233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6278 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6278  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 
393 aa  784    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435986  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1039  putative oxidoreductase  53.32 
 
 
387 aa  392  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0582367  normal  0.0597058 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1719  monooxygenase FAD-binding protein  43.62 
 
 
402 aa  297  2e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.861582  normal  0.177423 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2022  putative oxidoreductase  40.81 
 
 
407 aa  266  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.461121  normal  0.126773 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0928  monooxygenase FAD-binding  42.23 
 
 
424 aa  251  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.607239  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7487  putative oxidoreductase  41.74 
 
 
399 aa  236  5.0000000000000005e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455453  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4063  monooxygenase FAD-binding protein  40.81 
 
 
402 aa  229  7e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5557  monooxygenase FAD-binding protein  38.26 
 
 
371 aa  228  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0067  monooxygenase FAD-binding protein  42.03 
 
 
400 aa  225  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2401  monooxygenase, FAD-binding  40.16 
 
 
400 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.236058 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2360  monooxygenase, FAD-binding protein  39.84 
 
 
400 aa  224  3e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.175962  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2407  monooxygenase, FAD-binding  39.84 
 
 
400 aa  224  3e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.254272 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2424  monooxygenase FAD-binding protein  42.4 
 
 
393 aa  221  1.9999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.127723  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7249  monooxygenase FAD-binding  39.16 
 
 
377 aa  216  7e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8153  monooxygenase FAD-binding protein  39.62 
 
 
424 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11286  hypothetical protein  40 
 
 
372 aa  208  2e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3990  monooxygenase FAD-binding  38.34 
 
 
415 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.842303  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5927  monooxygenase FAD-binding protein  38.61 
 
 
400 aa  205  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4005  monooxygenase FAD-binding  39.95 
 
 
396 aa  204  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.888605  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3006  monooxygenase FAD-binding protein  35.94 
 
 
404 aa  201  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00211074 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26790  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  39 
 
 
398 aa  200  3.9999999999999996e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15237  normal  0.462192 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1283  monooxygenase FAD-binding protein  39.31 
 
 
403 aa  198  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000514503 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4249  monooxygenase FAD-binding  35.39 
 
 
370 aa  197  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2496  putative oxidoreductase  38.86 
 
 
374 aa  196  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0387  monooxygenase FAD-binding  35.25 
 
 
402 aa  195  1e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4470  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 
371 aa  193  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3917  putative oxidoreductase  36.34 
 
 
397 aa  189  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280043  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0549  monooxygenase FAD-binding  33.6 
 
 
380 aa  189  5.999999999999999e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.554692  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2957  monooxygenase FAD-binding  32.97 
 
 
372 aa  182  6e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  hitchhiker  0.00000079656 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10960  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  38.02 
 
 
403 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3005  monooxygenase FAD-binding  40.17 
 
 
411 aa  179  9e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10585  hypothetical protein  37.33 
 
 
388 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000190201  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01821  FAD-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07040)  34.82 
 
 
423 aa  174  2.9999999999999996e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00520599  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0385  hypothetical protein  37.06 
 
 
391 aa  171  3e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5899  monooxygenase FAD-binding  36.36 
 
 
398 aa  168  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196665 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0135  monooxygenase FAD-binding  38.02 
 
 
400 aa  166  8e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2116  monooxygenase FAD-binding protein  32.07 
 
 
384 aa  165  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.400145  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5428  hypothetical protein  36.18 
 
 
394 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235903 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0093  flavoprotein monooxygenase  35.79 
 
 
467 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2729  hypothetical protein  32.44 
 
 
415 aa  162  9e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0724  monooxygenase FAD-binding  36.34 
 
 
408 aa  161  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.30015 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2591  hypothetical protein  35.33 
 
 
389 aa  154  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000360209  hitchhiker  0.000709187 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1462  monooxygenase FAD-binding  32.28 
 
 
390 aa  154  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000001589  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2036  monooxygenase FAD-binding  33.42 
 
 
388 aa  141  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3892  monooxygenase FAD-binding protein  32.6 
 
 
396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.116118  normal  0.359829 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5341  monooxygenase FAD-binding protein  30.63 
 
 
418 aa  138  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1253  monooxygenase, FAD-binding  32.43 
 
