More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB05140 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001303  ANIA_04557  mitochondrial inner membrane AAA protease Yta12, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02680)  55.21 
 
 
883 aa  720    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82096  AAA+-type ATPase  55.88 
 
 
787 aa  686    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.176589  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05140  ATPase, putative  100 
 
 
817 aa  1645    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0164604  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34770  Mitochondrial respiratory chain complexes assembly protein RCA1 (TAT-binding homolog 12)  54.08 
 
 
867 aa  674    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00577984  normal  0.0143281 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3001  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.92 
 
 
676 aa  633  1e-180  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0623369  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0030  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.87 
 
 
696 aa  630  1e-179  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.876867  normal  0.384468 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0466  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.24 
 
 
673 aa  625  1e-177  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5040  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.95 
 
 
685 aa  622  1e-177  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0613  cell division protein, ATP-dependent metalloprotease  52.44 
 
 
692 aa  623  1e-177  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_23646  predicted protein  51.74 
 
 
648 aa  612  1e-173  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0232  hypothetical protein  51.79 
 
 
691 aa  610  1e-173  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16391  predicted protein  55.97 
 
 
590 aa  596  1e-169  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07931  putative transmembrane AAA-metalloprotease FtsH  50.75 
 
 
691 aa  583  1.0000000000000001e-165  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0836  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.43 
 
 
697 aa  580  1e-164  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473024  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1654  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.33 
 
 
652 aa  567  1e-160  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_13471  predicted protein  64.22 
 
 
476 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.155639  normal  0.170565 
 
 
-
 
NC_002950  PG0047  cell division protein FtsH, putative  44.77 
 
 
673 aa  555  1e-156  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2600  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.91 
 
 
641 aa  524  1e-147  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0081  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.08 
 
 
697 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.849156  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6194  FtsH-2 peptidase  54.49 
 
 
646 aa  515  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0100  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.57 
 
 
686 aa  510  1e-143  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.32 
 
 
639 aa  506  9.999999999999999e-143  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0078  peptidase M41, FtsH  52.57 
 
 
706 aa  508  9.999999999999999e-143  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0143352  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.84 
 
 
714 aa  507  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575929  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.84 
 
 
696 aa  508  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130847  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1947  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.43 
 
 
646 aa  503  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1921  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.43 
 
 
646 aa  503  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0007  peptidase M41, FtsH  50.1 
 
 
699 aa  504  1e-141  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0830  cell division protein FtsH3  51.77 
 
 
624 aa  501  1e-140  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0123  ATP-dependent metalloprotease FtsH  44.34 
 
 
699 aa  499  1e-140  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5877  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.57 
 
 
635 aa  496  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.943633  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13071  cell division protein FtsH3  51.66 
 
 
619 aa  497  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.208154 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.87 
 
 
694 aa  498  1e-139  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.4836  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1495  FtsH-2 peptidase  52.73 
 
 
635 aa  497  1e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.421707  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.49 
 
 
602 aa  498  1e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4385  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.1 
 
 
663 aa  496  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2158  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.52 
 
 
706 aa  498  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2066  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.31 
 
 
705 aa  496  1e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4517  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.1 
 
 
663 aa  496  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.723361  normal  0.670531 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1487  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.63 
 
 
666 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.643997  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0074  FtsH-2 protease  52.54 
 
 
917 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00600041  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19161  cell division protein FtsH3  52.36 
 
 
625 aa  494  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.134422 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14491  cell division protein FtsH3  51.47 
 
 
620 aa  495  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2678  FtsH-2 peptidase  51.28 
 
 
694 aa  494  9.999999999999999e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1574  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.53 
 
 
666 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580758  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2043  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.39 
 
 
687 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000823852 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1040  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.63 
 
 
666 aa  492  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.643588  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0389  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.63 
 
 
666 aa  492  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185048  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1483  peptidase M41, FtsH  51.76 
 
 
629 aa  490  1e-137  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.45624  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0023  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.54 
 
