More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1223 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1223  signal-transduction sensor protein  100 
 
 
189 aa  394  1e-109  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.658782  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2525  putative PAS/PAC sensor protein  46.01 
 
 
208 aa  170  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0659487  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2936  putative PAS/PAC sensor protein  45.03 
 
 
201 aa  168  5e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.178135  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1521  putative PAS/PAC sensor protein  46.39 
 
 
228 aa  164  5.9999999999999996e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.950455  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1522  PAS sensor protein  43.37 
 
 
225 aa  159  2e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.533099  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0158  PAS sensor protein  45.83 
 
 
170 aa  159  3e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00559927  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1393  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.85 
 
 
182 aa  157  7e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1964  putative PAS/PAC sensor protein  42.77 
 
 
229 aa  155  3e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.705516  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1378  putative PAS/PAC sensor protein  36.27 
 
 
200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1413  putative PAS/PAC sensor protein  43.64 
 
 
185 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.026067  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4009  PAS  46.62 
 
 
172 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0368  PAS sensor protein  43.4 
 
 
168 aa  145  3e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.580475  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4662  putative PAS/PAC sensor protein  42.17 
 
 
168 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.193201 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3403  PAS sensor protein  39.43 
 
 
189 aa  141  5e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263742  normal  0.531721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4683  putative PAS/PAC sensor protein  40.94 
 
 
173 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0920  putative PAS/PAC sensor protein  43.83 
 
 
170 aa  140  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1233  methyl-accepting chemotaxis protein  40.24 
 
 
166 aa  139  3e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1012  methyl-accepting chemotaxis protein  41.51 
 
 
171 aa  137  8.999999999999999e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.63093  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1962  methyl-accepting chemotaxis protein  44 
 
 
166 aa  137  1e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1312  putative PAS/PAC sensor protein  41.86 
 
 
174 aa  135  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.723682  normal  0.171791 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2378  transcriptional regulator  40.57 
 
 
174 aa  134  8e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4975  putative PAS/PAC sensor protein  37.58 
 
 
178 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161434  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1196  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.62 
 
 
522 aa  131  5e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3519  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  48 
 
 
514 aa  130  9e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3240  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.46 
 
 
533 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4977  putative PAS/PAC sensor protein  39.31 
 
 
177 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13761  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0995  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.48 
 
 
517 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3097  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.88 
 
 
522 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1071  putative PAS/PAC sensor protein  39.18 
 
 
178 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  44.88 
 
 
522 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.160306 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2812  putative PAS/PAC sensor protein  43.08 
 
 
166 aa  128  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.494423  decreased coverage  0.000000324615 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3087  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.67 
 
 
522 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2891  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  42.97 
 
 
522 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  42.97 
 
 
522 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3908  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.95 
 
 
174 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4792  putative PAS/PAC sensor protein  40.12 
 
 
174 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2987  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  42.97 
 
 
522 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1325  methyl-accepting chemotaxis protein  39.63 
 
 
164 aa  125  3e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0735034  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05500  PAS domain S-box  39.02 
 
 
194 aa  125  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.414164  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3023  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  42.86 
 
 
514 aa  125  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1206  methyl-accepting chemotaxis protein  39.02 
 
 
164 aa  124  6e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1385  methyl-accepting chemotaxis protein  42.86 
 
 
520 aa  124  6e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3464  transcriptional regulator  40.94 
 
 
174 aa  124  7e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03711  methyl-accepting chemotaxis transducer transmembrane protein  41.73 
 
 
529 aa  124  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.784638  normal  0.611118 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3595  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.48 
 
 
515 aa  124  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2233  putative PAS/PAC sensor protein  39.18 
 
 
177 aa  122  3e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.17522 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0964  putative PAS domain signal transduction sensor protein  39.88 
 
 
163 aa  122  4e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.695373  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2577  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  40.29 
 
 
524 aa  121  5e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3951  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  40.15 
 
 
529 aa  121  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.226395  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  40.15 
 
 
529 aa  121  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0659  putative PAS/PAC sensor protein  41.73 
 
 
164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0044  putative PAS/PAC sensor protein  38.82 
 
 
162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1204  methyl-accepting chemotaxis protein  37.82 
 
 
165 aa  119  3e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1323  methyl-accepting chemotaxis protein  37.82 
 
 
165 aa  119  3e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0540  methyl-accepting chemotaxis protein  38.85 
 
 
166 aa  119  3.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  43.31 
 
 
716 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02941  fused signal transducer for aerotaxis sensory component/methyl accepting chemotaxis component  42.86 
 
 
506 aa  118  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0629  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  42.86 
 
 
506 aa  118  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02891  hypothetical protein  42.86 
 
 
506 aa  118  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3253  aerotaxis receptor  42.86 
 
 
506 aa  118  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3527  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.52 
 
 
506 aa  118  6e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.538358 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24380  aerotaxis receptor Aer  40.16 
 
 
567 aa  117  7.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0650163  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2113  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  42.22 
 
 
550 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0264  methyl-accepting chemotaxis protein  44.07 
 
 
580 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2685  methyl-accepting chemotaxis protein  44.07 
 
 
580 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.394636  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0927  methyl-accepting chemotaxis protein  44.07 
 
 
623 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0602  methyl-accepting chemotaxis protein  41.35 
 
 
536 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0749  aerotaxis sensor receptor  44.07 
 
 
669 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0760  aerotaxis sensor receptor  44.07 
 
 
583 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1933  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  42.86 
 
 
598 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2022  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  41.67 
 
 
748 aa  117  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2473  methyl-accepting chemotaxis protein  44.07 
 
 
580 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2390  methyl-accepting chemotaxis protein  44.07 
 
 
580 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.790589  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5601  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  35.12 
 
 
551 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.510218  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4385  aerotaxis receptor  42.11 
 
 
506 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.472426  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3538  aerotaxis receptor  42.11 
 
 
506 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.840702  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3508  aerotaxis receptor  42.11 
 
 
506 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0628  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  42.11 
 
 
506 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3366  aerotaxis receptor  42.11 
 
 
506 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.775088  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1897  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  40.91 
 
 
1170 aa  115  3e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1618  chemotaxis sensory transducer  42.52 
 
 
557 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.126465 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0618  methyl-accepting chemotaxis protein  43.22 
 
 
583 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000496  methyl-accepting chemotaxis protein  42.55 
 
 
520 aa  115  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0232366  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1652  putative PAS/PAC sensor protein  43.65 
 
 
127 aa  114  6.9999999999999995e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.129926  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3573  aerotaxis receptor  41.6 
 
 
506 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0352648  normal  0.227962 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3407  aerotaxis receptor  41.6 
 
 
506 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3403  aerotaxis receptor  41.6 
 
 
506 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1324  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  42.22 
 
 
523 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.587106  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3477  aerotaxis receptor  40.8 
 
 
506 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06258  hypothetical protein  39.85 
 
 
520 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1363  PAS  40.88 
 
 
544 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000284571 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3511  aerotaxis receptor  40.8 
 
 
506 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000402751 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2648  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  34.81 
 
 
520 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3460  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.46 
 
 
520 aa  112  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3109  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.67 
 
 
522 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0974  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.59 
 
 
532 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2125  methyl-accepting chemotaxis protein  38.56 
 
 
514 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1779  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  43.9 
 
 
517 aa  111  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3270  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.57 
 
 
532 aa  111  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.415489  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0262  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.13 
 
 
524 aa  111  6e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>