 
388 aa  124  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420129  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1494  monooxygenase, FAD-binding  31.47 
 
 
386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.379752  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4094  FAD dependent oxidoreductase  31.09 
 
 
413 aa  119  7.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.232539  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1142  monooxygenase FAD-binding  32.71 
 
 
388 aa  119  9e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000665044 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0299  monooxygenase  33.23 
 
 
351 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4701  putative oxidoreductase transmembrane protein  31.33 
 
 
381 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105263  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4777  monooxygenase FAD-binding protein  30.45 
 
 
496 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.712751  hitchhiker  0.00463722 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4339  monooxygenase FAD-binding  31.29 
 
 
434 aa  106  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5767  putative oxidoreductase transmembrane protein  31.9 
 
 
405 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117987  normal  0.249872 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4615  monooxygenase FAD-binding  30.43 
 
 
392 aa  101  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.992897  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1977  monooxygenase FAD-binding protein  30.13 
 
 
393 aa  100  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0000420901  unclonable  0.000000044053 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1265  monooxygenase FAD-binding protein  32.21 
 
 
396 aa  100  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.717662  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1730  monooxygenase, FAD-binding  29.17 
 
 
395 aa  87  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.569431  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3438  monooxygenase, FAD-binding  33.82 
 
 
399 aa  84.3  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  31.78 
 
 
376 aa  82.4  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  31.38 
 
 
376 aa  79.3  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28690  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  31.64 
 
 
387 aa  78.2  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  29.73 
 
 
404 aa  77  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  27.96 
 
 
396 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2471  monooxygenase FAD-binding  27.2 
 
 
373 aa  77  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2964  monooxygenase FAD-binding  28.73 
 
 
422 aa  74.7  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000808449 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  30.2 
 
 
377 aa  73.6  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  27.64 
 
 
377 aa  70.9  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3463  monooxygenase FAD-binding protein  29.55 
 
 
376 aa  70.9  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.039982  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  28.32 
 
 
377 aa  69.7  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1889  hypothetical protein  26.26 
 
 
374 aa  69.3  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6603  monooxygenase FAD-binding protein  31.21 
 
 
400 aa  68.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145948  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0859  hypothetical protein  27.73 
 
 
376 aa  67.4  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4828  hypothetical protein  31.41 
 
 
376 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.454319 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1684  monooxygenase, FAD-binding  31.31 
 
 
373 aa  67  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.750023  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  28.38 
 
 
397 aa  65.1  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0514  hypothetical protein  28.41 
 
 
421 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.472933  normal  0.467939 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0321  hypothetical protein  28.42 
 
 
414 aa  64.7  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0960  monooxygenase, FAD-binding  24.72 
 
 
368 aa  63.5  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234631  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  26.97 
 
 
371 aa  62.4  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0304  hypothetical protein  27.74 
 
 
361 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.741519  normal  0.196732 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0950  monooxygenase, FAD-binding  24.72 
 
 
368 aa  62.8  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4602  monooxygenase FAD-binding  28.72 
 
 
382 aa  61.6  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296431  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2329  hypothetical protein  25.07 
 
 
374 aa  60.8  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2372  hypothetical protein  25.07 
 
 
374 aa  60.8  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1438  monooxygenase, FAD-binding  27.4 
 
 
413 aa  60.5  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00120206  hitchhiker  0.00122057 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  25.22 
 
 
385 aa  60.5  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5376  hypothetical protein  26.46 
 
 
438 aa  59.7  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5387  hypothetical protein  26.99 
 
 
420 aa  58.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0503  monooxygenase FAD-binding  27.68 
 
 
376 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6034  monooxygenase FAD-binding protein  28.5 
 
 
489 aa  58.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.829011  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4844  monooxygenase, FAD-binding protein  27.64 
 
 
390 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  29.85 
 
 
379 aa  58.2  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6172  hypothetical protein  30.23 
 
 
417 aa  57.4  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.272957 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0568  monooxygenase FAD-binding  28.25 
 
 
376 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0125  monooxygenase FAD-binding  26.34 
 
 
374 aa  57.4  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3547  hypothetical protein  27.56 
 
 
374 aa  57  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1936  hypothetical protein  27.11 
 
 
376 aa  57  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  24.63 
 
 
385 aa  56.6  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>