142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0430 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0430  alpha-tubulin suppressor  100 
 
 
807 aa  1625    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  37.83 
 
 
821 aa  436  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1101  alpha-tubulin suppressor  32.94 
 
 
911 aa  400  9.999999999999999e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  36.48 
 
 
818 aa  397  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  43.24 
 
 
1679 aa  308  2.0000000000000002e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  32.22 
 
 
2082 aa  300  1e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  32.11 
 
 
717 aa  295  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  39.63 
 
 
461 aa  280  7e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  29.9 
 
 
714 aa  266  8e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  40.49 
 
 
461 aa  265  4e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  29.93 
 
 
743 aa  261  4e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  39.94 
 
 
1919 aa  237  5.0000000000000005e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  37.47 
 
 
547 aa  221  3.9999999999999997e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0960  BNR repeat-containing protein  42.96 
 
 
449 aa  209  2e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0736661  normal  0.223675 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  27.81 
 
 
792 aa  203  9e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0668  regulator of chromosome condensation RCC1  27.36 
 
 
784 aa  193  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000606887  hitchhiker  0.00000503803 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  27.88 
 
 
778 aa  193  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  27.34 
 
 
776 aa  185  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000957147  hitchhiker  0.000042388 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0421  regulator of chromosome condensation, RCC1  25.52 
 
 
837 aa  183  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0560026 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1394  immunoglobulin I-set domain-containing protein  27.74 
 
 
1126 aa  181  7e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  31.94 
 
 
1129 aa  175  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  32.2 
 
 
469 aa  173  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2892  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  32.41 
 
 
835 aa  171  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  27.97 
 
 
1222 aa  157  8e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4565  hypothetical protein  33.76 
 
 
477 aa  152  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  30.79 
 
 
1848 aa  152  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1923  regulator of chromosome condensation, RCC1  38.28 
 
 
692 aa  152  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.611736  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  31.45 
 
 
363 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_89498  predicted protein  40.51 
 
 
376 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.034274  normal  0.0389123 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1792  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.62 
 
 
417 aa  148  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  31.45 
 
 
363 aa  149  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1979  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.05 
 
 
554 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2567  regulator of chromosome condensation, RCC1  29.87 
 
 
555 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4499  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.61 
 
 
553 aa  142  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243819  hitchhiker  0.00250831 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1539  regulator of chromosome condensation RCC1  31 
 
 
569 aa  142  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781451  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2349  cell wall anchor domain-containing protein  27.96 
 
 
551 aa  141  4.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.0247307 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1072  regulator of chromosome condensation RCC1  30.86 
 
 
553 aa  140  7e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0600576  decreased coverage  0.000288682 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2978  regulator of chromosome condensation, RCC1  28.97 
 
 
561 aa  140  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4383  regulator of chromosome condensation RCC1  36.48 
 
 
546 aa  140  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.843021  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  31.17 
 
 
593 aa  139  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2977  regulator of chromosome condensation RCC1  29.29 
 
 
579 aa  138  4e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4652  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.75 
 
 
555 aa  137  8e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197342  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1538  regulator of chromosome condensation RCC1  32.78 
 
 
560 aa  137  9e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0161  alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing proteins-like protein  29.68 
 
 
726 aa  134  5e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1179  cell wall anchor domain-containing protein  35.43 
 
 
558 aa  134  6.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1585  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.05 
 
 
570 aa  133  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179205  normal  0.90186 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1176  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.14 
 
 
567 aa  132  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308067  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  26.55 
 
 
706 aa  131  6e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1007  regulator of chromosome condensation RCC1  30.92 
 
 
443 aa  130  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1715  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.81 
 
 
563 aa  130  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1729  regulator of chromosome condensation RCC1  36.4 
 
 
681 aa  129  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.378302 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06370  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  29.25 
 
 
737 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.688875  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4380  regulator of chromosome condensation RCC1  30.03 
 
 
554 aa  129  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000261598 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5721  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  32.33 
 
 
810 aa  127  7e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1193  cell wall anchor domain-containing protein  30.99 
 
