  39.91 
 
 		 435 aa  320  3e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4098  hypothetical protein  41.5 
 
 		 464 aa  320  3e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.197765  normal  0.22433 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2329  nucleotide sugar dehydrogenase  39.77 
 
 		 439 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129467 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1585  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.76 
 
 		 435 aa  320  5e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4460  nucleotide sugar dehydrogenase  41.63 
 
 		 436 aa  319  7e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4441  nucleotide sugar dehydrogenase  41.63 
 
 		 435 aa  319  7e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3615  nucleotide sugar dehydrogenase  38.86 
 
 		 437 aa  318  1e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3925  nucleotide sugar dehydrogenase  38.86 
 
 		 437 aa  318  1e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107099  normal  0.0149623 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1947  nucleotide sugar dehydrogenase  41.08 
 
 		 463 aa  317  3e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.620289  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3526  nucleotide sugar dehydrogenase  38.78 
 
 		 443 aa  316  4e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0775  nucleotide sugar dehydrogenase  41.4 
 
 		 452 aa  316  4e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  39.59 
 
 		 446 aa  315  7e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0400  nucleotide sugar dehydrogenase  41.59 
 
 		 446 aa  315  9e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4548  nucleotide sugar dehydrogenase  40.45 
 
 		 436 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1502  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.53 
 
 		 438 aa  315  9.999999999999999e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.842125  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0064  nucleotide sugar dehydrogenase  38.5 
 
 		 442 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0265709  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1921  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.86 
 
 		 434 aa  314  1.9999999999999998e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455282  normal  0.479029 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0408  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.59 
 
 		 446 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.18 
 
 		 434 aa  313  2.9999999999999996e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1348  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.92 
 
 		 460 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.233315  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1858  nucleotide sugar dehydrogenase  39.38 
 
 		 450 aa  314  2.9999999999999996e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.840288  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1130  nucleotide sugar dehydrogenase  40.5 
 
 		 453 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3217  nucleotide sugar dehydrogenase  40.32 
 
 		 438 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>