 
852 aa  492  1e-137  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.16452  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1194  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.63 
 
 
666 aa  492  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.256631  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1298  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.13 
 
 
662 aa  489  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231073  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1774  FtsH-2 peptidase  52.31 
 
 
702 aa  490  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.517267  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6211  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.04 
 
 
635 aa  490  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156837  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1901  FtsH-2 peptidase  51.41 
 
 
659 aa  491  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3197  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.59 
 
 
647 aa  491  1e-137  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.68 
 
 
630 aa  487  1e-136  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16831  cell division protein FtsH3  51.57 
 
 
635 aa  487  1e-136  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5195  FtsH-2 peptidase  51.41 
 
 
627 aa  487  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7802  cell division protein  51.21 
 
 
630 aa  486  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120789  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2011  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.52 
 
 
639 aa  486  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.15 
 
 
615 aa  486  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14631  cell division protein FtsH3  51.27 
 
 
620 aa  482  1e-135  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.336719  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  50.5 
 
 
608 aa  485  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5863  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.64 
 
 
658 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0798132  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4937  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.12 
 
 
623 aa  484  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206394  normal  0.640617 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4465  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.1 
 
 
610 aa  479  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1990  ATP-dependent metalloprotease FtsH  42.2 
 
 
659 aa  481  1e-134  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.144891  normal  0.186322 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2383  FtsH peptidase  49.33 
 
 
639 aa  481  1e-134  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2611  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.33 
 
 
642 aa  481  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728917  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0879  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.4 
 
 
629 aa  479  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.200568  normal  0.0679699 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1520  FtsH-2 peptidase  52.43 
 
 
692 aa  481  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428329  normal  0.402433 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.23 
 
 
620 aa  479  1e-134  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0925  FtsH-2 peptidase  51.95 
 
 
624 aa  482  1e-134  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.610523 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2617  FtsH peptidase  48.76 
 
 
641 aa  481  1e-134  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258853  normal  0.61812 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4925  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.86 
 
 
640 aa  481  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147921  normal  0.185615 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14251  cell division protein FtsH3  50.88 
 
 
620 aa  480  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.520813  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.62 
 
 
638 aa  481  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642505  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4181  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50 
 
 
676 aa  481  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2852  membrane protease FtsH catalytic subunit  48.33 
 
 
640 aa  481  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3924  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.43 
 
 
658 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.888764  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1475  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.33 
 
 
639 aa  481  1e-134  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3874  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.7 
 
 
655 aa  480  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.173142 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4443  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.43 
 
 
658 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.165692  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0063  cell division protein FtsH  49.41 
 
 
633 aa  476  1e-133  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0064  cell division protein FtsH  49.21 
 
 
633 aa  476  1e-133  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0060  cell division protein  49.21 
 
 
633 aa  476  1e-133  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0060  cell division protein  49.21 
 
 
633 aa  476  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.527958  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1839  cell division protein ftsH (ATP-dependent zinc-metallo protease)  48.95 
 
 
618 aa  478  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.651552 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02180  membrane protease FtsH catalytic subunit  49.04 
 
 
759 aa  477  1e-133  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.203861  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.8 
 
 
639 aa  477  1e-133  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0064  cell division protein FtsH  49.21 
 
 
633 aa  476  1e-133  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550597  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4334  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.7 
 
 
655 aa  479  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530372  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1314  FtsH-2 peptidase  49.9 
 
 
623 aa  478  1e-133  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.997053  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0073  cell division protein FtsH  49.21 
 
 
633 aa  476  1e-133  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.755624 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0076  cell division protein FtsH  49.21 
 
 
633 aa  476  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0454651  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0072  cell division protein FtsH  51.59 
 
 
633 aa  476  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.12055  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3570  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.25 
 
 
673 aa  477  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2543  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.25 
 
 
673 aa  477  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0426  FtsH peptidase  50 
 
 
652 aa  478  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.405966  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>