 
577 aa  127  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4382  regulator of chromosome condensation, RCC1  29.22 
 
 
556 aa  125  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0168  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  26.44 
 
 
817 aa  116  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.638374 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1010  immunoglobulin-like  27.8 
 
 
597 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4451  serine/threonine protein kinase  29.71 
 
 
745 aa  116  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5337  regulator of chromosome condensation RCC1  34.75 
 
 
618 aa  115  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1593  regulator of chromosome condensation RCC1  27.89 
 
 
558 aa  110  8.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107683  decreased coverage  0.00113997 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2272  putative lipoprotein  28.76 
 
 
403 aa  110  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2802  regulator of chromosome condensation RCC1  28.94 
 
 
389 aa  110  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0169  regulator of chromosome condensation RCC1  23.32 
 
 
1207 aa  109  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.26578 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06510  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  25.46 
 
 
900 aa  105  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10191  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1086  cell wall anchor domain-containing protein  32.67 
 
 
566 aa  105  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.628609  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4142  regulator of chromosome condensation RCC1  25.96 
 
 
575 aa  103  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1101  regulator of chromosome condensation RCC1  24.46 
 
 
1187 aa  100  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36955  predicted protein  27.27 
 
 
418 aa  99.4  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000048809  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3493  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  22.63 
 
 
921 aa  99  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00348376  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4027  regulator of chromosome condensation RCC1  29.36 
 
 
638 aa  97.1  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_3182  predicted protein  29.01 
 
 
341 aa  95.5  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3514  BNR repeat-containing protein  31.25 
 
 
396 aa  94.7  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3566  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  20.86 
 
 
728 aa  89.7  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000426417  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_2338  predicted protein  26.69 
 
 
399 aa  87.8  7e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.244715  decreased coverage  0.000248727 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3078  cysteine-rich repeat protein  26.93 
 
 
602 aa  87.8  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1102  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  24.06 
 
 
787 aa  86.7  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_4661  predicted protein  25 
 
 
328 aa  85.1  0.000000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0235224  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1230  regulator of chromosome condensation  27.34 
 
 
558 aa  84.3  0.000000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2677  regulator of chromosome condensation RCC1  24.87 
 
 
544 aa  82.8  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0824266  normal  0.249754 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3372  regulator of chromosome condensation RCC1  30.05 
 
 
375 aa  82.4  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.582545  normal  0.977781 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28587  predicted protein  26.42 
 
 
332 aa  81.6  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_45032  predicted protein  24.76 
 
 
1312 aa  81.3  0.00000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0983  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  25.18 
 
 
1147 aa  80.9  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.657675  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6709  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  26.46 
 
 
535 aa  80.5  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93763 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4469  Fibronectin type III domain protein  27.48 
 
 
624 aa  79  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1395  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  24.67 
 
 
941 aa  79.3  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28035  predicted protein  26.81 
 
 
371 aa  78.2  0.0000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00114793  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0110  putative lipoprotein  25.41 
 
 
1408 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37043  predicted protein  25.65 
 
 
643 aa  73.9  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49595  predicted protein  22.88 
 
 
643 aa  73.2  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.107678  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0016  regulator of chromosome condensation, RCC1  36.23 
 
 
209 aa  71.6  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0835  regulator of chromosome condensation, RCC1  27.24 
 
 
454 aa  71.6  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000342625  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50520  predicted protein  23.29 
 
 
657 aa  71.2  0.00000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2561  regulator of chromosome condensation RCC1  40.51 
 
 
106 aa  70.9  0.00000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.111508  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41011  predicted protein  23.85 
 
 
727 aa  69.3  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65479  pheromone response pathway  24.6 
 
 
499 aa  68.6  0.0000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.349403 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0373  alpha-tubulin suppressor and related RCC1domain-containing protein  26.55 
 
 
307 aa  68.2  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000297826  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3336  alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein  24.81 
 
 
787 aa  67.4  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0329371  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  27.16 
 
 
2816 aa  65.9  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>