240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0320 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0320  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  603  1.0000000000000001e-171  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  29.27 
 
 		 317 aa  122  8e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05410  predicted permease, DMT superfamily  27.36 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.41466  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0911  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.93 
 
 		 294 aa  102  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0168694  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  25.77 
 
 		 294 aa  99  9e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.17 
 
 		 309 aa  95.5  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  24.76 
 
 		 315 aa  94.4  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1985  hypothetical protein  26.17 
 
 		 294 aa  91.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.01 
 
 		 289 aa  90.1  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1399  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.68 
 
 		 300 aa  86.3  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.73 
 
 		 323 aa  85.9  9e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0039  hypothetical protein  27.76 
 
 		 290 aa  85.9  9e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.34 
 
 		 317 aa  82.4  0.000000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  25.35 
 
 		 297 aa  82  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.14 
 
 		 295 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  25.57 
 
 		 302 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.14 
 
 		 293 aa  79.3  0.00000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0149413 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2856  hypothetical protein  21.51 
 
 		 288 aa  75.1  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.566948  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0427  hypothetical protein  23.4 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.38 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0438  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.51 
 
 		 316 aa  72.8  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.29 
 
 		 299 aa  71.6  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1785  DMT family permease  25.25 
 
 		 297 aa  69.3  0.00000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000100378  hitchhiker  2.8549e-18 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1055  hypothetical protein  25.24 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  23.4 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.99 
 
 		 297 aa  67  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.51 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0919  hypothetical protein  22.44 
 
 		 305 aa  67  0.0000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4191  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.24 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.168223  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0465  hypothetical protein  24.73 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0969494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27470  predicted membrane protein  26.38 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0416  hypothetical protein  26.2 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.848373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  25 
 
 		 397 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1916  hypothetical protein  25.08 
 
 		 317 aa  63.5  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.594708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0969  hypothetical protein  23.48 
 
 		 402 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1571  hypothetical protein  23.75 
 
 		 303 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.358849 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0003  hypothetical protein  24.21 
 
 		 288 aa  62  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0184186  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1932  hypothetical protein  24.35 
 
 		 356 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248782  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1021  hypothetical protein  24.35 
 
 		 356 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0844  hypothetical protein  24.35 
 
 		 356 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.338271  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0304  hypothetical protein  24.35 
 
 		 356 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.457394  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  23.83 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  25.71 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0341  hypothetical protein  24.91 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1174  hypothetical protein  23.91 
 
 		 353 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  23.51 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  23.32 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1835  EamA family protein  23.15 
 
 		 322 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.749092  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.68 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  23.67 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1335  transporter  23.91 
 
 		 356 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.324235  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0787  hypothetical protein  22.3 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0809288  hitchhiker  0.000526282 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0752  hypothetical protein  24.61 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0896915  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  22.26 
 
 		 317 aa  58.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1182  hypothetical protein  23.91 
 
 		 356 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.983056  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  23.49 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.58 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000349572  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25230  predicted permease, DMT superfamily  21.57 
 
 		 351 aa  57.4  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.66597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1892  transporter, EamA family  22.74 
 
 		 322 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0271761  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  24.74 
 
 		 316 aa  57  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1143  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.75 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0579  hypothetical protein  24.1 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0045  carboxylate/amino acid/amine transporter  23.58 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1667  DMT family permease  26.2 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000699147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1162  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.98 
 
 		 359 aa  55.8  0.0000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.902863 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3681  hypothetical protein  22.97 
 
 		 297 aa  55.8  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.60204  normal  0.770543 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0494  DMT family permease  25.24 
 
 		 308 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3346  hypothetical protein  23.01 
 
 		 331 aa  55.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1868  hypothetical protein  23.33 
 
 		 300 aa  55.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3614  integral membrane protein  28.64 
 
 		 321 aa  55.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4115  carboxylate/amino acid/amine transporter  24.03 
 
 		 299 aa  55.5  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.210953  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0739  integral membrane protein  23.51 
 
 		 308 aa  55.5  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0224771  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03543  predicted inner membrane protein  24.03 
 
 		 307 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  22.3 
 
 		 309 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1515  hypothetical protein  23.53 
 
 		 273 aa  54.3  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.910638  normal  0.799854 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.01 
 
 		 293 aa  54.7  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0040  carboxylate/amino acid/amine transporter  24.03 
 
 		 307 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  22.92 
 
 		 309 aa  55.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0857  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.15 
 
 		 285 aa  54.7  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  4.28203e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2866  hypothetical protein  24.06 
 
 		 293 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0944442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1854  hypothetical protein  23.81 
 
 		 305 aa  54.3  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.185322  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4167  carboxylate/amino acid/amine transporter  24.03 
 
 		 307 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03485  hypothetical protein  24.03 
 
 		 307 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4015  carboxylate/amino acid/amine transporter  23.7 
 
 		 307 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.972202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3872  carboxylate/amino acid/amine transporter  24.03 
 
 		 307 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  23.45 
 
 		 287 aa  54.3  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0495  hypothetical protein  26.21 
 
 		 310 aa  54.3  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  23.26 
 
 		 309 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  23.26 
 
 		 309 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1095  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.74 
 
 		 282 aa  54.3  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000428638  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5085  carboxylate/amino acid/amine transporter  24.44 
 
 		 307 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.35072 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0645  EamA family protein  25.56 
 
 		 308 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1293  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.78 
 
 		 331 aa  52.8  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.26 
 
 		 321 aa  52.8  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  22.4 
 
 		 312 aa  52.8  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.45 
 
 		 325 aa  52.4  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0707  transporter, EamA family  25.24 
 
 		 308 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1107  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.2 
 
 		 303 aa  52  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000007978  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1587  DMT family permease  25.24 
 
 		 304 aa  52  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000814807  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3514  membrane protein  21.1 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>