205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7059 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7059  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 295 aa  591  1e-168  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3260  beta-lactamase domain-containing protein  38.64 
 
 		 275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1902  beta-lactamase domain-containing protein  36.81 
 
 		 287 aa  161  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.392348  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3034  beta-lactamase domain-containing protein  37.97 
 
 		 275 aa  152  8e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.641137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1577  beta-lactamase domain protein  36.13 
 
 		 272 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1653  beta-lactamase domain-containing protein  33.05 
 
 		 238 aa  109  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.139658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3186  beta-lactamase domain-containing protein  32.5 
 
 		 271 aa  98.6  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2893  beta-lactamase domain protein  31.01 
 
 		 271 aa  98.2  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  33.47 
 
 		 252 aa  95.1  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.231237 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  29.46 
 
 		 298 aa  92.8  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  31.2 
 
 		 314 aa  90.9  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  32.92 
 
 		 321 aa  89.7  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11942  hypothetical protein  28.68 
 
 		 250 aa  89  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0069  beta-lactamase-like  27.94 
 
 		 362 aa  87.8  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  30.64 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  29.91 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3402  beta-lactamase domain-containing protein  28.51 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.433473  normal  0.430357 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  26.34 
 
 		 308 aa  81.3  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  30.28 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  30.28 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  30.28 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  30.28 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  30.28 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  30.28 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  30.28 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3131  beta-lactamase domain-containing protein  28.81 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.833456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  32.51 
 
 		 264 aa  80.5  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  31.3 
 
 		 323 aa  80.5  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  29.5 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  30.99 
 
 		 349 aa  80.1  0.00000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5952  putative metallo-beta-lactamase family protein  36.48 
 
 		 308 aa  79.7  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  31.16 
 
 		 327 aa  79.7  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  31.15 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  27.73 
 
 		 318 aa  78.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  29.06 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  36.43 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0890  beta-lactamase-like  27.64 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  29.03 
 
 		 321 aa  75.1  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0922  beta-lactamase-like  29.29 
 
 		 318 aa  75.1  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  33.16 
 
 		 319 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5154  beta-lactamase domain protein  27.64 
 
 		 317 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692962  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  27.78 
 
 		 333 aa  73.9  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  37.74 
 
 		 313 aa  73.2  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  29.86 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1017  beta-lactamase-like  26.95 
 
 		 316 aa  72.8  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751913  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  30.41 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  29.86 
 
 		 319 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0849  beta-lactamase domain protein  26.6 
 
 		 321 aa  72  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185105  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  28.03 
 
 		 319 aa  72  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  27.92 
 
 		 312 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  29.95 
 
 		 319 aa  72  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  28.73 
 
 		 319 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  28.73 
 
 		 336 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  35.76 
 
 		 321 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  28.73 
 
 		 319 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  28.36 
 
 		 319 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  28.57 
 
 		 335 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  28.57 
 
 		 335 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  28.09 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0906  Beta-lactamase-like  27.14 
 
 		 316 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  27.5 
 
 		 339 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  30.77 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  27.7 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  28.06 
 
 		 339 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  29.68 
 
 		 317 aa  69.3  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  29.02 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  27.94 
 
 		 342 aa  68.6  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  28.63 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1888  hypothetical protein  26.83 
 
 		 321 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  29.41 
 
 		 319 aa  67  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  32.2 
 
 		 342 aa  67  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1103  putative hydrolase  26.09 
 
 		 312 aa  66.6  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197828  normal  0.352936 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  28.99 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1269  beta-lactamase domain-containing protein  28.5 
 
 		 331 aa  66.2  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18970  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  26.62 
 
 		 319 aa  65.9  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0850103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  28.63 
 
 		 318 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1709  beta-lactamase-like  27.06 
 
 		 353 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.587452  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0244  beta-lactamase domain protein  27.27 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0816903 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1866  beta-lactamase domain protein  26.42 
 
 		 320 aa  65.1  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.914687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  27.61 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  28.88 
 
 		 319 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1621  Beta-lactamase-like  24.05 
 
 		 334 aa  64.3  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.683443  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3742  Zn-dependent hydrolases  24.1 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  26.56 
 
 		 332 aa  64.3  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  28.88 
 
 		 319 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2500  beta-lactamase domain protein  28.2 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.397877 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2106  beta-lactamase domain protein  28.2 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.105061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1614  Beta-lactamase-like  26 
 
 		 339 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.835771  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  27.19 
 
 		 321 aa  63.5  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  24.26 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1880  Beta-lactamase-like  23.02 
 
 		 367 aa  63.2  0.000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000360179  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1920  beta-lactamase domain protein  25.76 
 
 		 320 aa  62.8  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274405  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1776  beta-lactamase domain-containing protein  30.08 
 
 		 310 aa  62.4  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2112  beta-lactamase domain protein  30.08 
 
 		 310 aa  62.4  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4537  beta-lactamase domain protein  28.79 
 
 		 314 aa  62  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.630097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  28.46 
 
 		 318 aa  62  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0250  beta-lactamase domain-containing protein  23.17 
 
 		 246 aa  62  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  24.66 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0666  beta-lactamase-like  25 
 
 		 329 aa  61.6  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257894  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0353  beta-lactamase-like  26.42 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586247  normal  0.377188 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>